SciELO - Scientific Electronic Library Online

 
vol.16 número1Descriptores MAC en la detección temprana del cáncer cervical usando técnicas de procesamiento de imágenesVisor de Mapas WEB en la gestión de riesgos y adaptación al cambio climático índice de autoresíndice de materiabúsqueda de artículos
Home Pagelista alfabética de revistas  

Servicios Personalizados

Revista

Articulo

Indicadores

  • No hay articulos citadosCitado por SciELO

Links relacionados

  • No hay articulos similaresSimilares en SciELO

Compartir


Revista Cubana de Ciencias Informáticas

versión On-line ISSN 2227-1899

Rev cuba cienc informat vol.16 no.1 La Habana ene.-mar. 2022  Epub 01-Mar-2022

 

Artículo original

Reducción del ruido en imágenes SPECT utilizando el método DCRG-PPXA de Variación Total

Noise reduction in SPECT images using the DCRG-PPXA method of Total Variation

Sergio E. Ybargollin-Machado1 
http://orcid.org/ 0000-0002-6400-6183

Marlen Pérez-Díaz1  * 
http://orcid.org/0000-0002-3706-9154

Rubén Orozco-Morales1 
http://orcid.org/0000-0002-6240-1569

Reinaldo Roque-Díaz2 
http://orcid.org/0000-0002-0684-7240

1 Universidad Central “Marta Abreu” de las Villas. Facultad de Ing Eléctrica. Carretera a Camajuaní, Km 5.5, Santa Clara, Villa Clara, Cuba. sybargollin@gmail.com, mperez@uclv.edu.cu, rorozco@uclv.edu.cu

2 Hospital Universitario Celestino Hernández Robau. Calle Cuba, Esq. Alejandro Omh. rroque@infomed.sld.cu

RESUMEN

La calidad de la imagen y los diagnósticos médicos se ven afectados por la presencia del ruido. En esta investigación se presenta un método basado en variación total para la reducción del ruido en imágenes SPECT. Para el estudio se utilizó el maniquí de Jaszczak del cual se obtuvieron cortes tomográficos que fueron procesados por el método. Para comprobar la calidad de las imágenes obtenidas se emplearon métricas objetivas de calidad de imagen (SNR, C, CNR y MTF). Se obtuvo que DCRG-PPXA reduce ruido en las imágenes conservando un alto contraste y resolución espacial, logrando una buena relación de compromiso con la cantidad de ruido eliminada.

Palabras clave: SPECT; ruido; calidad de imagen; variación total

ABSTRACT

It is necessary to continue research in the field of noise reduction in Single Photon Emission Computed Tomography (SPECT) images. Image quality and medical diagnoses are affected by the presence of noise. In this investigation a method based on total variation for noise reduction in SPECT images is presented. For the study, the Jaszczak phantom was used for the tomographic sections and the processing of the method. Objective image quality metrics were used to check the quality of the images obtained (SNR, C, CNR and MTF). It was obtained that DCRG-PPXA reduces noise in the images while preserving a high contrast and spatial resolution, achieving a good compromise relationship with the amount of noise eliminated.

Keywords: SPECT; noise; image quality; total variation

Introducción

El ruido en medicina nuclear (MN) se puede describir mediante una distribución de Poisson P(x):

P(x) = m x x! e −m (1)

Donde 𝑚 es la media y 𝑥 es la variable dependiente del número de conteos del detector. También se cumple que la desviación típica es 𝜎= 𝑋 . Quiere decir que, si se conoce la media de la señal, también se conoce la desviación típica. Por consiguiente, al ajustar el ruido (𝜎) de una imagen se ajusta el número de fotones que produce la misma. (Lee, 2018).

Durante el siglo pasado se desarrollaron procedimientos y filtros para procesar las imágenes a fin de mejorar la calidad de las imágenes de MN. Algunos de ellos son: Butterworth, Hamming, Parzen, Gaussiano y Wiener (Añé, 2017). Se aprecia que los filtros paso bajo, al no distinguir entre ruido aleatorio en los bordes de regiones de actividades radionuclídicas diferentes, reducen el ruido, pero también la definición de los contornos, empeorando así la resolución espacial.

