Revista Cubana de Medicina Tropical

Epidemiología de las aguas residuales: un desafío desde el ámbito ambiental y sanitario

RESUMEN Introducción: El SARS-CoV-2, agente etiológico de la pandemia de COVID-19, es un coronavirus que se transmite a través de las secreciones respiratorias y las gotitas de saliva de las personas infectadas por el virus. Estudios recientes muestran la presencia de ARN en heces, incluso cuando el agente viral ha desaparecido de las muestras respiratorias. Un evento que está ganando mucha atención, si tenemos en cuenta que las aguas residuales albergan una gran variedad de virus patógenos y la comunidad científica trata de descifrar el riesgo potencial que genera la transmisión del SARS-CoV-2 a través de las aguas residuales. Objetivo: conocer el enfoque de la epidemiología de aguas residuales o epidemiología basada en residuos, utilizada con éxito para la búsqueda y seguimiento de agentes virales clínicamente importantes y su consecuente información, para generar alertas tempranas de brotes en las comunidades. Metodología: se utilizaron las palabras claves “epidemiología de las aguas residuales”, SARS-CoV-2, “COVID-19”, “Coronavirus” y las bases de datos: Science direct, Scopus, PubMed, Clinical Key y Medline. Resultados: Es vital iniciar búsquedas activas de SARS-CoV-2, y sus principales variantes en medios acuáticos, constituyéndose estas matrices, como una esperanza en el control temprano no invasivo de la pandemia. Conclusiones: El uso de la epidemiología basada en aguas residuales como herramienta para estudiar el comportamiento del SARS-CoV-2 y sus variantes en las poblaciones ayudará a reducir el grado de diseminación de la enfermedad.

ABSTRACT Introduction: SARS-CoV-2, the etiological agent of the COVID-19 pandemic, is a coronavirus that is transmitted through respiratory secretions and saliva droplets of people infected with the virus. Recent studies show the presence of RNA in feces, even when the viral agent has disappeared from respiratory samples. An event that is gaining a lot of attention, if we take into account that wastewater harbors a wide variety of pathogenic viruses and the scientific community tries to decipher the potential risk generated by the transmission of SARS-CoV-2 through wastewater. Objective: Therefore, this review aims to know the approach of wastewater epidemiology or residue-based epidemiology, used successfully for the search and monitoring of clinically important viral agents and their consequent information, to generate early outbreak alerts in communities. Methodology: For this purpose, the keywords "epidemiology of wastewater", SARS-CoV-2, "COVID-19", "Coronavirus" and the databases: Science direct, Scopus, PubMed, Clinical Key and Medline were used. Results: It is vital to start active searches for SARS-CoV-2, and its main variants in aquatic environments. Constituting these matrices, as a hope in the non-invasive early control of the pandemic. Conclusions: The use of wastewater-based epidemiology as a tool to study the behavior of SARS-CoV-2 and its variants in populations will help reduce the degree of dissemination of the disease.

Síndrome hemorrágico asociado a contacto con Lonomia sp (Lepidoptera, Saturniidae) en Venezuela

RESUMEN Introducción: Entre los Lepidoptera, pertenecientes a la clase Insecta solo las formas larvales del género Lonomia pueden causar reacciones sistémicas en humanos. Hasta el momento, solo dos especies se han relacionado formalmente con accidentes por envenenamiento: Lonomia achelous y Lonomia obliqua. Su veneno está compuesto por proteínas, serina proteasas y otros componentes con actividad inflamatoria, procoagulante y hemolítica. Objetivo: Describir un caso de síndrome hemorrágico asociado a contacto con Lonomia achelous. Intentando así proveer información sobre una condición de gran relevancia clínica y sanitaria para la región de Latinoamérica. Caso clínico: Paciente de 12 años, proveniente de área rural, sin antecedentes familiares o personales de relevancia, quien posterior a contacto con oruga en antebrazo izquierdo, presentó dolor local, fiebre, hematomas en región submentoniana, extremidad superior derecha y en ambas extremidades inferiores. En analítica sanguínea, se evidenciaron tiempos de coagulación prolongados. Por lo que se consideró el diagnóstico accidente lonómico. Se administraron 2 unidades de plasma fresco congelado y ácido ε-aminocaproico, presentando mejoría clínica y analítica progresiva, con normalización de los parámetros de coagulación al quinto día de su ingreso. Conclusiones: Para su diagnóstico fue importante el cuadro clínico presentado por el paciente junto con la observación de la oruga. La administración de suero antilonómico es el tratamiento recomendado en Brasil, sin embargo, en este caso se obtuvieron buenos resultados con la administración de ácido ε-aminocaproico. Dada su presentación en diferentes países de Latinoamérica, es importante proveer de conocimiento a los profesionales de salud sobre su diagnóstico y manejo terapéutico.

