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<institution><![CDATA[,Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí  ]]></institution>
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<abstract abstract-type="short" xml:lang="en"><p><![CDATA[40 straing of the Mycobacterium genus corresponding to 12 species, which were subjected to 62 microbiological and biochemical tests, were studied. Each one was considered as a character. As a result of the similitude coefficient and their grouping, 9 phenomes represented by: Phenome I (Mycobacterium fortitum), Phenome II (MAI Complex), Phenome III (Mycobacterium phlei), Phenome IV (Mycobacterium triviale), Phenome V (Mycobacterium smegmatis), Phenome VI (Mycobacterium gordonae), Phenome VII (Mycobacterium szulgai), Phenome VIII (MAI Complex), and Phenome IX (Mycobacterium scrofulaceum), were obtained. The strain identification work was consistent with grouping from the phenotypic point of view.]]></p></abstract>
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VALDIVIA ALVAREZ   <h4> <B>RESUMEN</B></h4>   Se estudiaron 40 cepas del g&eacute;nero <I>Mycobacterium</I> correspondientes   a 12 especies las cuales fueron sometidas a 62 pruebas microbiol&oacute;gicas   y bioqu&iacute;micas, consideradas cada una como un car&aacute;cter. Como   resultado de los coeficientes de similitud y su agrupaci&oacute;n se obtuvieron   9 fenones, representados por: Fen&oacute;n I <I>(Mycobacteriu fortuitum</I>),   Fen&oacute;n II (Complejo MAI), Fen&oacute;n III (<I>Mycobacterium phlei</I>),   Fen&oacute;n IV <I>(Mycobacterium triviale</I>), Fen&oacute;n V (<I>Mycobacterium   smegmatis</I>), Fen&oacute;n VI <I>(Mycobacterium gordonae</I>), Fen&oacute;n   VII (<I>Mycobacterium szulgai</I>), Fen&oacute;n VIII (Complejo MAI) y   Fen&oacute;n IX (<I>Mycobacterium scrofulaceum</I>). El trabajo de identificaci&oacute;n   de las cepas fue coherente con la agrupaci&oacute;n desde el punto de vista   fen&eacute;tico.          <P><B>Palabras clave</B>: <I>MYCOBACTERIUM</I>/aislamiento &amp; purificaci&oacute;n;   <I>MYCOBACTERIUM</I>/clasificaci&oacute;n; CUBA.      <h4> <B>INTRODUCCION</B></h4>   Las micobacterias presentan un gran inter&eacute;s microbiol&oacute;gico,   bioqu&iacute;mico, m&eacute;dico e industrial, dada la importancia que   tienen no s&oacute;lo por el n&uacute;mero de especies pat&oacute;genas   que presentan, sino por ser algunas capaces de transformar sustancias o   intermediarios esteroidales.<SUP>1-7</SUP> A partir de los trabajos de   <I>Sneath</I>, se adoptaron t&eacute;cnicas de taxometr&iacute;a para micobacterias,<SUP>7-10</SUP>   obteni&eacute;ndose informaci&oacute;n en cuanto a la agrupaci&oacute;n   de estos microorganismos. Esto constituy&oacute; el inicio de estudios   posteriores que mostraron otros aspectos sobre algunos de los miembros   de los grupos I, II y III de acuerdo con el esquema de clasificaci&oacute;n   propuesto por Tsukamura.