Revista Cubana de Informática Médica

Real-time external labeling layout algorithm for Direct Volume Rendering

Illustrations used in technical and scientific texts often employ labels to correlate the graphic elements and their textual descriptions. Researchers have proposed several algorithms to determine the layout of the annotations on images rendered at interactive frame rates. Generally these layouts can be classified as internal or external. This paper proposes a new algorithm for locating external labels during the real-time direct rendering of volume data. The proposed algorithm uses only the rows of pixels corresponding to the labels anchor points, which optimizes the performance and facilitates its implementation, avoiding the computation of the convex hull for the generated image. Both, the overall visualization performance and the cost of the proposed algorithm are kept in real-time (60 fps) for medium size volumes (about 2563 voxels).

Validation coordinating movements in upper limbs for virtual rehabilitation using using slopes

El desarrollo del presente trabajo se fundamenta en la importancia de apoyar los tratamientos de Rehabilitación Motriz por medio de Tecnología Informática para beneficio de los pacientes y especialistas del área. De acuerdo a un análisis realizado de las tecnologías existentes para la Rehabilitación Motriz, se ha identificado una serie de inconvenientes que limitan su uso en algunos tratamientos y por consecuencia los pacientes no continúan o no finalizan sus terapias, en este trabajo se propone emplear una herramienta de bajo costo (sensor Microsoft Kinect) que apoye en la captura de movimientos de los puntos clave de las extremidades superiores (manos, codos y hombros) usando pendientes lineales. Así mismo, se han realizado una serie de pruebas a 21 usuarios, en donde se evaluaron sus movimientos mediante umbrales que determinaron si un ejercicio fue realizado correctamente.

The development of this researckneh is based on supporting Motor Rehabilitation treatments using Information Technology for the benefit of patients and specialists in the area. According to an analysis of current technologies for Motor Rehabilitation, we have identified some disadvantages that limit their use in the treatment and therefore patients do not continue or complete their therapies, this study intends to use a tool low cost (Microsoft Kinect sensor) to support the motion capture of the key points of the upper extremities (hands, elbows and shoulders) using a slopes. Also, the tests were conducted with 21 users, the algorithm evaluated some movements, the thresholds used determined the correct exercises.

Proposal for client architecture for user interface application of systems ris xavia 2.0

El Sistema de Información Radiológica (RIS, por sus siglas en inglés) es el encargado de la gestión de la información del Departamento de Radiología en una Institución Sanitaria, así como la Gestión de los Informes médicos y la creación de listas de trabajo para equipos DICOM compatibles.1 Dicho sistema está concebido como un sistema web por las ventajas de accesibilidad que brinda la Web y el indetenible crecimiento y desarrollo de las tecnologías que la sustentan. La presente investigación tiene como objetivo proponer las tecnologías, herramientas, estructuras y finalmente la arquitectura cliente para la aplicación de Interfaz de Usuario del Sistema XAVIA RIS, acorde a las tendencias actuales del desarrollo Web.

Radiological Information System is in charge of information management in the radiology department in a health institution, and the management of medical records and the creation of work lists for equipment DICOM compatible. This system is designed as a web system due to the benefits of accessibility offered by the Web and the unstoppable growth and development of technologies that support it. This research aims to propose technologies, tools, structures and ultimately the client architecture for User Interface Application of the XAVIA RIS System, according to current trends in Web development.