ABSTRACT Introduction: Among the Lepidoptera, belonging to the class Insecta, only the larval forms of the genus Lonomia can cause systemic reactions in humans. So far, only two species have been formally linked to poisoning accidents: Lonomia achelous and Lonomia obliqua. Its venom is composed of proteins, serine proteases, and other components with inflammatory, procoagulant, and hemolytic activity. Objective: Describe a case of hemorrhagic syndrome associated with contact with Lonomia achelous. Thus, trying to provide information on a condition of great clinical and health relevance for the Latin American region. Clinical case: A 12-year-old patient, from a rural area, with no relevant family or personal history, who after contact with a caterpillar on the left forearm, presented local pain, fever, bruising in the submental region, right upper extremity and both lower extremities. In blood analysis, prolonged coagulation times were evidenced. Therefore, the diagnosis was considered lonomic accident. Two units of fresh frozen plasma and ε-aminocaproic acid were administered, presenting progressive clinical and analytical improvement, with normalization of coagulation parameters on the fifth day after admission. Conclusions: For its diagnosis, the clinical manifestations presented by the patient with the observation of the caterpillar was important. The administration of antilonomic serum is the recommended treatment in Brazil, however, in this case good results were obtained with the administration of ε-aminocaproic acid. Due to his presentation in different Latin American countries, it is important to provide health professionals with knowledge about its diagnosis and therapeutic management.

Susceptibilidad antimicrobiana y detección de β-lactamasas en bacilos gramnegativos causantes de infecciones neonatales

RESUMEN Introducción: Las infecciones neonatales por bacilos gramnegativos se encuentran en aumento y se asocian a un incremento de la morbimortalidad. Objetivos: Describir el comportamiento de la resistencia a antimicrobianos de importancia terapéutica en el manejo de infecciones neonatales por bacilos gramnegativos, identificar los mecanismos implicados en la resistencia a betalactámicos y determinar la frecuencia de aislados multidrogorresistentes, extremodrogorresistente y pandrogorresistente. Métodos: Durante los meses de febrero a diciembre de 2021 se realizó en Laboratorio Nacional de Referencia de Infecciones Asociadas a la Asistencia del Instituto de Medicina Tropical “Pedro Kourí” un estudio retrospectivo descriptivo de corte transversal, que incluyó 120 aislados de bacilos gramnegativos causantes de infección neonatal en 6 Hospitales Gineco-Obstétricos y Pediátricos de La Habana, los cuales forman parte de la colección de cultivos del propio Laboratorio y se recibieron entre septiembre 2017 y julio 2020. Se estudió la susceptibilidad a los antimicrobianos por el método por el método de Kirby- Bauer y se determinó la producción de Betalactamasas de Espectro Extendido (BLEE), β-lactamasas tipo AmpC, y carbapenemasa tipo metalo-β-lactamasas por el método de discos combinados con inhibidores. Por último se clasificaron los aislados acorde a su antibiotipo en multidrogorresistentes, extremodrogorresistentes y pandrogoresistentes. Resultados: Las aminopenicilinas, cefalosporinas de tercera generación, ciprofloxacino y gentamicina resultaron ser los fármacos con menor efectividad in vitro. Se confirmó producción de β-lactamasas en 38,4 %, predominaron las BLEE con 32 % y las AmpC con un 5 %, un 2 % fue productor de metalo-β-lactamasas. Los carbapenémicos y colistina, resultaron ser los antimicrobianos más activos frente a los aislados productores de BLEE y AmpC con 100% de sensibilidad. Un 96% fue multidrogorresistente y un 4,2 % fue extremodrogorresistente. Conclusiones: Los resultados del estudio sugieren una multidrorresistencia en bacilos gramnegativos causantes de infecciones en neonatos, con producción de carbapenemasas lo que constituye problema de salud en hospitales de La Habana, y revelan la necesidad de un monitoreo continuo de la susceptibilidad antimicrobiana de estos patógenos.