<SUP>2</SUP>          <P><I>Tsukamura y Mizumo</I>, realizaron estudios taxom&eacute;tricos con   micobacterias escotocrom&oacute;genas de r&aacute;pido crecimiento, y de   80 caracteres analizados emplearon 53 efectivos, pero no incluyeron en   dicho trabajo a especies de lento crecimiento. Si a ello se suma que la   descripci&oacute;n cada vez m&aacute;s detallada de especies del g&eacute;nero   <I>Mycobacterium</I> ha ocasionado que su n&uacute;mero sobrepase de 50,<SUP>2,7</SUP>   con un grupo de ellas identificadas de un modo relativamente f&aacute;cil,   pero otras de muy dif&iacute;cil identificaci&oacute;n (<I>Valdivia et   al.,</I> 1975), resulta evidente realizar estudios lo m&aacute;s completos   posible con los miembros de este g&eacute;nero y a trav&eacute;s de un   enfoque taxom&eacute;trico en cuanto a la agrupaci&oacute;n de dichos espec&iacute;menes;   el prop&oacute;sito de este trabajo es contribuir a examinar las relaciones   entre las especies de <I>Mycobacterium</I> aisladas en nuestro pa&iacute;s.<SUP>5,8,9</SUP>   <H3>   <B>MATERIAL Y METODO</B></H3>   <I>Microorganismos</I>. Para el presente estudio se emplearon 40 cepas   del g&eacute;nero <I>Mycobacterium</I>, obtenidas de pacientes sintom&aacute;ticos   respiratorios (SR + 14 d&iacute;as) procedentes de las 14 provincias del   pa&iacute;s y del Municipio Especial Isla de la Juventud, identificadas   por el Laboratorio Nacional de Referencias de Micobacterias y Tuberculosis   del Instituto de Medicina Tropical "Pedro Kour&iacute;" (IPK).          <P><I>Caracteres estudiados</I>. Se estudiaron las pruebas microbiol&oacute;gicas,   fisiol&oacute;gicas y bioqu&iacute;micas de acuerdo con m&eacute;todos   internacionalmente establecidos,<SUP>6</SUP> y para este g&eacute;nero   en espec&iacute;fico<SUP>2,7,10</SUP> fue analizado un total de 62 caracteres,   lo cual est&aacute; dentro de lo establecido para agrupaciones microbianas.<SUP>8-10</SUP>   En el anexo 1 se relacionan las pruebas a que fueron sometidas las cepas   investigadas.          <P><I>Unidades taxon&oacute;micas operacionales</I>. Se consider&oacute;   a cada cepa una Unidad Taxon&oacute;mica Operacional (UTO). En el anexo   2 se presenta el listado de UTOs, el cual contiene un total de 12 especies   del g&eacute;nero <I>Mycobacterium</I>. El Complejo MAI est&aacute; formado   por las especies <I>Mycobacterium avium</I> y <I>Mycobacterium intracellulare</I>,   de acuerdo con <I>Tsukamura</I>.<SUP>2</SUP>          <P><I>An&aacute;lisis de agrupaci&oacute;n</I>. Los datos obtenidos de   cada UTO fueron codificados e introducidos en el programa An&aacute;lisis   de similitud-CLUSTER, elaborado por el <I>Coyula </I>y <I>Sigarroa</I>   (Facultad de Biolog&iacute;a de la Universidad de La Habana, 1992). Los   valores de agrupaci&oacute;n se establecieron desde 0,000 hasta 1,000 (0   a 100 %) con similitud, con un intervalo de 6 unidades (6 %) en la escala.   <H3>   <B>RESULTADOS</B></H3>   El estudio taxom&eacute;trico realizado con las 40 UTOs demostr&oacute;   que los grupos se corresponden casi con exactitud, se pueden distinguir   IX taxones, distribuidos de la manera siguiente: Fen&oacute;n I (UTOs 1   y 2) representado por la especie <I>Mycobacterium fortuitum</I>, Fen&oacute;n   II (UTOs 26, 30, 32 y 40) constituido por el Complejo MAI (<I>Mycobacterium   avium-intracellulare</I>), Fen&oacute;n III (UTOs 28 y 39) por la especie   <I>Mycobacterium phlei</I>, Fen&oacute;n IV (UTOs 18, 20, 24, 27 y 36)   por <I>Mycobacterium triviale</I>, Fen&oacute;n V (UTOs 23 y 27) por <I>Mycobacterium   smegmatis</I>, Fen&oacute;n VI (UTOs 19, 29 y 38) por <I>Mycobacterium   gordonae</I>, Fen&oacute;n VII (UTOs 13, 21, 31 y 34) por <I>Mycobacterium   szulgai</I>, Fen&oacute;n VIII (UTOs 5, 7, 8, 10, 11, 15, 16, 22 y 25 por   el Complejo MAI y Fen&oacute;n IX (UTOs 6,9 y 12), por <I>Mycobacterium   scroifulaceum</I> (figura).          <P>Las UTOs 3, 4, 14 y 17 muestran una independencia relativa lo cual no   es de extra&ntilde;ar al ser 4 especies diferentes (<I>Mycobacterium smegmatis,   Mycobacterium marinum, Mycobacterium vaccae </I>y <I>Mycobacterium gastri</I>),   y que tambi&eacute;n es aplicable a la UTO 33 del Complejo MAI. Esta &uacute;ltima   UTO se aparta visiblemente del contexto de agrupaci&oacute;n del Complejo   MAI (Fenones II y VIII), pero a&uacute;n as&iacute; guarda cerca de un   68 % de similitud con el Fen&oacute;n II.          <P>La especie <I>Mycobacterium scrofulaceum</I> (UTOs 9,12 y 6), con el   91 % de similitud, muestra un agrupamiento homog&eacute;neo, as&iacute;   como <I>Mycobacterium smegmatis </I>(UTOs 23 y 27) con el 87 % de similitud;   mientras que <I>Mycobacterium szulgai</I> present&oacute; 2 variantes,   una con el 95 % de similitud (UTOs 13 y 21) conectada a 60 % de similitud   con otras agrupaciones, y otras con 87 % (UTOs 23 y 27), pero conectada   al 79 % con la agrupaci&oacute;n <I>Mycobacterium triviale</I> (figura).   Por otra parte <I>Mycobacterium triviale</I> (UTOs 18, 20, 24, 27 y 36)   con 92 % tambi&eacute;n muestra una agrupaci&oacute;n homog&eacute;nea,   al igual que <I>Mycobacterium phlei</I> (UTOs 28 y 29) con el mismo nivel   de similitud pero conectada al nivel 64 % con una de las 2 agrupaciones   del Complejo MAI (UTOs 26, 30, 32 y 40) y <I>Mycobacterium fortuitum</I>,   <I>Mycobacterium marinum</I> (UTO 4), tambi&eacute;n mostr&oacute; independencia   pero conectada al 66 % con la otra agrupaci&oacute;n del Complejo MAI (UTOs   5, 7, 8, 10, 11, 15, 16, 22 y 25) como puede apreciarse en la figura.          <P>En el fenograma obtenido se puede observar (figura) que las UTOs de   r&aacute;pido crecimiento (1, 2, 3, 14, 28 y 39) se encuentran agrupadas   a niveles de similitud superiores al 91 %, como fue el caso de las agrupaciones   de UTOs 1 y 2, y UTOs 28 y 29. No as&iacute; las UTOs 3 y 14 las cuales   mostraron independencia, mientras que las otras 2 agrupaciones restantes   corresponden a las especies normales <I>Mycobacterium fortuitum</I> y <I>Mycobacterium   phlei</I>.   <H3>   <B>DISCUSION</B></H3>   El Complejo MAI present&oacute; 2 agrupaciones bastante separadas, pero   conectadas al 44 % de similitud. No obstante, ambas agrupaciones constituyen   fenones con el 91 % de similitud entre sus UTOs dentro del grupo. Esta   diferencia puede explicarse al analizar que el Complejo MAI est&aacute;   constituido por 2 especies muy afines seg&uacute;n <I>Tsukamura</I>, conocidas   como <I>Mycobacterium avium</I> y <I>Mycobacterium intracellulare</I>.   