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INTRODUCCION
La tuberculosis (TB) sigue constituyendo un importante problema de salud a nivel mundial. La emergencia y diseminación de cepas de Mtb resistentes a diferentes fármacos, representa actualmente un serio problema para el control de la infección, por lo que el diagnóstico temprano de una TB activa y la detección precoz de cepas multidrogoresistentes (TB-MDR) es esencial para interrumpir su trasmisión. Por otra parte, esta enfermedad es una de las principales causas de muerte en pacientes infectados por el Virus de Inmunodeficiencia Humana.1
La principal limitación de los Programas de Control de la Tuberculosis es la dificultad para lograr el diagnóstico temprano de la enfermedad. La baciloscopía ha sido y es a nivel mundial el método inicial para el diagnóstico de la TB, por su simplicidad, rapidez de procesamiento y bajo costo. Sin embargo, la baja sensibilidad respecto al cultivo, justamente menor en los países de baja incidencia de TB, limita la utilidad de esta técnica. Por otra parte el cultivo tiene una mayor sensibilidad, pero para lograr el crecimiento micobacteriano requiere de un largo período de tiempo que oscila entre 30-60 días. Por eso, en los últimos decenios se han desarrollado nuevos métodos moleculares para el diagnóstico de la TB, que intentan superar estas limitaciones. Sin embargo, alguno de estos métodos presenta desventajas en riesgos de contaminación cruzada, y que no resulta de utilidad en el control de tratamiento, ya que no distinguen entre bacilos viables y no viables. (2,3
La técnica molecular GeneXpert MTB/RIF, es un ensayo automatizado para el diagnóstico de la TB basado en la detección de ácidos nucleicos específicos de Mtb, a partir de muestras clínicas. Esta novedosa herramienta diagnóstica logra simplificar la identificación del ADN micobacteriano, integrando y automatizando los tres procesos requeridos para pruebas moleculares basadas en PCR: extracción, amplificación y detección, reduciendo así la complejidad de las pruebas moleculares, el riesgo de contaminación cruzada y las limitaciones de bioseguridad, otra de sus ventajas además de detectar la presencia de M. tuberculosis directamente de una muestra clínica, es que conjuntamente es capaz de identificar al gen rpoβ el cual codifica la resistencia a la Rifampicina, todos estos valiosos resultados tan solo en 2h. Esta técnica ha demostrado tener muy buena sensibilidad y especificidad. (3,4
La realización de este estudio propone reafirmar la aplicabilidad del ensayo molecular Xpert MTB/RIF al compararla con los resultados del diagnóstico convencional, técnica que logra la caracterización etiológica de las infecciones pulmonares y extrapulmonares donde se sospechara clínicamente que estas fuesen provocadas por Mycobacterium tuberculosis, además de permitir conocer la sensibilidad y/o resistencia a la Rifampicina, en un corto período de tiempo lo cual permitirá el inicio del tratamiento específico, evitando la diseminación de la infección.
Material y Métodos
El diseño de este estudio fue de tipo descriptivo-prospectivo, en él se analizaron las muestras recibidas en el Laboratorio Nacional de Referencia e Investigaciones de Tuberculosis, Lepra y Micobacterias (LNRI-TB/Lepra/Micobacterias) del Instituto de Medicina Tropical ¨Pedro Kourí¨ (IPK), durante el período enero - diciembre, 2018. Se analizaron un total de 287 muestras pulmonares y extrapulmonares procedentes de pacientes sintomáticos, de estas 146 (50.90%) de pacientes VIH/Sida, atendidos en el “Hospital Nacional de Referencia de Atención a pacientes VIH/Sida” del IPK.
Los criterios de inclusión establecidos para la selección de las muestras fueron: muestras que cumplieran con los criterios microbiológicos y de bioseguridad establecidos. Todas las muestras fueron conservadas desde su recolección hasta su procesamiento en refrigeración a 4 °C.