Component to decision making in health. A social network analisis approach from process mining

La mayoría de los sistemas informáticos en la actualidad generan trazas. Estas trazas revelan las acciones que son ejecutadas en estos sistemas. La Minería de Procesos tiene como objetivo descubrir, monitorear y mejorar los procesos reales de las organizaciones a través de la extracción de conocimiento de estas trazas, luego de aplicadas un conjunto de transformaciones para organizar, estructurar y limpiar la información. Sin embargo, esto no es posible si estos sistemas informáticos y sus organizaciones no tienen sus acciones con un enfoque basado en procesos. El uso de estas tecnologías permite ahorrar recursos, reducir costos, optimizar tareas, mejorar la productividad, reducir tiempos de espera, entre otras muchas acciones. En el sector de la salud es una necesidad inmediata en términos de proveer una mayor seguridad al paciente y mejorar la calidad de vida. El objetivo de esta investigación es presentar un componente para la toma de decisiones en la selección de equipos de trabajo quirúrgico en un Sistema de Información Hospitalaria que permita incrementar la efectividad de las operaciones realizadas a los pacientes. El método utilizado es el enfoque de Análisis de Redes Sociales desde la Minería de Procesos. Como resultado se espera un componente que apoye la toma de decisiones por parte de jefes de servicios de cirugía, partiendo del desempeño profesional del personal asistencial, en función de proveer un mayor confort para el paciente.

Most computer systems today generate traces. These traces show the actions that are executed in those systems. Process Mining aims to discover, to monitor and to improve real processes of organizations through knowledge extraction of these traces, after applying a set of transformations to organize, to structure and to clear this information. However, this is not possible if these computer systems and its organizations do not have their actions with a process-based approach. The use of these technologies allows saving resources, to reduce costs, to optimize tasks, to improve productivity, to reduce wait times, among many other actions. In the health sector is an immediate need in terms of providing greater patient safety and to improve quality of life. The objective of this research is to present a component for decision making in selection surgical teams work in a Hospital Information System that it allows to increase the effectiveness of operations performed to the patients. The method used is a Social Network Analysis approach from the Process Mining As a result it expected a component to support decision making by managers surgical and psychological personnel starting from the professional performance of health care personnel in function of providing greater comfort to the patient.

Computer system for the management of patients with VIH/SIDA in Guantanamo province

En nuestro país, varias entidades desarrollan de manera progresiva la informatización de sus procesos en aras de elevar los niveles de eficiencia y efectividad a través del uso de las Tecnologías de la Información y las Telecomunicaciones. En este accionar se encuentra el Centro Provincial de Higiene, Epidemiología y Microbiología Guantánamo que requirió informatizar el proceso de gestión de los pacientes de VIH/SIDA en la provincia. Para el desarrollo del sistema se utilizaron herramientas informáticas de software libre: ExtJS como librería de JavaScript, XAMPP como servidor de plataforma libre que integra el servidor de base de datos MySQL y el servidor web Apache. La aplicación siguió el patrón arquitectónico Modelo-Vista-Controlador que implementa el framework de desarrollo CodeIgniter orientado al lenguaje de programación PHP. La ingeniería del software fue descrita a través de la metodología de desarrollo Programación Extrema. El sistema informático para la gestión de pacientes de VIH/SIDA en el Centro Provincial de Higiene, Epidemiología y Microbiología Guantánamo facilita el acceso y manejo de la información de forma precisa y completa, permitiendo así elevar la productividad del trabajo en el Departamento de VIH/SIDA.

In our country, several entities progressively develop the computerization of its processes in order to raise levels of efficiency and effectiveness through the use of Information Technology and Telecommunications. The Provincial Center of Hygiene, Epidemiology and Microbiology Guantánamo demanded computerize the process of managing patients with HIV / AIDS in the province. For system development was used tools free software: ExtJS library as JavaScript, XAMPP as free server platform that integrates server MySQL database and Apache web server. The application followed the architectural pattern Model-View-Controller that implements development framework CodeIgniter oriented programming language PHP. Software engineering was described by the Extreme Programming methodology development. The computer system for the management of patients with HIV / AIDS in the Provincial Center of Hygiene, Epidemiology and Microbiology Guantánamo facilitates access and manage information accurately and completely, thus allowing to raise labor productivity in the Department of HIV / AIDS.