No fue posible discernir a cual grupo corresponde cada una de dichas especies   a partir de los datos analizados, ya que el objetivo b&aacute;sico de este   trabajo taxom&eacute;trico estuvo dirigido hacia un estudio global del   g&eacute;nero <I>Mycobacterium</I> y no hacia 2 especies dentro del g&eacute;nero   estudiado. Sin embargo, se impone un estudio m&aacute;s espec&iacute;fico   para el Complejo MAI en particular.          <P>A partir de un an&aacute;lisis global, puede apreciarse que los resultados   de identificaci&oacute;n de las UTOs bajo estudio se corresponden coherentemente   con el punto de vista fen&eacute;tico, lo cual permiti&oacute; identificar   cada tax&oacute;n de acuerdo con la especie nominal; estos microorganismos   se han agrupado en algunos sistemas de clasificaci&oacute;n, con un n&uacute;mero   relativamente peque&ntilde;o de pruebas<SUP>2</SUP> y con selecci&oacute;n   de caracteres efectivos.<SUP>10</SUP>   <H3>   <B>CONCLUSIONES</B></H3>      <DIR>1. El estudio taxom&eacute;trico realizado por primera vez en nuestro   pa&iacute;s, de UTOs aisladas de las diferentes provincias y distribuidas   en 12 especies pertenecientes al g&eacute;nero <I>Mycobacterium</I>, permiti&oacute;   establecer 9 agrupaciones y asegurar a cada Fen&oacute;n una especie nominada.          ]]></body>
<body><![CDATA[<P>2. El complejo MAI present&oacute; 2 fenones, lo cual se explica por   la presencia en &eacute;ste de 2 especies muy afines, se plantea la necesi   dad de un estudio m&aacute;s profundo dirigido s&oacute;lo a este complejo.          <P>3. Los resultados encontrados en la identificaci&oacute;n de las UTOs   y sus relaciones con los fenones obtenidos mostraron coherencia desde el   punto de vista fen&eacute;tico.</DIR>   <B>ANEXO 1.</B> Pruebas microbiol&oacute;gicas y bioqu&iacute;micas realizadas   a 40 cepas (Unidades Taxon&oacute;micas Operacionales) del g&eacute;nero   <I>Mycobacterium</I> empleadas en el estudio taxom&eacute;trico   <DIR>1. Escotocrom&oacute;geno          <P>2. Crecimiento a 42 <SUP>o</SUP>C          <P>3. Crecimiento a 45 <SUP>o</SUP>C          <P>4. Nitratasa          <P>5. Nitratasa (24h)          <P>6. Benzamida          <P>7. Urea          <P>8. Isonicotinamida          <P>9. Pirazinamida          ]]></body>
<body><![CDATA[<P>10. Succinamida          <P>11. Glutamato (Fte. C y N)          <P>12. Succinato (Fte. C y N)          <P>13. Tween 80 (1 %)          <P>14. N<SUB>2</SUB>NO<SUB>3</SUB> (0,1 %)          <P>15. NH<SUB>2</SUB>OHCL (250 <FONT FACE=Symbol>m</FONT>g/mL)          <P>16. NH<SUB>2</SUB>OHCL (500 <FONT FACE=Symbol>m</FONT>g/mL)          <P>17. TCH (1 <FONT FACE=Symbol>m</FONT>g/mL)          <P>18. Etambutol (5 <FONT FACE=Symbol>m</FONT>g/mL)          <P>19. Rifampicina (25 <FONT FACE=Symbol>m</FONT>g/mL)          ]]></body>
<body><![CDATA[<P>20. Cloranfenicol          <P>21. Tetraciclina (Fte. N)          <P>22. Colimicina          <P>23. Carbenicilina          <P>24. Cefaloridina          <P>25. Amikacina          <P>26. Penicilina          <P>27. Meticillin          <P>28. Eritromicina          <P>29. Gentamicina          ]]></body>