Para el diagnóstico micobacteriano se utilizaron las técnicas convencionales diagnósticas establecidas; examen directo o baciloscopía (BK) empleando coloración de Zielh-Neelsen, y examen por cultivo en medio sólido Löwenstein-Jensen (L-J), según las Normas y Procedimientos establecidos en un laboratorio diagnóstico de Micobacteriología. 5,6,7
El método de descontaminación seleccionado para ser utilizado en las muestras pulmonares fue el método de Petroff Modificado. En el caso de las muestras extrapulmonares (la que lo requiera), el método de descontaminación seleccionado fue el del ácido sulfúrico al 4%, sin embargo, antes de comenzar el proceso de descontaminación, del volumen total de cada muestra se tomó una alícuota de 1 mL el cual fue destinado para la aplicación de la técnica diagnóstica molecular Xpert MTB/RIF. La identificación de Mycobacterium tuberculosis se realizó a partir de los cultivos, utilizando el ensayo inmunocromatográfico SD BIOLINE para la detección del TB Ag MPT64. Para la aplicación del análisis molecular se realizó en equipo GeneXpert MTB/RIF marca Cepheid (EU) cumpliendo con el protocolo de trabajo según recomendaciones del fabricante; 1 mL de la muestra por 2 mL del reactivo descontaminante Xpert MTB/RIF, homogenización de la muestra, la cual después de descontaminada fue transferida al cartucho e introducido al equipo GeneXpert MTB/RIF, para la detección de Mtb y determinación de la susceptibilidad y/o resistencia a la Rifampicina, fármaco de primera línea en el tratamiento de TB. La obtención de los resultados se obtuvo en el período de 2:00h. 8,9,10
Los resultados descritos por cada una de las técnicas serán comparados entre sí según su positividad, por la aplicación del programa estadístico EPIDAT versión 3.1, 2006 recomendado por la OPS se obtendrán los valores de los Indicadores de Desempeño (ID) de Xpert/MTB/RIF para demostrar su aplicabilidad diagnóstica.
RESULTADOS y DISCUSIÓN
El total de muestras procesadas y analizadas en este trabajo fue 287, de estas 258 (89.9%) fueron muestras pulmonares y 29 (10.1%) muestras extrapulmonares. En la Tabla 1 se observa la cantidad y tipo de muestras analizadas, las muestras pulmonares fueron mayoritariamente esputos (225-78.4%), aunque también se incluyeron lavados bronquiales y líquidos pleurales, respecto a las muestras extrapulmonares estas fueron biopsia y líquidos corporales.
En la Tabla 2, aparece el número de positivos a Mycobacterium tuberculosis por cada una de las técnicas diagnósticas aplicadas. El mayor por ciento de detección a Mtb fue el obtenido al aplicar la técnica Xpert MTB/RIF, el por ciento de detección a Mtb en pacientes VIH/Sida fue del 45.4%.
En la Tabla 3 se expone la interpretación de los resultados al aplicar la técnica Xpert MTB/RIF, respecto a la detección de Mycobacterium tuberculosis y resistencia y/o sensibilidad a la Rifampicina. Respecto a la resistencia a Rifampicina del total de muestras analizadas, tres (1.0%) presentaron resistencia a este fármaco antibacilar de primera línea.
Respecto a la muestra en que el equipo detectó Error 5011, el fabricante describe que este error puede ser a causa de que el cartucho utilizado no cumpliera con las condiciones requeridas, que no estuviera herméticamente cerrado, o que la válvula no funcionó correctamente. 10
Sin embargo, debemos señalar que esta muestra, si pudo ser identificada por las técnicas convencionales de BK y cultivo en medio Löwenstein-Jensen, lo que reafirma lo recomendado por algunos autores, de aplicar conjuntamente las técnicas moleculares con las convencionales.
En la Tabla 4 se muestra el comportamiento de los Indicadores de Desempeño (ID) del Xpert MTB/RIF con respecto a los métodos convencionales utilizados. Donde se destacan los valores de especificidad (E-95.02%), sensibilidad (S-91.18%), índice de validez (IV-4.51%), e Índice de Youden (0.93) el cual nos da una medida de la efectividad de esta técnica diagnóstica molecular.
Los valores descritos en la Tabla 4 respecto a sensibilidad, especificidad, índice de validez (los tres >90%) e índice de Youden (con valor cercano a 1), o sea >0.75 demuestran el valor diagnóstico de la técnica molecular aplicada en este trabajo.