Software Architecture for the Vismedic medical visualization system

En los últimos años la Arquitectura de Software se ha consolidado como una disciplina que intenta contrarrestar los efectos negativos que pueden surgir durante el desarrollo de un software, ocupando un rol significativo en la estrategia de negocio de una organización que basa sus operaciones en el software. En el presente trabajo se propone una arquitectura de software basada en la integración de los estilos arquitectónicos: Arquitectura basada en componentes, Arquitectura basada en capas y Tuberías y filtros, para el sistema de visualización médica Vismedic, con el objetivo de reducir los problemas de extensibilidad, reusabilidad y dependencias que existían en la arquitectura anterior. Para realizar la propuesta se hizo necesario el estudio de los conceptos relacionados con la Arquitectura de Software, las características arquitectónicas de tres productos establecidos en el campo del procesamiento y visualización de imágenes: Volumen Rendering Engine (Voreen), Visualization Toolkit (VTK) e Insight Toolkit (ITK) y de la especificación OSGi para el desarrollo basado en componentes. La arquitectura propuesta integra las principales características de las bibliotecas antes mencionadas e incorpora el empleo de plugins para extender las funcionalidades. La misma se validó a través de la Técnica de evaluación basada en prototipos y de la aplicación del Método de Análisis de Acuerdos de Arquitectura de Software (ATAM). La evaluación permitió identificar los riesgos presentes en la propuesta realizada y determinar que la arquitectura satisface los atributos de calidad definidos para la presente investigación.

In recent years, Software Architecture has become a discipline that tries to counter the negative effects that may arise during software development, occupying a significant role in the business strategy of an organization that bases its operations on software. This paper proposes a software architecture based on the integration of the architectural styles: Component-based architecture, Layers based architecture and Pipes and Filters, for the Vismedic medical visualization system, with the objective of reducing the problems of extensibility, reusability and dependencies of the previous architecture. In order to develop the proposal was becoming necessary to study the concepts related to Software Architecture, the architectural features of three established products in the image processing and viewing field, they were: Volume Rendering Engine (Voreen), Visualization Toolkit (VTK) and Insight Toolkit (ITK), and the OSGi specification for component-based development. The proposed architecture integrates the main features of the libraries mentioned above and incorporates the use of plugins to extend its functionalities. The architecture was validated through the Prototyping based evaluation technique and the application of the Architecture Tradeoff Analysis Method (ATAM). The evaluation allowed us to identify the risks of the proposal and to determine that the architecture satisfies the quality attributes defined for this investigation.

Central statistics for registration of donor (RCD)

Cuba enfrenta el desafío de informatizar el Sistema Nacional de Salud (SNS). En el año 2004 se desarrolló la Red de Bancos de Sangre del país implementándose el módulo: Galen Banco de Sangre y el acceso al Registro Centralizado de Donantes (RCD), logrando cubrir las funcionalidades de todos los puestos de trabajo y la interfaz automática con el equipo Suma, y actualizándose diariamente con la información que se genera en cada Banco de sangre, a través de una herramienta, el Componente de Replicación. Hoy el RCD se ha actualizado en una nueva versión y se encuentra sobre la plataforma del Sistema de Información para la Salud (SiSalud), creada para la integración de los datos generados en los distintos niveles de atención al paciente, optimizando la calidad asistencial ofrecida, facilitando las funciones de los trabajadores de la salud, y colaborando con la actividad administrativa, asistencial, docente y de investigación. Utiliza Software libre y una arquitectura orientada a servicios. En esta versión ya se está implementando la información estadística que se genera a través de la actualización del RCD para la Organización Mundial de Salud. En el presente trabajo después de una introducción a la problemática, se explican los requerimientos de estos Informes con datos de interés estadístico tanto a nivel internacional como nacional, provincial y municipal, así como sus características.

