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Barriers to immunization in the Dominican Republic and COVID-19

RESUMEN En los últimos años la República Dominicana ha experimentado una importante reducción en las coberturas de vacunación, producto de esta situación son los casos de tétanos y difteria que han surgido recientemente. Con el objetivo de identificar las barreras para la inmunización y determinar el impacto de la COVID-19 en la adherencia a la vacunación, 2.584 dominicanos completaron una encuesta en línea sobre el historial de vacunación personal y las razones para no vacunarse. Además, respondieron preguntas sobre la aceptación de la vacuna contra la COVID-19 y la influencia de la pandemia en su percepción/adherencia a la vacunación. La mayoría de los encuestados no se vacunó durante la pandemia, el principal motivo fue: “no tenía ninguna vacuna programada para este año”. Lo que indica que a pesar de que la pandemia dificultó el acceso a los servicios de vacunación, esta no fue la principal barrera para la inmunización en República Dominicana en el 2020. A pesar de que la mayoría de los participantes están a favor de la vacunación, de las vacunas incluidas en nuestro estudio, la vacuna contra sarampión, rubéola y parotiditis (en niños) fue la única que alcanzó el objetivo del Plan de Acción Mundial sobre Vacunas, de lograr una cobertura de vacunación del 90% para el 2020. La principal barrera para la inmunización es el olvido de vacunarse. Es necesario adoptar un sistema de recordatorio eficaz para aumentar la adherencia y mejorar las tasas de inmunización.

ABSTRACT In recent years, the Dominican Republic has experienced a significant reduction in vaccination coverage; cases of tetanus and diphtheria that have recently emerged are a result of this situation. In order to identify barriers to immunization and determine the impact of COVID-19 on vaccination adherence, 2,584 Dominicans completed an online survey on personal vaccination history and reasons for not getting vaccinated. In addition, they answered questions about the acceptance of the COVID-19 vaccine and the influence of the pandemic on their perception/adherence to vaccination. Most of those surveyed were not vaccinated during the pandemic, the main reason being: "I had no vaccination scheduled for this year." This indicates that even though the pandemic made it difficult to access vaccination services, this was not the main barrier to immunization in the Dominican Republic in 2020. Despite the fact that most of the participants are in favor of vaccination, of the vaccines included in our study, the only one that reached the goal of the Global Vaccine Action Plan of achieving 90% vaccination coverage by 2020 was measles, mumps and rubella in children. The main barrier to immunization is forgetting to get vaccinated. It is necessary to adopt an effective reminder system to increase adherence and improve immunization rates.

COVID-19 rapid test validation. Isla de la Juventud, Cuba

RESUMEN Contar con métodos diagnósticos que reúnan ciertos atributos es vital para guiar las decisiones sanitarias, el contexto actual lo amerita. Con el objetivo de validar la capacidad de dos pruebas rápidas para detectar anticuerpos debido a la infección por SARS-CoV-2 en la Isla de la Juventud, Cuba, de abril a mayo de 2020, se realizó un estudio descriptivo de corte transversal de evaluación de pruebas rápidas: Wondfo (SARS-CoV-2 antibody test) y Lungene covid-19 IgG/IgM rapid test, en comparación con la prueba de reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real. Se construyeron dos muestras homogéneas de 250 cada una, determinándose indicadores de validación. Se obtuvieron valores de sensibilidad de 6,6% y 8,3% respectivamente para cada prueba, mientras que la especificidad resultó superior para Wondfo (95%). Los valores predictivos positivos resultaron muy bajos, los negativos adecuados, superior en Lungene con el 94,8%. Los valores de razón de verosimilitud fueron clasificados como inútiles. En diferentes escenarios en cuanto a casos sintomáticos, se alcanzó sensibilidad del 50% en intervalo de 1 a 7 días para Wondfo. El área bajo la curva ROC para Wondfo fue 0,50 (IC95%=0,46-0,55) y para Lungene 0,46 (IC95%=0,38-0,55). El índice kappa para Wondfo fue de 0,025 y 0,010 para Lungene. Las pruebas rápidas exploradas mostraron muy baja sensibilidad, valor predictivo positivo y razón de verosimilitud inadecuada. La validez global de las pruebas no demostró un buen desempeño diagnóstico, marcado por el valor del área bajo la curva ROC.

