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Revista Cubana de Ciencias Informáticas

On-line version ISSN 2227-1899

Abstract

MOLINA CONCEPCION, Osmany et al. Taxobanger v.1.0: Aplicación informática en R para el análisis taxonómico en bancos de germoplasma vegetal. Rev cuba cienc informat [online]. 2017, vol.11, n.3, pp.159-173. ISSN 2227-1899.

RESUMEN Los recursos fitogenéticos se han convertido en una prioridad científica, lo cual hace importante el análisis de esta diversidad mediante métodos cuantitativos que ayuden a agrupar poblaciones de un mismo género o especie. Con el objetivo de desarrollar una aplicación informática para el análisis taxonómico en las colecciones de germoplasma que se conservan en el Instituto de Investigaciones de Viandas Tropicales, se utilizó el lenguaje y entorno de programación para análisis estadístico y gráfico R. Se logró la aglutinación en un solo programa de funciones que permiten la obtención y manipulación de datos, la definición del nivel de medición de las variables y la ejecución de cuatro estrategias de clasificación que definen diferentes estructuras de datos a partir de la combinación de técnicas estadísticas que determinan aquellos conglomerados que se ajustan mejor a las características de las colecciones del germoplasma. Además, esta aplicación permite a los curadores de bancos de germoplasma contar con una herramienta informática que ayuda a la clasificación de la variabilidad conservada a partir de los rasgos que le caracterizan, sin necesidad de poseer amplios conocimientos en las técnicas estadísticas y computacionales. Esto es altamente cualificado debido a que ahorra tiempo en el procesamiento estadístico y brinda mayor visión y fiabilidad en los resultados obtenidos.  El trabajo desarrollado favorece el manejo de la biodiversidad conservada en los bancos de germoplasma y amplía su utilización en el mejoramiento genético de las especies vegetales, pues permite un mejor uso de la información y una manipulación eficiente del material genético que se posee.

Keywords : clasificación; software libre; programación en lenguaje R; recursos fitogenéticos.

        · abstract in English     · text in Spanish     · Spanish ( pdf )

 

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