Recientemente han aparecido nuevos filtros de suavizado para el procesamiento digital de las imágenes (Liu, 2015) (Ma, 2016) (Selesnick, 2017) (Zheng, 2015) (Condat, 2017). Además, se demostró la efectividad de la variación total (TV) para recuperar imágenes nítidas, que reducen el ruido, artefactos y que preserve las grandes discontinuidades.

Algunos métodos que de TV que se emplean en la actualidad para reducir el ruido son:

Proyección de gradiente con longitud de paso constante (GPCL). (Zhu, 2013)

Variación total relativa (RTV). (Xu, 2012)

Reducción del ruido por variación total basado en la regularización no local (TVNLR). (Zhang, 2013)

Gradiente híbrido primario-dual (PDHG). (Chan, 2008)

El objetivo del presente trabajo es presentar los resultados de utilizar el método de TV “Doble regularización de TV restringida en grafos con algoritmo paralelo proximal” (DCRG-PPXA) para la reducción de ruido en imágenes de tomografía por emisión de fotón simple (SPECT), para su posible implementación en los procedimientos de rutina clínica de MN.

Metodología

Una función imagen 𝑠( 𝑡 1 , 𝑡 2 ) definida en el plano ℝ2 (en nuestro caso plano de la imagen, con 𝑡 1 y 𝑡 2 como coordenadas espaciales), bajo algunos supuestos de regularidad, tiene un campo de gradiente:

definido en ℝ2 también. Entonces, la variación total de la imagen 𝑠, se define como la norma 𝐿 1,2 del gradiente de la misma:

El método de reducción de ruido escogido, se basa en la minimización del gradiente. Este criterio lo introdujeron Rudin, Osher y Fatemi (ROF) (Rudin, 1992). El método tiene como objetivo hacer una regularización sin que los resultados sobre la imagen pierdan fidelidad. Como primer paso se minimiza la energía de la imagen, empleando una matriz 𝐻 idéntica y una diagonal; ⋀ se formula de la siguiente forma:

Donde 𝜎 𝑐 es una convolución infinitesimal. El gradiente 𝐷 𝑥 es una suma descompuesta formada por los elementos 𝑎 𝑠 . Los parámetros 𝜂 y 𝐾 son las proyecciones de la matriz 𝐻 sobre el espacio nulo, 𝐻 𝑇 es la seudo-inversa de 𝐻. El término 𝜂 2 ‖ 𝐾 𝑥 ‖ 2 es la regularización en caso de que 𝐻 no sea inyectiva. Toda la función es estrictamente convexa.

Se recurre al algoritmo paralelo proximal (PPXA) de ROF, que es una variante que se soluciona matemáticamente de la siguiente forma:

Donde, 𝑥 es la solución de la ecuación presentada y 𝐹 (𝑘) es la secuencia que se genere por el algoritmo.

El código básico empleado en este artículo para la descripción algebraica anterior, fue brindado por los propios autores (Couprie, 2013). De este modo, la imagen filtrada final, se obtiene luego de introducir el parámetro de regularización 𝜆 igual a 0,10, 𝜀 igual a 1,8x10-4, 200 iteraciones y una imagen original del maniquí de Jaszczak (corte tomográfico 2D). Los parámetros fueron escogidos mediante un ensayo de prueba y error previo, a fin de satisfacer la calidad de la imagen, a criterio de un observador experto para la reducción del ruido.

En este trabajo se utilizó un Maniquí de Jaszczak (Fig. 1b). El mismo contiene 6 estructuras que simulan patologías en MN. Estas son 6 esferas sólidas de perpex, de diámetros: 31,8mm (L1), 25,4mm (L2), 19,1mm (L3), 15,9mm (L4), 12,7mm (L5) y 9,5mm (L6) que simulan lesiones hipocaptantes de actividad radionuclídica. Se utilizó un fondo radiactivo consistente en una disolución de agua destilada con Tc99m. El agua en el maniquí tuvo una actividad inicial 1221 MBq.

Se adquirieron imágenes tomográficas en una cámara gamma E.CAM SCINTRON 7 de la firma Aleman MiE Medical Imaging Electronic (Figura 1 a). El detector de la cámara gamma (cristal de NaI (Tl) con colimador de plomo de huecos paralelos), se rotó en 360 grados alrededor del maniquí y se adquirieron sus proyecciones a partir de los sinogramas originales (Figura 1 c). Se empleó la retroproyección filtrada (FBP) como método de reconstrucción tomográfica, para obtener los cortes (2D), a partir de filtrado Rampa + Butherworth (Añé, 2017). Para aplicar los métodos de reducción de ruido por TV se escogió un corte coronal, donde se aprecian todas las simulaciones de lesiones de diferente diámetro presentes en el maniquí. (Figura 1d). Para evaluar la calidad de imagen del método se emplearon métricas cuantitativas en las regiones de interés o ROI (Figura 1c).