ABSTRACT Having diagnostic methods that meet certain attributes is vital to guide health decisions, the current context warrants it. In order to validate the capacity of two rapid tests to detect antibodies due to SARS-CoV-2 infection in Isla de la Juventud, Cuba, from April to May 2020, a descriptive cross-sectional evaluation study was carried out. Rapid tests: Wondfo (SARS-CoV-2 antibody test) and Lungene covid-19 IgG/IgM, were compared to the real-time polymerase chain reaction test. Two homogeneous samples of 250 each were constructed, determining validation indicators. Sensitivity values of 6.6% and 8.3% respectively were obtained for each test, while the specificity was higher for Wondfo (95%). The positive predictive values were very low, the negative ones were adequate, higher in Lungene with 94.8%. Likelihood ratio values were classified as useless. In different scenarios in terms of symptomatic cases, sensitivity of 50% was reached in an interval of 1 to 7 days for Wondfo. The area under the ROC curve for Wondfo was 0.50 (95% CI = 0.46-0.55) and 0.46 for Lungene (95%CI = 0.38-0.55). The kappa index for Wondfo was 0.025 and 0.010 for Lungene. The rapid tests explored showed very low sensitivity, positive predictive value, and inadequate likelihood ratio. The global validity of the tests did not demonstrate a good diagnostic performance, marked by the value of the area under the ROC curve. The degree of agreement was poor.

Assessment of immunization status and barriers to vaccination among the university students of Pakistan

ABSTRACT A cross-sectional study was conducted to determine the vaccination status and barriers to vaccination among the university students by utilizing a simple random sampling technique in the largest public sector university of Southern Punjab, Pakistan. The participants comprised 380 university students. Data was collected by a self-designed questionnaire. Statistical Package for Social Sciences (SPSS) was used for data analysis. Chi-square Test and Fischer Exact test were applied to assess the impact of demographics on vaccination status, and barriers to vaccination. Out of 380 participants, 328 (86.31%) were males and 52 (13.68) females. The immunization status of university students against various diseases was variable: 97.10% (n=369) were vaccinated against poliomyelitis, 58.68% (n=223) against BCG, 44.21% (n=168) against hepatitis B, 49.21% (n=187) against diphtheria, pertussis and tetanus and 55.26% (n=210) against measles vaccine. The barriers to vaccination were unwillingness 15.0% (n=57), inaccessibility 17.10% (n=65), financial issues 4.47 % (n=17) and unawareness 63.42% (n=241). Moreover, 31% (n=118) of the participants considered that the use of vaccines is unsafe. The vaccination status of the university students in Southern Punjab, Pakistan is alarming as most of the students were unvaccinated. The unawareness and perception of the unsafety of vaccines were the biggest barriers to vaccination.

RESUMEN Se realizó un estudio transversal para determinar el estado de vacunación y las barreras a la vacunación entre los estudiantes universitarios, mediante la utilización de una técnica de muestreo aleatorio simple, en la universidad más grande del sector público del sur de Punjab, Pakistán. Los participantes fueron 380 estudiantes universitarios. Los datos se recopilaron mediante un cuestionario de diseño propio. Se utilizó el Paquete Estadístico para Ciencias Sociales (SPSS) para el análisis de datos. Se aplicaron la prueba de chi-cuadrado y la prueba exacta de Fischer para evaluar el impacto de la demografía en el estado de vacunación y las barreras para la vacunación. De 380 participantes, 328 (86,31%) fueron hombres y 52 (13,68%) mujeres. El estado de inmunización de los estudiantes universitarios frente a diversas enfermedades fue variable: 97,10% (n = 369) fueron vacunados contra poliomielitis, 58,68% (n = 223) contra BCG, 44,21% (n = 168) contra hepatitis B, 49,21% (n = 187) contra la difteria, tos ferina y tétanos y 55,26% (n = 210) contra la vacuna contra el sarampión. Las barreras para la vacunación fueron la falta de voluntad 15,0% (n = 57); la inaccesibilidad 17,10% (n = 65); los problemas económicos 4,47% (n = 17) y el desconocimiento 63,42% (n = 241). Además, el 31% (n = 118) de los participantes consideró que el uso de vacunas no es seguro. El estado de vacunación de los estudiantes universitarios en el sur de Punjab, Pakistán, es alarmante ya que la mayoría de los estudiantes no estaban vacunados. El desconocimiento y la percepción de la inseguridad de las vacunas fueron las mayores barreras para la vacunación.