<body><![CDATA[<P>30. Kanamicina          <P>31. Arilsulfatasa (3 d)          <P>32. Niacina          <P>33. Catalasa (45mm)          <P>34. Hidr&oacute;lisis del Tween (24h)          <P>35. Hidr&oacute;lisis del Tween (5d)          <P>36. Hidr&oacute;lisis del Tween (11d)          <P>37. Cloruro de sodio 5 % (3d)          <P>38. Cloruro de sodio 5 % (14d)          <P>39. Cloruro de sodio 5 % (21d)          ]]></body>
<body><![CDATA[<P>40. B-glucosidasa          <P>41. Mac Conkey          <P>42. Captaci&oacute;n de Fe          <P>43. Serina (Fte. C y N)          <P>44. Glucosamida (Fte. C y N)          <P>45. Acetamina (Fte. C y N)          <P>46. Benzamida (Fte. C y N)          <P>47. Benzoato (Fte. C y N)          <P>48. Nitrato (Fte. N)          <P>49. Nitrito (Fte. N)          ]]></body>
<body><![CDATA[<P>50. Acetamina (Fte. N)          <P>51. Benzamida (Fte. N)          <P>52. Urea (Fte. N)          <P>53. Pirazinamida (Fte. N)          <P>54. Nicotinamida (Fte. N)          <P>55. Isonicotinamida (Fte. N)          <P>56. Succinamida (Fte. N)          <P>57. Patogenicidad          <P>58. Resistencia INH (1 <FONT FACE=Symbol>m</FONT>g/mL)          <P>59. Crec. r&aacute;pido (Ogawa)          ]]></body>
<body><![CDATA[<P>60. Fuertemente BAAR          <P>61. D&eacute;bil o parcial BAAR          <P>62. Resistencia INH (10 <FONT FACE=Symbol>m</FONT>g/mL)</DIR>   &nbsp;<B>ANEXO 2. </B>Relaci&oacute;n de Unidades Taxon&oacute;micas Operacionales   sometidas a estudio taxonom&eacute;trico, pertenecientes al g&eacute;nero   <I>Mycobacterium</I>   <DIR>1. <I>M. fortuitum</I>          <P>2. <I>M. fortuitum</I>          <P>3. <I>M. smegmatis</I>          <P>4. <I>M. marinum</I>          <P>5. <I>Mycobacterium sp.</I>          <P>6. <I>M. scrofulaceum</I>          <P>7. Complejo MAI          <P>8. Complejo MAI          ]]></body>
<body><![CDATA[<P>9. <I>M. scrofulaceum</I>          <P>10. Complejo MAI          <P>11. Complejo MAI          <P>12. <I>M. scrofulaceum</I>          <P>13. <I>M. szulgai</I>          <P>14. <I>M. vaccae</I>          <P>15. Complejo MAI          <P>16. Complejo MAI          <P>17. <I>M. gastri</I>          <P>18. <I>M. triviale</I>          ]]></body>
<body><![CDATA[<P>19. <I>M. gordonae</I>          <P>20. <I>M. triviale</I>          <P>21. <I>M. szulgai</I>          <P>22. Complejo MAI.          <P>23. <I>M. smegmatis</I>          <P>24. <I>M. triviale</I>          <P>25. Complejo MAI          <P>26. Complejo MAI          <P>27. <I>M. triviale</I>          <P>28. <I>M. phlei</I>          ]]></body>
<body><![CDATA[<P>29. <I>Mycobacterium sp.</I>          <P>30. Complejo MAI          <P>31. <I>M. szulgai</I>          <P>32. Complejo MAI          <P>33. Complejo MAI          <P>34. <I>M. szulgai</I>          <P>35. Complejo MAI          <P>36. <I>M. triviale</I>          <P>37. <I>M. smegmatis</I>          <P>38. <I>M. gordonae</I>          ]]></body>