Fig. 1 a) Cámara gamma, b) maniquí, c) Sinograma d) Corte coronal del maniquí obtenido a partir del sinograma. 

Se analizaron las imágenes en cuento a la relación señal a ruido univariada (SNR), al contraste imagen (C) y la relación contraste a ruido (CNR) según (Cherry, 2003), y la función de transferencia de la modulación (MTF). Esta última se calculó a partir de la Transformada Rápida de Fourier (FFT) en el valor medio del borde en la ROI roja (Fig. 1c). Ahí se calcularon los puntos que tendría la MTF, y con un tamaño de 1 píxel, se calculó la FFT. Todas las ecuaciones para el cálculo de las medidas de calidad de imagen fueron programadas en Matlab. Además, como parte de la investigación se tuvo en cuenta la opinión de un observador experto y se hizo una comparación visual con respecto a métodos tradicionales de filtrado en MN.

Resultados y discusión

Los resultados para el método DCRG-PPXA fueron los siguiente:

SNR = 5,83; C = 23,58; CNR = 1,00; MTF = 0,726.

En la Figura 2 se muestra el resultado visual del método.

Fig. 2 Resultado visual del procesamiento del método. a) Imagen original, b) DCRG-PPXA. 

En cuanto a la MTF, en la Figura 3 se muestra su comportamiento para este método. Se muestra una adecuada área bajo la curva y un buen límite de detección en el 10% de la MTF.

En la Figura 4 se muestra de forma global el desempeño del método DCRG-PPXA. Se aprecia en la figura de la imagen del error, las diferencias entre la imagen original y la que se obtiene una vez procesada por el método.

Es una evidencia de cuánto ruido se retiró de la imagen y cómo esto varió la intensidad de cada píxel. Obsérvese que la imagen de salida contiene la información estructural prácticamente intacta, pero en las zonas de bordes (picos de la gráfica) se hace un suavizamiento. Se puede apreciar en qué medida se atenúan los pequeños detalles de la imagen con las variaciones de intensidad al pasar por distintas regiones. Respecto a la resolución espacial, descrita a través de la MTF (Fig. b), se puede observar que prácticamente no hay pérdidas para todo el rango de frecuencias espaciales. Las curvas de entrada y salida quedan superpuestas en todo el diapasón de frecuencias, y solo al nivel de detección (10 % de la MTF) se ven diferencias mínimas.

En las tres imágenes inferiores se aprecia la imagen original, la que resulta luego de aplicar el método y el mapa que recoge la diferencia entre ambas, el cual ofrece una apreciación cualitativa de las zonas donde se concentra mayormente el ruido. Obsérvese las líneas (azul y roja) que recogen el perfil de actividad que se grafica en a).

Fig. 3 Curva de MTF del método DCRG-PPXA. 

Otros autores también han encontrado un buen desempeño en este método. Según (Couprie, 2013) DCRG-PPXA atenúa los pequeños detalles de la imagen y reproduce mejor las variaciones grandes de intensidad en comparación con otros métodos. El método de TV se puede resolver mediante algoritmos proximales rápidos paralelos. También estos autores comprobaron que funciona bien en gráficos arbitrarios en vez de las cuadrículas regulares que se representan en los píxeles de SPECT, como es el caso del presente artículo. Se puede deducir también que es aplicable para variados problemas inversos, como la fusión de imágenes y el filtrado de mallas (Chambolle, 2010).

Fig. 4 Desempeño global del método DCRG-PPXA. a) Perfil de actividad de una línea, b) MTF, c) imagen original,d) Imagen filtrada, e) Mapa de diferencias a nivel de píxel entre original y filtrada. 

A fin de poder valorar el excelente desempeño del método propuesto para SPECT, las Figura 5 Figura 6 Figura 7 muestran el desempeño de 3 métodos clásicos, aplicados a la misma imagen.