ABSTRACT Introduction: Neonatal gram-negative bacillus infections are on the rise and are associated with increased morbidity and mortality. Objective: Describe the behavior of resistance to therapeutically important antimicrobials in the management of neonatal infections by gram-negative bacilli, identify the mechanisms involved in resistance to beta-lactams, and determine the frequency of multidrug-resistant, extreme drug-resistant, and pandrug-resistant isolates. Methods: During the months of February to December 2021, a retrospective descriptive cross-sectional study was carried out at the National Reference Laboratory of Healthcare Associated Infections of the Tropical Medicine Institute “Pedro Kourí”, which included 120 isolates of gramnegative bacilli causing neonatal infection in 6 Gyneco-Obstetric and Pediatric Hospitals in Havana, which are part of the culture collection of the laboratory itself, and were received between September 2017 and July 2020. Antimicrobial susceptibility was evaluated by the Kirby- Bauer Method. Production of Extended Spectrum Betalactamases (ESBL), AmpC-type β-lactamases, and metallo-β-lactamase-type carbapenemases were determined by the discs combined with inhibitors method. Finally, the isolates were classified according to their antibiotype into multidrug-resistant, extreme drug-resistant, and pandrug-resistant. Results: The isolated Gram-negative bacilli showed high resistance to aminopenicillins, third-generation cephalosporins, ciprofloxacin, and gentamicin. Production of β-lactamases was detected in 38.4 %, ESBL predominated with 32 %, followed by AmpC with 5 % and metallo-β-lactamases with 2 %. Carbapenems and colistin were found to be 100 % sensitive against ESBL- and AmpC-producing organisms. Among of the isolates with β-lactamase production, 96 % were MDR and 4.2 % XDR. Conclusions: The results of the study suggest that antimicrobial resistance in gram-negative bacilli that cause infections in newborns constitutes a health problem in Havana hospitals, and reveal the need for continuous monitoring of the antimicrobial susceptibility of these pathogens.

Un llamado de atención sobre el panorama de la situación epidemiológica de la equinococosis/hidatidosis quística en Perú

RESUMEN Introducción: La equinococosis/hidatidosis quística es una enfermedad desatendida en los diferentes países latinoamericanos; en Perú las tasas reportadas se encuentran subestimadas por la poca vigilancia y monitoreo de la enfermedad. El objetivo de este estudio fue estimar las tasas de incidencia por departamento y provincia, estratificado por sexo y edad en el Perú durante 2016 - 2018. Métodos: Se obtuvieron los datos del Centro Nacional de Epidemiología del Perú. Se realizó un análisis descriptivo mediante el cálculo de tasas de incidencia por departamento y provincia, estratificados por sexo y grupo etario. También se realizó un análisis mediante regresión de poisson entre el sexo y el grupo etario (variables independientes) con la ubicación y/o complicación del quiste hidatídico (variables dependientes); se reportaron razones de prevalencia (RP). Resultados: La más alta tasa de incidencia por cada 100000 habitantes se reportó a nivel departamental en Pasco (140.43) y a nivel provincial en Huanca Sancos (1004.98). El grupo etario de 75 - 80 años reportó la más alta tasa de incidencia (109.61). El sexo femenino tuvo una incidencia de 82.93. Se encontró una mayor localización a nivel pulmonar en los adultos (RP = 1.51) y una menor en el sexo femenino (RP = 0.79). Se encontró una mayor proporción de embolia pulmonar como complicación en los ancianos (RP = 18.42). Conclusión: Las cifras indican que la distribución de la enfermedad está bien delimitada en la zona altoandina del Perú, las tasas de incidencia son elevadas en comparación con lo reportado por los entes nacionales e internacionales. Se debe incidir en la vigilancia correctamente direccionada a las zonas con las tasas más elevadas.

ABSTRACT Background: Cystic Echinococcosis is a neglected disease in Latin American countries. In Peru, reported rates are underestimated due to poor disease surveillance and follow-up. The objective of this study was to estimate the incidence rates by department and province, stratified by sex and age in Peru during 2016 - 2018. Methods: Data were obtained from the National Epidemiology Center of Peru. A descriptive analysis of incidence rates by department, province, sex, and age group was performed. An investigation was also carried out between sex and age group with the location of the cyst and if there were any complications due to Cystic Echinococcosis using Poisson regression; prevalence ratios (PR) were reported. Results: The highest incidence rate per 100,000 inhabitants was reported at the departmental level in Pasco (140.43), then at the provincial level in Huanca Sancos (1004.98), and in the 75 - 80 years age group (109.61). The female sex has an incidence of 82.93. A higher location in the lungs was found in adults (PR = 1.51) and a lower one in women (PR = 0.79). The topmost proportion of complications was found in the elderly (PR = 18.42). Conclusion: The figures indicate that the distribution of the disease is well-defined in the high Andean zone of Peru, and the incidence rates are high compared to what is reported by national and international entities. Surveillance must be correctly focused on the areas with the highest rates.