<body><![CDATA[<P>39. <I>M. phlei</I>          <P>40. Complejo MAI</DIR>      <H3>   <B>SUMMARY</B></H3>   40 straing of the <I>Mycobacterium</I> genus corresponding to 12 species,   which were subjected to 62 microbiological and biochemical tests, were   studied. Each one was considered as a character. As a result of the similitude   coefficient and their grouping, 9 phenomes represented by: Phenome I (<I>Mycobacterium   fortitum)</I>, Phenome II (MAI Complex), Phenome III (<I>Mycobacterium   phlei</I>), Phenome IV (<I>Mycobacterium triviale)</I>, Phenome V (<I>Mycobacterium   smegmatis)</I>, Phenome VI (<I>Mycobacterium gordonae)</I>, Phenome VII   (<I>Mycobacterium szulgai)</I>, Phenome VIII (MAI Complex), and Phenome   IX (<I>Mycobacterium scrofulaceum)</I>, were obtained. The strain identification   work was consistent with grouping from the phenotypic point of view.          <P><B>Key words:</B> <I>MYCOBACTERIUM</I>/isolation/purification; <I>MYCOBACTERIUM</I>/classification;   CUBA.   <H3>   <B>REFERENCIAS BIBLIOGRAFICAS</B></H3>      <OL>       <LI>   <FONT SIZE=-1>Kappler W. Zur Taxonomie der Gattung Mycobacterium: II: Klassidizierung   langsam waschsender Myokobakterien. Z Tuberk Erkrank Thoraxorgane 1968;129:321-8.</FONT></LI>          <LI>   <FONT SIZE=-1>Tsukamura M. Intermediate between <I>Mycobacterium tubercu-losis</I>   and <I>Mycobacterium bovis</I>. Microbiol Immunol 1984;28: 961-3.</FONT></LI>          <LI>   <FONT SIZE=-1>Bojalil LF, Cerbon J, Trujillo A. Adansonian classification   of <I>Mycobacteria</I>. J Gen Microbiol 1962;28:333.</FONT></LI>          <LI>   <FONT SIZE=-1>Wayne LG. Classification and identification of <I>Mycobacteria</I>:   III Species within group III. Am Rev Respir Dis 1966;93:919- -28.</FONT></LI>          <LI>   <FONT SIZE=-1>Valdivia JA, Echemend&iacute;a M. Estudio de 16 cepas de   micobacterias cromog&eacute;nicas y de crecimiento r&aacute;pido. Rev Cubana   Med Trop 1975;27:213-23.</FONT></LI>          <LI>   <FONT SIZE=-1>Bonicke R. L'identification des mycobact&eacute;ries a l'aide   des m&eacute;thodes biochemiques. Bull Un Int Tuber 1962;32:13.</FONT></LI>          <LI>   <FONT SIZE=-1>Tsukamura M. Selected papers of studies on <I>Mycobacterium,   Rhodococcus</I> and <I>Nocardia</I> taxonomy. Published by the Mycobacteriosis   Research Laboratory of the National Chubu Hospital, Obu, Aichi, 474, Japan,   1984.</FONT></LI>          ]]></body>
<body><![CDATA[<LI>   <FONT SIZE=-1>Sneath PHA. Some thoughts on bacterial classification. J   Gen Microbiol 1957;17:184.</FONT></LI>          <LI>   <FONT SIZE=-1>Sneath PHA. The application of computer to toxonomy. J Gen   Microbiol 1957;17:201.</FONT></LI>          <LI>   <FONT SIZE=-1>Tsukamura M, Mizuno S. Numerical analysis of relationship   among rapidly growing, scotochromogenic mycobacteria. J Gen Microbiol 1977;98:511-7.</FONT></LI>       </OL>   <FONT SIZE=-1>Recibido: 7 de agosto de 1995. Aprobado: 10 de abril de 1996.</FONT>          <P><FONT SIZE=-1>Dra. <I>Caridad Ferr&aacute; Salazar</I>. Instituto de Medicina    Tropical "Pedro Kour&iacute;". Apartado 601, Marianao 13, Ciudad de La Habana,    Cuba.</FONT>      </body>   </HTML>        ]]></body><back>
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