Association of IL-1β +3954 G>A and IL-6 -174 G/C polymorphisms in congenital toxoplasmosis

ABSTRACT Toxoplasmosis is caused by infection with the protozoan parasite Toxoplasma gondii, that has the capacity to infect all warm-blooded animals worldwide. The purpose of this investigation was to determine the distribution of genotypes and alleles in miscarriages woman as a result of Toxoplasma gondii infection associated with interleukin-1β and interleukin-6 polymorphisms. A total of 125 miscarriage women suspected of toxoplasma infection and 50 healthy pregnant without previous miscarriage as control were enrolled in this study. The cases were screened for anti-toxoplasma IgM and IgG by ELISA test. Among the 125 miscarriage women, only 50 were positive to anti-Toxoplasma gondii IgG and IgM antibodies. The present study focused on assay the genotypes at IL-6 -174 G/C and IL-1β +3954 G>A to establish the associations between genetic polymorphisms and infection with Toxoplasma gondii. Results showed that the altered IL-1β GA, AA genotypes were high significant elevated in miscarriage women with toxoplasmosis (P=0.03), OR = 10 and 95% confidence intervals (1.32-81.48); (P=0.0007), OR = 0.07 and 95% confidence interval (0.01-0.32). The genotype GC at IL-6 (G/C) appears to be highly correlated with infection (P=0.01); OR = 3.18 and 95% confidence interval, (1.22- 8.30). In terms of allelic heterogeneity, C alleles were significantly more common in infected than uninfected cases for IL-6, while A allele is common in IL-1β single nucleotide polymorphisms (P =0.050). Furthermore, this study demonstrates that there is a strong and highly significant association between two forms of single nucleotide polymorphisms and the increased risk for toxoplasmosis. Genotypes of these polymorphism should be considered when evaluating genetic eﬀects on toxoplasmosis incidence. However, to improve the prediction of this disease predisposition, a further study based on a larger cohort of patients is warranted.

RESUMEN La toxoplasmosis es causada por la infección con el parásito protozoario Toxoplasma gondii, que tiene la capacidad de infectar a todos los animales de sangre caliente en todo el mundo. El propósito de esta investigación fue determinar la distribución de genotipos y alelos en mujeres con abortos espontáneos como resultado de la infección por Toxoplasma gondii asociada con polimorfismos de interleucina 1β e interleucina 6. Se inscribieron en este estudio un total de 125 mujeres con aborto espontáneo sospechosas de infección por toxoplasma y 50 embarazadas sanas, sin aborto espontáneo previo, como control. Los casos se examinaron para detectar IgM e IgG anti-toxoplasma mediante la prueba ELISA. Entre las 125 mujeres que sufrieron un aborto espontáneo, solo 50 fueron positivas a anticuerpos IgG e IgM anti-Toxoplasma gondii. El presente estudio se centró en analizar los genotipos de IL-6-174 G/C e IL-1β +3954 G>A para establecer las asociaciones entre polimorfismos genéticos e infección por Toxoplasma gondii. Los resultados mostraron que los genotipos alterados de IL-1β GA, AA fueron significativamente elevados en mujeres con aborto espontáneo con toxoplasmosis (P = 0,03), OR = 10 e intervalos de confianza del 95% (1,32-81,48); (P = 0,0007), OR = 0,07 e intervalo de confianza del 95% (0,01-0,32). El genotipo GC de IL-6 (G/C) parece estar altamente correlacionado con la infección (P = 0.01); OR = 3,18 e intervalo de confianza del 95%, (1,22- 8,30). En términos de heterogeneidad alélica, los alelos C fueron significativamente más comunes en los casos infectados que en los no infectados para la IL-6, mientras que el alelo A es común en los polimorfismos de nucleótido simple de IL-1β (P = 0.050). Además, este estudio demuestra que existe una asociación fuerte y altamente significativa entre dos formas de polimorfismos nucleótido simple y el mayor riesgo de toxoplasmosis. Se deben considerar los genotipos de estos polimorfismos al evaluar los efectos genéticos sobre la incidencia de la toxoplasmosis. Sin embargo, para mejorar la predicción de esta predisposición a la enfermedad, se justifica un estudio adicional basado en una cohorte más grande de pacientes.