Evaluación clínica del ensayo UMELISA SARS-CoV-2 Antígeno

RESUMEN Introducción: La detección del antígeno viral constituye uno de las alternativas al diagnóstico del SARS-CoV-2 e implica replicación del virus, por lo que un resultado positivo indicaría infección actual por SARS-CoV-2. El Centro de Inmunoensayo de La Habana, Cuba desarrollo el ensayo UMELISA SARS-CoV-2 Antígeno, y en el presente artículo se describe su validación del mismo siguiendo los criterios del CECMED. Objetivo: Evaluar el desempeño clínico del ensayo UMELISA SARS-CoV-2 Antígeno. Métodos: Para evaluar el desempeño del UMELISA SARS-CoV-2 Antígeno se utilizó un panel de muestras clínicas positivas y negativas previamente analizadas por PCR en Tiempo Real. Las muestras fueron colectadas en medio de transporte que no contenían sustancias que inactivaran al agente (medio de transporte viral BTV, BIOCEN, Cuba y CITOSWAB VTM, China). Se realizó en un Laboratorios BSL-2 equipado con Cabina de Seguridad Biológica Clase II y el personal se protegió con Equipo de Protección Personal completo. Resultados: El ensayo UMELISA SARS-CoV-2 Antígeno obtiene los resultados en aproximadamente 4 horas. Mostro una sensibilidad de 80,9 %, que se incrementa a 85,5 % para muestras con valores de Ct ≤ 33 por PCR-TR. La especificidad clínica fue de un 97,2 % o 100 % en muestras analizadas con 48 y 24 horas de colectadas respectivamente. El ensayo no mostro reactividad cruzada con muestras positivas a agentes que producen IRA. Los Valores predictivos positivos y negativos fueron de 98,0 % y 84,8 % respectivamente. La Concordancia con el PCR-TR en muestras colectadas fue de 90,08 %. El índice de Kappa fue de 0,800 con una fuerza de la concordancia buena. El ensayo podría ser útil en el seguimiento de pacientes al 5to día de evolución de la enfermedad. Conclusiones: El ensayo UMELISA SARS-CoV-2 Antígeno posee buenas características clínicas y está acorde con los requisitos establecidos por la OMS para este tipo de ensayo. Al ser una tecnología completamente nacional, posibilita su extensión y aplicación en la red de laboratorios que realizan diagnóstico y vigilancia epidemiológica de la COVID-19.

ABSTRACT Introduction: The detection of the viral antigen constitutes one of the alternatives to the diagnosis of SARS-CoV-2, and implies replication of the virus, so a positive result would indicate current infection by SARS-CoV-2. The Immunoassay Center of Havana, Cuba developed the UMELISA SARS-CoV-2 Antigen assay, and this article describes its validation following the CECMED criteria. Objective: To evaluate the clinical performance of the UMELISA SARS-CoV-2 Antigen assay. Methods: A panel of positive and negative clinical samples tested by Real Time PCR was used. The samples were collected in a transport medium that did not contain substances that inactivate the agent (BTV viral transport medium, BIOCEN, Cuba and CITOSWAB VTM, China). It was carried out in a BSL-2 Laboratories equipped with a Class II Biological Safety Cabinet and the personnel used complete Personal Protection Equipment. Results: The UMELISA SARS-CoV-2 Antígeno assay obtains the results in approximately 4 hours. It had a sensitivity of 80,9 %, which increases to 85,5 % for samples with Ct values ≤ 33 by RT-PCR. The clinical specificity was 97,2 % or 100 % in samples analyzed 48 and 24 hours after collection, respectively. The assay did not show cross-reactivity with samples positive for ARI-causing agents. The positive and negative predictive values were 98,0 % and 84,8 % respectively. Concordance with RT-PCR in collected samples was 90,08 %. The Kappa index was 0,800 with a good concordance strength. The assay could be useful in the follow-up of patients at the 5th. day of evolution of the disease. Conclusions: The UMELISA SARS-CoV-2 Antígeno assay has very good analytical characteristics in accordance with the requirements established by the WHO for this type of test. Being a national technology, it allows its extension and application in the network of laboratories that carry out diagnosis and epidemiological surveillance of COVID-19.