Reducción de ruido en imágenes SPECT usando filtrado bilateral (Chen, 2007) (Figura 5)

Fig. 5 Desempeño global del filtrado bilateral para la reducción del ruido en imágenes SPECT. 

Con este método para la reducción del ruido de las imágenes SPECT se hace una reducción media del ruido, a costa de la disminución de la resolución espacial y el contraste. Como se puede apreciar existen ROI (la más pequeña) que casi desaparece y sus bordes no se distinguen con facilidad. En la figura 5, en la parte derecha se tiene un gráfico donde se representa como a la salida (imagen luego de aplicarle el método) se eliminan muchas frecuencias que pudieran ser importantes. Existen diferencias entre las MTF de ambas imágenes (original y filtrada para todo el rango de frecuencias prácticamente).

Reducción de ruido en imágenes SPECT usando filtrado adaptativo direccional (Smith, 2000) (Figura 6):

Fig. 6 Desempeño global del filtrado adaptativo direccional para la reducción del ruido en imágenes SPECT. 

En este método la resolución espacial visualmente está un poco mejor que en el anterior. Sin embargo, la MTF está afectada por la disminución del ruido para varias frecuencias espaciales y la relación de compromiso entre la resolución espacial y la disminución del ruido no es la mejor. En el perfil de actividad se aprecian las pérdidas de la resolución en los bordes de las ROIs.

Reducción de ruido en imágenes SPECT usando filtrado de Wiener (Lim, 1990) (Figura 7):

Fig. 7 Desempeño global del filtrado de Wiener para la reducción del ruido en imágenes SPECT. 

En este caso es aún peor que en el primer método visto. La reducción del ruido es muy alta, al punto de comprometer en extremo la resolución espacial para todo el rango de frecuencias espaciales. Se pierde contraste con el fondo y casi desaparece una de las ROIs, por lo que un diagnóstico, a partir de esta imagen resultante pudiera traer muchos errores.

Como se puede apreciar, y como conclusión de la opinión del observador experto, aunque la disminución de ruido es buena, no existe una adecuada relación de compromiso entre la disminución del ruido y el mantenimiento de un adecuado contraste o resolución espacial para estos métodos tradicionales, que vienen implementados en el software de cualquier cámara gamma.

Conclusiones

Al remover ruido en imágenes SPECT mediante el empleo de TV, el método DCRG-PPXA tiene un buen comportamiento global. Se logra un buen compromiso entre el ruido removido y la mantención de niveles de contraste imagen y resolución espacial adecuados.

Referencias

Afonso, M. V.-D. An Augmented Lagrangian Approach To The Constrained Optimization Formulation Of Imaging Inverse Problems. Ieee Transactions On Image Processing, 2010, 20 (3): P. 681-695. [ Links ]

Añé, R. P. Filtros En Medicina Nuclear. Barcelona, 2017. [ Links ]

Bauschke, H. H. Fixed-Point Algorithms For Inverse Problems In Science And Engineering. Springer Science & Business Media, 2011, 49. [ Links ]

Chambolle, A.; Caselles, V.; Cremers, D.; Novaga, M.; Pock, T. An Introduction To Total Variation For Image Analysis. Theoretical Foundations And Numerical Methods For Sparse Recovery, 2010, 227 (9): P. 263-340. [ Links ]

Chan, M. Z. An Efficient Primal-Dual Hybrid Gradient Algorithm For Total Variation Image Restoration. Ucla Cam Report, 2008, 34 (1): P. 1-29. [ Links ]

Chen, S. P.; Paris, S.; Durand, F. Real-Time Edge-Aware Image Processing With The Bilateral Grid. Acm Siggraph Conference Proceedings, 2007. [ Links ]

Combettes, P. L. A Proximal Decomposition Method For Solving Convex Variational Inverse Problems. Inverse Problems, 2008, 24 (6). [ Links ]

Combettes, P. L. Dualization Of Signal Recovery. Set-Valued And Variational Analysis, 2010, 18 (3-4): P. 373-404. [ Links ]

Combettes, P. L.; Pesquet, J.C. Proximal Splitting Methods In Signal Processing. In Fixed-Point Algorithms For Inverse Problems In Science And Engineering, Springer, New York, 2011, 185-212. [ Links ]

Condat, L. Discrete Total Variation: New Definition And Minimization. Siam Journal On Imaging Sciences, 2017, 10 (3): P. 1258-1290. [ Links ]