Nimotuzumab combined with GEMOX chemotherapy regimen in patients with advanced pancreatic cancer

RESUMEN Se realizó un estudio retrospectivo y observacional en pacientes con adenocarcinoma pancreático avanzado, tratados con Nimotuzumab combinado con un esquema de quimioterapia GEMOX, atendidos en el Servicio de Oncología Clínica del Hospital Clínico Quirúrgico Hermanos Ameijeiras entre 2013 y 2019 (n=118), cuyo objetivo fue evaluar la respuesta al tratamiento y la supervivencia global según variables clínicas, histopatológicas y tratamiento. Se utilizó método chi-cuadrado para la asociación de variables. Se evaluó la supervivencia global por el método de Kaplan Meier y se utilizó la prueba de Log-Rank y Breslow para la comparación de las curvas, con valor p<0.05. La tasa de control de la enfermedad fue 44,9. La mediana de supervivencia fue de 13,8 meses (IC95%:11,7-15,8). Las variables estadísticamente significativas asociadas con mayor respuesta al tratamiento y supervivencia fueron: no hábitos tabáquicos; índice plaquetas-linfocitos por debajo de 200; tumores primarios T2-T3, de localización predominantemente en cabeza pancreática; no presencia de metástasis al diagnóstico y más de seis dosis de quimioterapia o Nimotuzumab. Los pacientes con clasificación de bajo peso y albúmina sérica baja tuvieron peor supervivencia (p<0.05). En 42 pacientes se realizó una segunda línea de quimioterapia y se obtuvo supervivencia de 17,4 meses (IC95%:13,5-21,4). Las toxicidades clasificadas como grado 3-4 se reportaron en 27 pacientes (22,9%), las más frecuentemente observadas fueron: neuropatía (14,4%), neutropenia (10,2%) y trombopenia (9,3%). En condiciones de práctica clínica, con el Nimotuzumab combinado con quimioterapia GEMOX se obtuvieron óptimas tasas de control de la enfermedad y supervivencia con buen perfil de seguridad.

ABSTRACT A retrospective and observational study was carried out in patients with advanced pancreatic adenocarcinoma, treated with Nimotuzumab combined with a GEMOX chemotherapy scheme, in the Clinical Oncology Service at the Ameijeiras Hospital, between 2013 and 2019 (n =118), whose objective was to evaluate the response to the treatment and overall survival according to clinical, histopathological and treatment variables. The chi-square method was used for the association of variables. Overall survival was evaluated by the Kaplan Meier method and the Log-Rank and Breslow test for the comparison of the curves, with p <0.05. The disease control rate was 44.9. The median survival was 13.8 months (95% CI: 11.7-15.8). The statistically significant variables associated with greater response to treatment and survival were: no smoking habits; platelet-lymphocyte index below 200; T2-T3 primary tumors, predominantly located in the pancreatic head; no presence of metastases at diagnosis and greater than six doses of chemotherapy and Nimotuzumab. Patients classified as underweight and low serum albumin had worse survival (p <0.05). Second-line chemotherapy was performed in 42 patients and it was obtained SV of 17.4 months (95% CI: 13.5-21.4). Toxicities classified as grade 3-4 were reported in 27 patients (22.9%); the most frequently observed were: neuropathy (14.4%), neutropenia (10.2%) and thrombopenia (9.3%). Under clinical practice conditions, Nimotuzumab combined with GEMOX chemotherapy obtained optimal disease control and survival rates with a good safety profile.