Cuba faces the challenge of computerizing the National System of Health (SNS). In the year 2004 the Net of Banks of Blood of the country was developed being implemented in the whole country the module: Galen Bank of Blood and the access to the Centralized Registration of Donors (RCD). Being Able to cover the functionalities of all the work positions and the automatic interface with the Suma team , and being modernized daily with the information that is generated in each Bank of blood, through a tool, the replication component.. Today it was up dated RCD in a new version on the platform of the System of Information for the Health (SiSalud). Platform created for the integration of the data generated in the different levels of attention to the patient, optimizing the offered assistance quality, facilitating the functions of the workers of the health, and collaborating with the administrative, assistance, educational activity and of investigation. Free software and uses a service-oriented architecture. In the new version, the statistical information is in implementing status and generated through the up to dating of the RCD for the World Organization of Health. In the present work after an introduction to the problem, are explained the requirements of these Reports, with data of statistical interest so much at international level as national, provincial and municipal, as well as their characteristics.

System for the analysis of cognitive behavior in the Elderly. Case study: Pinar del río, Cuba

La cantidad de personas que ascienden a la tercera edad aumentó en 700 millones en la década del 90, a nivel mundial. Para el año 2025 se estima que existirán cerca de 2 mil millones de ancianos. El cuidado de su salud reviste vital importancia para todas las sociedades; por ello, en el presente trabajo se propone una herramienta matemático computacional para medir la ejercitación de la atención y la percepción en el ambiente diario del adulto mayor. Ambas funciones poseen una estrecha relación con la capacidad psicológica de la memoria; además, se considera que su afectación puede provocar pérdida de validismo, dependencia y discapacidad, una vez que se ha iniciado el deterioro cognitivo. La propuesta es aplicada en la ciudad de Pinar del Río, Cuba a través de test experimentales y diferentes tipos de análisis mediante medios de cómputo en una muestra de personas de la tercera edad, con una capacidad moderadamente razonable.

The number of old persons increased in 700 millions in the 90's at world level. This number will increase to nearly 2 thousand more million in 2025. The carefulness of their healthy becomes an important issue for all societies; that is why, in this research, it is presented a computational tool to measure the assistance and the perception in the daily environment of the elderly people. Both functions have a close relationship with the psychological capacity of the memory; moreover, it is considered that their damage can provoke loss of skills, dependence and disabilities, once the cognitive deterioration has begun. The proposal is applied in the pinar del río, cuba, through experimental tests and different types of analysis by means of computational in a sample of elderly people with a moderately reasonable capacity.

Intelligent decision-making from medical records stored on the CDA-HL7

Debido al incremento exponencial de la información almacenada en las organizaciones, la Sociedad de la Información está siendo superada por la necesidad de nuevos métodos capaces de procesar la información y asegurar su uso productivo. Esto se hace lógicamente extensible a los centros hospitalarios, a partir del uso extendido de las Historias Clínicas en formato electrónico. Disponer de información sistematizada, gestionarla de forma eficiente y segura es esencial para garantizar mejores prácticas en salud. A esto se le añade la necesidad de soportar estándares que permitan el intercambio entre las instituciones de salud; específicamente HL7 se ha convertido en uno de los más utilizados debido a que proporciona el intercambio a partir del metalenguaje XML. En este trabajo se propone una metodología para el descubrimiento de conocimiento implícito en Historias Clínicas en formato semi-estructurado utilizando el contenido y la estructura de los mismos. Los principales resultados son: (1) La metodología para el agrupamiento de Historias Clínicas; (2) La interpretación de los resultados del agrupamiento para asistir la toma de decisiones diagnósticas; (3) La implementación del estándar HL7, para la manipulación de documentos médicos a partir de CDA.

