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Revista Cubana de Química
versión On-line ISSN 2224-5421
Resumen
SOUTELO-JIMENEZ, Argenis; GARCIA-LOPEZ, América; ROJAS-VARGAS, Julio y HERNANDEZ-MOLINA, Yennys. Obtención de modelos de relación cuantitativa estructura actividad (QSAR) para la predicción de actividad antibacteriana en series heterogéneas de compuestos. Rev Cub Quim [online]. 2016, vol.28, n.1, pp.462-489. ISSN 2224-5421.
Se obtuvieron dos modelos discriminantes para la predicción de la actividad antibacteriana. El modelo 1 se obtuvo empleando descriptores TOPS-MODE y de fragmentos, el modelo 2 con descriptores 3D y de fragmentos, usando el Análisis Discriminante Lineal. El estudio se realizó con 402 compuestos reportados en la literatura. El modelo 1 clasificó el 90 % de casos activos y el 97 y 93 % de casos inactivos en las series de entrenamiento y predicción respectivamente, con una clasificación global de 93 y 91 %. El modelo 2 clasificó el 89 y 90 % de casos activos y el 95 y 91 % de casos inactivos en las series de entrenamiento y predicción respectivamente, con una clasificación global de 92 y 89 %. Estos resultados y los valores de los índices estadísticos de los modelos permitieron demostrar sus calidades. Además, fueron calculadas las contribuciones de los fragmentos a la actividad antibacteriana para ambos modelos.
Palabras clave : QSAR; antibacteriana; TOPS-MODE; descriptores 3D; LDA.