COVID-19 vaccines: Development, strategies, types and vaccine usage hesitancy

ABSTRACT Vaccine development using different platforms is one of the important strategies to address coronavirus disease pandemic. The global need for vaccines requires effective vaccine approaches and collaboration between pharmaceutical and biotechnological companies, governments and the industrial and academic sectors. About 72% of the vaccine candidates are being developed by the private sector, while 28% are carried out by the public sector and different non-profit organizations. COVID-19 vaccines are based on complete viruses (inactivated or attenuated), viral vectors (replicating or not), antigenic subunits (proteins or peptides), nucleic acids (RNA or DNA) or virus-like particles. Important aspects of vaccine development include manufacturing flexibility, speed, cost, safety, cellular and humoral immunogenicity, vaccine stability and cold chain maintenance. Vaccines can be prepared using different manufacturing platforms, computational biology, gene synthesis, structure-based antigen design and protein engineering. Individual confidence, convenience and complacency are factors that affect the attitude towards acceptance of COVID-19 vaccination. This could be complicated by socio-demographic, psychologic, cognitive and cultural factors.

RESUMEN El desarrollo de vacunas utilizando diferentes plataformas es una de las estrategias importantes para abordar la pandemia de COVID-19. La necesidad mundial de vacunas requiere enfoques de vacunas eficaces y la colaboración entre las empresas farmacéuticas y biotecnológicas, los gobiernos y los sectores industrial y académico. Alrededor del 72% de los candidatos vacunales están siendo desarrolladas por el sector privado, mientras que el 28%, por el sector público y diferentes organizaciones sin fines de lucro. Las vacunas contra la COVID-19 se basan en virus completos (inactivados o atenuados), vectores virales (replicantes o no), subunidades antigénicas (proteínas o péptidos), ácidos nucleicos (ARN o ADN) o partículas similares a virus. Aspectos importantes del desarrollo de vacunas incluyen la flexibilidad de fabricación, la velocidad, el costo, la seguridad, la inmunogenicidad celular y humoral, la estabilidad de la vacuna y el mantenimiento de la cadena de frío. Las vacunas se pueden preparar con precisión utilizando diferentes plataformas de fabricación, biología computacional, síntesis de genes, diseño de antígenos basado en estructuras e ingeniería de proteínas. La confianza individual, la conveniencia y la complacencia son factores que afectan la actitud hacia la aceptación de la vacunación contra la COVID-19. Esto podría complicarse por factores sociodemográficos, psicológicos, cognitivos y culturales.

Uses of Pichia pastoris yeast in the production of recombinant proteins

RESUMEN La levadura metilotrófica Pichia pastoris (clasificada actualmente como Komagataella phaffii) es una de las más importantes para la producción de proteínas heterólogas. En el trabajo se presenta un análisis de las principales características que se ponen de manifiesto en la expresión de proteínas recombinantes expresadas en este microorganismo. Se describen las cepas disponibles para la transformación y producción de proteínas recombinantes expresadas en Pichia pastoris, los principales vectores comerciales para la expresión, los promotores más eficientes, los marcadores seleccionables, la señal de secreción, los métodos usados en las transformaciones genéticas y los patrones de glicosilación que se presentan. Se brindan recomendaciones generales acerca de los parámetros de bioprocesos como la composición del medio, el pH, la temperatura, la velocidad de aireación, la inducción y las estrategias de alimentación para alcanzar altos valores de productividad. Se presentan los resultados de las aplicaciones de Pichia pastoris en la producción de dos vacunas en Cuba, la vacuna contra la hepatitis B y la vacuna para el control de la garrapata.

ABSTRACT Pichia pastoris metylotrofic yeast (currently classified as Komagataella phaffii) is one of the most important yeast for the production of heterologous proteins. The work presents an analysis of the main characteristics that are marked in the production of recombinant proteins expressed in Pichia pastoris. It describes the strains available for the transformation and production of recombinant proteins expressed in P. pastoris, the main commercial vectors for expression, the most efficient promoters, selectable markers, the secretion signal, the methods used in genetic transformations and glycosylation patterns that occur. General recommendations are provided on bioprocess parameters such as media composition, pH, temperature, aeration velocity, induction, and feeding strategies to achieve high productivity values. The results of Pichia pastoris applications for the production of two vaccines in Cuba, the hepatitis B vaccine and the tick control vaccine are shown.