Aunque los resultados de la Tabla 2 mostraron el mayor por ciento de detección de Mtb aplicando la técnica molecular Xpert MTB/RIF, la discordancia obtenida entre los resultados al aplicar la técnica de cultivo en medio sólido Löwenstein-Jensen, respecto al por ciento de aislamiento esta no fue significativa al obtenerse un valor de p > 0,05 (p=0.2324). Sin embargo es de señalar que esta técnica molecular aporta en solo 2 horas no solo la presencia o no de Mtb sino también la resistencia y/o sensibilidad frente a la Rifampicina fármaco de primera línea dato muy importante en el tratamiento de la TB por ser marcador de Multidrogoresistencia (TB-MDR), ya que con esta información de inmediato comenzaría tratamiento específico evitando el avance o diseminación de la infección. La baciloscopía o examen directo fue la que obtuvo menor porciento de positividad, resultado esperado pues de las tres técnicas empleadas en este estudio es la que necesitaría mayor concentración bacilar (>5,000 bacilos/mL). Otro resultado a señalar es que el ensayo molecular Xpert MTB/RIF permitió detectar la positividad a Mtb en 20(45,45%) de los pacientes VIH/Sida, lo que demuestra la utilidad de esta técnica, sobre todo porque la mayoría de estos pacientes cursan en muchos casos la enfermedad con BK negativa. 11
Nuestros resultados son similares a los ya reportados por otros autores recientemente. 9,12,13
Algunos autores plantean que la TB acelera la evolución de la enfermedad producida por el (VIH), hacia su condición Sida. Por otra parte se plantea que al existir un mayor número de casos de pacientes con coinfección VIH/Sida-TB aumenta también el riesgo de transmisión y mortalidad por TB en la comunidad, además de favorecer el desarrollo de formas de TB extrapulmonar, por esta razón en los grupos de pacientes más vulnerables a la infección es muy importante la aplicación de técnicas que nos permitan acortar el tiempo diagnóstico para poder evitar el avance y diseminación de la enfermedad. (14,15
Se debe señalar los resultados tanto para las muestras pulmonares y extrapulmonares, teniendo en cuenta que en el caso de las muestras extrapulmonares estas son paucibacilares.
En la Tabla 3 se observó el por ciento de resistencia a la Rifampicina, solo 3 pacientes presentaron resistencia, este dato es importante pues se ha comprobado que cuando la cepa aislada presenta resistencia a este fármaco, es muy probable que también haya desarrollado resistencia frente a la Isoniacida (en el 90% de los casos), lo que avizora al clínico de poder estar en presencia de una cepa Multidrogoresistente (MDR). 9
La emergencia y diseminación de cepas resistentes, representa actualmente un serio problema para el control mundial de la TB, por lo que el diagnóstico temprano de una TB activa y la detección precoz de cepas multidrogoresistentes (TB-MDR) es esencial para interrumpir su trasmisión. Actualmente se estima que más de 480.000 personas desarrollan a nivel mundial una TB-MDR definida como resistencia simultánea a Rifampicina e Isoniacida (sólo un 10% de ellas recibe una terapia adecuada), esto constituye una de las principales limitaciones de los Programas de Control de la Tuberculosis establecidos en cada país. (15,16,17
En Cuba, a pesar de ser un país de baja carga de TB se mantiene la vigilancia sostenida de la resistencia a los medicamentos antituberculosos, hasta el momento se ha encontrado una baja prevalencia de resistencia, sin embargo, el LNRI-TB/Lepra/Micobacterias-IPK mantiene líneas de investigación encaminadas al desarrollo y evaluación de métodos alternativos para la detección rápida de resistencia, para garantizar que de manera oportuna se pueda indicar la terapéutica adecuada, evitando la propagación de la enfermedad. (18