Due to the exponential increase of stored information the organizations, the information society is being overtaken by the need for new methods capable of processing information and ensuring its productive use. This is logically extended to the hospitals, from the widespread use of clinical histories in electronic format. To have systematized information, manage it efficiently and securely is essential to ensure better health practices. In addition, there is the need for standards to support the exchange among health institutions; specifically hl7 has become one of the most widely used because it provides the exchange from xml. In this paper is presented a methodology for the discovery of implicit knowledge in medical records with semi-structured format, using their content and structure. The main results are: (1) the methodology for the clustering of medical records; (2) the interpretation of the results of the clustering to assist diagnostic decision-making; (3) the implementation of the hl7 standard for handling medical records from CDA.

Implementation of repository of learning and research resources of the Manuel Fajardo virtual university of health

Dada la necesidad de perfeccionar el sitio web UVS-Fajardo para que permitiera la inclusión de un repositorio de Recursos Educativos Abiertos, según criterios específicos de las carreras y especialidades de ciencias médicas que se imparten en la Facultad Manuel Fajardo; se llevó a cabo una investigación con el objetivo de: realizar las adaptaciones al software Drupal en función del repositorio de Recursos Educativos Abiertos; establecer una taxonomía para los contenidos de la Universidad Virtual; e implementar un repositorio de recursos de aprendizaje e investigación. Como resultado se diseñó una taxonomía según tipo de recursos, con 8 taxones y 250 palabras que se añadieron a la clasificación LOM. Como consecuencia de la adaptación del software Drupal como base del repositorio y después de un proceso de preparación, se incrementó la producción a 644 recursos de aprendizaje y 99 de investigación. Se logró la adaptación de plantillas, metadatos y sistemas de recopilación y búsqueda. Se determinó la taxonomía a utilizar en la UVS basado en la teoría de objetos de aprendizaje y contextualizado a las características del centro docente. Se concluye que el repositorio implementado posee una lógica de organización académica que garantiza el depósito y búsqueda de forma rápida y eficiente; así como la preservación, reutilización, actualización y evaluación de los materiales digitales producidos.

Due to the need to improve the UVS-Fajardo website to allow the inclusion of a repository of Open Educational Resources, according to specific criteria of careers and specialties of medical sciences taught at the Faculty Manuel Fajardo; It was carried out an investigation in order to: make the adaptations to Drupal software based in a repository of Open Educational Resources; to establish a taxonomy for contents of the Virtual University; and to implement a repository of learning and research resources. As a result a taxonomy was designed by type of resources, with 8 taxa and 250 words that were added to the LOM classification. As a consequence of adaptation of Drupal software and after a process of preparation, the production increased to 644 learning resources and 99 of research. The adaptation of templates, metadata, collection systems and search system was achieved. It was determined taxonomy used in the UVS based on the theory of learning objects and contextualized to the characteristics of the educational establishment. We conclude that the repository implemented has a logic of academic organization that ensures the deposit and search quickly and efficiently; and the preservation, reuse, updating and evaluation of digital materials produced was achieved.

Study of sickle cell anemia using computacional methods

El procesamiento de imágenes digitales y la visión por computador son ampliamente utilizados en medicina actualmente y son de gran interés las propuestas de nuevos métodos de análisis automatizado de imágenes digitales o mejorar la eficiencia de los existentes. En este trabajo se desarrollaron métodos nuevos para estudiar computacionalmente a través de imágenes de muestras de sangre la drepanocitosis, dolencia con alta incidencia mundial y en Cuba, sobre todo en la región oriental. Se propusieron nuevos métodos de análisis de formas, obtenidos a partir de resultados clásicos de geometría integral y nuevas propuestas de visión por computador para evaluar trastornos neurofisiológicos asociados a través del estudio de las expresiones faciales del paciente. La validación estadística realizada comprobó la superioridad de estos métodos sobre otros, se determinó que son válidos para ser introducidos en software de apoyo para mejorar la calidad de la atención médica.