Couprie, C. G.; Grady, L.; Najman, L.; Pesquet, J.C.; Talbot, H. Dual Constrained Tv-Based Regularization On Graphs. Siam Journal On Imaging Sciences, 2013, 6 (3): P. 1246-1273. [ Links ]

Illanes, L. Física De La Medicina Nuclear. Series: Libros De Cátedra. Editorial De La Universidad De La Plata, Argentina (S.F.). 2020 [ Links ]

Jenatton, R. M. Proximal Methods For Hierarchical Sparse Coding. The Journal Of Machine Learning Research, 2011, P. 2297-2334. [ Links ]

Lee, S.; Lee, M., Kang, M. Poisson-Gaussian Noise Analysis And Estimation For Low-Dose X-Ray Images In The Nsct Domain. Sensor, 2018, 18 (4), P. 1019. [ Links ]

Lim, J. S. Two-Dimensional Signal And Image Processing. Englewood Cliffs, Nj, Prentice Hall, 1990. [ Links ]

Liu, J.; Huang, T.-Z.; Selesnick, I.W.; Lv, X.-G.; Chen, P.-Y. Image Restoration Using Total Variation With Overlapping Group Sparsity. Information Sciences, 2015, 295, P. 232-246. [ Links ]

Ma, J.; Chen, C.; Li, C.; Huang, J. Infrared And Visible Image Fusion Via Gradient Transfer And Total Variation Minimization. Information Fusion, 2016, 31, P. 100-109. [ Links ]

Pesquet, J. C. A Parallel Inertial Proximal Optimization Method, Pacific Journal Of Optimization, 2012, 8 (2); P. 273-305. [ Links ]

Rudin, L.I.; Osher, S.; Fatemi, E. Nonlinear Total Variation Based Noise Removal Algorithms. Physica D: Nonlinear Phenomena, 1992, 60, P. 259-268. [ Links ]

Selesnick, I. Total Variation Denoising (An Mm Algorithm). Nyu Polytechnic, 2017, P. 1-14. [ Links ]

Smith, J. R. Image Denoising Using Directional Filter Banks. Proceedings 2000 International Conference On Image Processing, September 2000, P. 292-295. [ Links ]

Xu, L.; Yan, Q.; Xia, Y.; Jia, J. Structure Extraction From Texture Via Relative Total Variation. Acm Transactions On Graphics (Tog), 2012, 31 (6): P. 1-10. [ Links ]

Zhang, J.; Liu, S.; Xiong, R.; Ma, S.; Zhao, D. Improved Total Variation Based Image Compressive Sensing Recovery By Nonlocal Regularization. In 2013 Ieee International Symposium On Circuits And Systems (Iscas2013), 2013, May, Pp. 2836-2839, Ieee. [ Links ]

Zheng, Y.; Jeon, B.; Zhang, J.; Chen, Y. Adaptively Determining Regularisation Parameters In Non-Local Total Variation Regularisation For Image Denoising. Electronics Letters, 2015, 51 (2): P. 144-145. [ Links ]

Zhu, M. Duality-Based Algorithms For Total-Variation- Regularized Image Restoration. Computational Optimization and Applications, 2013, 47 (3): p. 2836-2839. [ Links ]

Contribuciones de los autores

5Adquisición de fondos: -

Recibido: 15 de Diciembre de 2021; Aprobado: 17 de Febrero de 2022

*Autor para la correspondencia. (mperez@uclv.edu.cu)

No existe conflicto de intereses entre los autores.

Conceptualización: Marlen Pérez Díaz.

Curación de datos: Rubén Orozco Morales y Reinaldo Roque Díaz

Análisis formal: Sergio Ybargollin Machado

Investigación: Sergio Ybargollin Machado

Metodología: Sergio Ybargollin Machado

Administración del proyecto: Marlen Pérez Díaz

Recursos: Reinaldo Roque Díaz

Software: Sergio Ybargollin Machado

Supervisión: Marlen Pérez Díaz y Rubén Orozco Morales

Validación: Sergio Ybargollin Machado

Visualización: Sergio Ybargollin Machado

Redacción - borrador original: Sergio Ybargollin Machado

Redacción - revisión y edición: Marlen Pérez Díaz y Rubén Orozco Morales

Creative Commons License Este es un artículo publicado en acceso abierto bajo una licencia Creative Commons