Los métodos moleculares ofrecen ventajas sobre las técnicas convencionales para la detección e identificación rápida de cepas del complejo Mtb y de otras especies micobacterianas, como son: acortamiento del tiempo diagnóstico (2-48 horas), confianza y reproducibilidad. El uso de estos métodos moleculares permite mejorar el manejo del paciente, ya algunos son recomendados por la OMS. 15-17
A pesar de la eficiencia aportada por Xpert MTB/RIF en el diagnóstico de la TB, esta técnica presenta algunas desventajas como; el que al detectar la presencia del ADN en el caso de un paciente sometido a tratamiento pudiera que detecte el ADN donde los bacilos presentes ya no sean viables, pero si detectables, lo que demuestra que esta técnica no debe ser recomendada para el seguimiento de tratamiento, pues solo detecta la resistencia a la Rifampicina. 19
La OMS considerando el costo de este equipo y su mantención, recomienda que este no debiera ser aplicado a todos los pacientes, su utilización principal debe ser en aquellos grupos de pacientes más vulnerables a contraer esta enfermedad, como son los pacientes VIH/Sida y pacientes que por otras causas puedan tener algún otro tipo de deterioro en su barrera inmunológica lo cual los haga más susceptible a contraer la infección. Por otra parte por su alta especificidad también está indicado en pacientes con baciloscopía positiva, pues si el Xpert es negativo o sea que no detecta la presencia de Mycobacterium tuberculosis, se descartaría la presencia de alguna otra especie micobacteriana no tuberculosa. Por su alta sensibilidad la OMS no lo recomienda en pacientes que anteriormente hayan tenido una TB pues cualquier residuo de ADN micobacteriano que haya quedado del pasado será amplificado dando un resultado falso positivo. Se debe tener en cuenta que un resultado negativo no descarta 100% la enfermedad, por lo que debe prevalecer el criterio clínico y diagnóstico microbiológico. (16,20
Tabla 1 Clasificación de los especímenes estudiados según el tipo de muestra.
| Tipo de muestras | No. de muestras (%) |
|---|---|
| Esputo | 225 (78.3%) |
| Líquido Pleural | 18 (6.2%) |
| Cepillado Bronquial | 1 (0.3%) |
| Aspirado Traqueal | 1 (0.3%) |
| Broncoscopía | 13 (34.8%) |
| Biopsia Tejido Ganglionar | 12 (4.18%) |
| Líquido Ascítico | 7 (2.43%) |
| Líquido Pericárdico | 1 (0.3%) |
| Líquido Cefalorraquídeo | 9 (3.31%) |
| TO Total | 287 |
Tabla 2 Comparación de los resultados positivos por las tres técnicas diagnósticas empleadas.
| Tipo de Prueba | Resultados Positivos (%) | Resultados Positivos VIH+ (%) |
|---|---|---|
| Xpert TB/RIF. | 44 (15.33%) | 20 (45.4%) |
| Cultivo | 35 (12.20%) | 13 (37.1%) |
| Baciloscopía | 27 (9.4%) | 8 (29.6%) |
| Total | 106 (36.9%) | 41 (38.7%) |
Tabla 3 Interpretación de los resultados al aplicar la técnica molecular diagnóstica GeneXpert MTB/RIF.
| Categorías | Total |
|---|---|
| Detección Alta Mtb / Resistente a Rifampicina | 2(0.7%) |
| Detección Alta Mtb / No Resistente a Rifampicina | 13(4.5%) |
| Detección Media Mtb / Resistente a Rifampicina | 1(0.3%) |
| Detección Media Mtb / No Resistente a Rifampicina | 7(2.4%) |
| Detección Baja Mtb / Resistencia Indeterminada | 1(0.3%) |
| Detección Baja Mtb / No Resistente a Rifampicina | 20(7.0%) |
| No Detección de Mtb | 241(83.9%) |
| Error 5011 | 1(0.3%) |
| Test invalidado | 1(0.3%) |
| Total | 287 |
CONCLUSIONES
En este estudio se reafirma la aplicabilidad de esta técnica molecular para el diagnóstico de la TB, pues en muy corto tiempo permite realizar tanto la identificación del agente causante de la enfermedad, como la determinación de la resistencia y/o sensibilidad a uno de los antibacilares más importantes en el tratamiento de esta enfermedad, dato importante pues permite orientar al clínico desde el inicio del tratamiento, lo cual evita el desarrollo de formas diseminadas de la infección, especialmente en los grupos poblacionales de mayor riesgo.