Digital image processing and computer vision are frequently used in medicine at present and the proposals of new methods of automatic analysis of digital images or the efficiency improvement of the existing are of great interest. In this work new methods to computationally study sickle cell disease through blood samples images are developed, an illness with high incidence in the world and in Cuba, mainly in the eastern region. New shape analysis methods obtained from classical results of integral geometry and new computer vision proposals for evaluate neuro physiological disorders associated with this illness through the study of the facial expressions of the patient were proposed. The statistical validation realized confirmed the superiority of these methods on previous proposals, which is why they are valid to be introduced in support software to improve the quality of the medical attention.

Evaluation rubric in the postgraduate teaching

Introducción. Dentro del proceso de enseñanza aprendizaje la evaluación es un aspecto fundamental, la utilización de rúbricas para ello es cada día más común, ya bien sea en tareas, exámenes o productos, entre otros. El objetivo de este trabajo es explicar qué es una rúbrica de evaluación y mostrar la conveniencia de adoptarla como un método más cuando se va a evaluar un trabajo o examen en la enseñanza postgraduada. Desarrollo. Se define lo que son las rúbricas de evaluación, sus características fundamentales, sus ventajas y desventajas, así como sus tipos. Se señala la conveniencia de usarlas en la enseñanza de postgrado y se ejemplifica con unas rúbricas elaboradas para que se utilicen en un curso de postgrado de Estadística Descriptiva. Conclusiones. Dada la forma en que se definen las rúbricas o matrices de valoración y las características que exhiben, ellas constituyen una buena propuesta de evaluación en los cursos de postgrado, tanto para el estudiante como para el profesor, por la retroalimentación que proporciona a ambos.

Introduction. In the learning teaching process the evaluation is a fundamental point, and the use of rubrics for them is every day more common, as in tasks, examinations or products, between others. The objective of this paper is to explain what it is an evaluation rubric and to show the convenience of adopt it as another method when you are going to evaluate a work or an examination in the postgraduate teaching. Development. It has been defined what are the evaluation rubrics, their vintages and challenges and so the types. It is indicated the convenience of their use in postgraduate teaching and there are showing examples with elaborated rubrics for their use in a postgraduate course in Descriptive Statistics. Conclusions. In the way that the rubrics or valuation matrixes are define and showing their characteristics, they constitute a good option in the evaluation of postgraduate courses, as for the students or the professor, by the feedback they produce to both.

Ethical standards for the management of Information on eHealth

Las Tecnologías de la Información y las Comunicaciones son la base de la mayoría de las operaciones de gestión en el mundo de hoy. El impacto de las TIC en el ámbito de la salud, incluye la apertura de posibilidades de comunicación entre clientes (personas enfermas o no) y prestadores de salud. Una emergente modalidad la constituye la eSalud. La bibliografía describe cuatro modalidades de aplicación de la misma, todas ellas implican manejo de información, en algunos casos información sensible. En este intercambio la comunicación debe ser grata, pero respetuosa, de lo contrario los vínculos se deterioran y pueden llegar, en el mejor de los casos, a la disolución, en otros las consecuencias pueden tener implicaciones legales. La presente investigación tiene como objetivo proponer algunas normas éticas contextualizadas al manejo de información en eSalud. Se realizó un análisis documental a partir de información recuperada en Internet, que permitió elaborar una propuesta de normas éticas para el manejo de información en eSalud. Al actuar conforme a estas se respetan también los derechos básicos de los seres humanos.

Information and Communication Technology are the basis of most of management operations in the world today. The impact of ICT in health includes the opening of possibilities for communication between clients (people, sick or not) and health care providers. eHealth offers a new way of doing it. Literature describes four methods for applying it, they all involve information management, in some cases sensitive information. On this exchange, communication should be pleasant, but respectful, otherwise the links gets deteriorate and may even finish, in the best case. Other times, consequences can have legal implications. This research aims to propose some ethical standards contextualized on the management of information in eHealth. A documentary analysis was performed based on information retrieved on the Internet, which allowed to develop a proposal of ethical standards for the management of information in eHealth. Acting in accordance with these basic rules, rights of human beings are also respected.