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<article-title xml:lang="es"><![CDATA[Aplicación de la técnica de reacción en cadena de la polimerasa para la detección de secuencias de Papillomavirus humano]]></article-title>
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<abstract abstract-type="short" xml:lang="en"><p><![CDATA[The polymerase chain reaction technique was applied to detect sequences of human Papillomavirus (HPV) by controls of cellular lines of cervical cancer and of tissues obtained through biopsy with a HPV-positive clinical diagnosis. A set of consensus oligonucleotides, which are complementary to a highly conserved region within the open reading frame El of the viral genome of HPV affecting the cervical mucosa, was used. With these primers it was possible to amplify DNA sequences corresponding to HPV 6 and 11, considered in the low risk group, and to HPV 16, 18, 31 and 33, included in the high risk group. The study of the sensitivity of the amplification technique showed a level of detection of 3,5 viral particles per each cellular diploid genome.]]></p></abstract>
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<kwd lng="es"><![CDATA[PAPILLOMAVIRUS HUMANO]]></kwd>
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</front><body><![CDATA[ <P>Instituto de Medicina Tropical "Pedro Kour&iacute;" </P> <H2>Aplicaci&oacute;n de la t&eacute;cnica de reacci&oacute;n en cadena de la polimerasa para la detecci&oacute;n de secuencias de <I>Papillomavirus </I>humano</H2>     <P><A HREF="#autores"><I>Lic. Yudira Soto,<SUP>1</SUP> Lic. Mayra Mun&eacute;,<SUP>2</SUP> Dra. Adibel Goicolea,<SUP>3</SUP> Dra. Estrella Morales,<SUP>3</SUP> Lic. Jean Michell Santoyo,<SUP>4</SUP> Lic. Odalys Vald&eacute;s,<SUP>5</SUP> Lic. Rosa Ram&iacute;rez<SUP>5</SUP> y T&eacute;c. Tamara Pimentel<SUP>6</sup></I></A> </P> <H4>Resumen</H4>     <P>Se aplic&oacute; la t&eacute;cnica de reacci&oacute;n en cadena de la polimerasa para la detecci&oacute;n de secuencias de Papillomavirus humano (PVH) mediante controles de l&iacute;neas celulares de c&aacute;ncer cervical y tejidos obtenidos por biopsia con diagn&oacute;stico cl&iacute;nico positivo a PVH. Se utiliz&oacute; un juego de oligonucle&oacute;tidos consenso, que son complementarios a una regi&oacute;n altamente conservada dentro del marco de lectura abierta E1 del genoma viral de los PVH que afectan la mucosa cervical. Con este juego de cebadores fue posible amplificar secuencias de &aacute;cido desoxirribonucleico (ADN) correspondientes a los PVH 6 y 11, considerados dentro del grupo de bajo riesgo y de los PVH 16, 18, 31 y 33 comprendidos en el grupo de alto riego. El estudio de la sensibilidad de la t&eacute;cnica de amplificaci&oacute;n arroj&oacute; como resultado un nivel de detecci&oacute;n de 3,5 part&iacute;culas virales por cada genoma diploide celular. </P>     <P>Descriptores DeCS: PAPILLOMAVIRUS HUMANO/gen&eacute;tica; REACCION EN CADENA POR POLIMERASA/m&eacute;todos; ANALISIS DE SECUENCIA DE ADN/m&eacute;todos; GENOMA VIRAL; ADN VIRAL/gen&eacute;tica. </P>     <P>La familia <I>Papovaviridae</I> est&aacute; constituida por un grupo heterog&eacute;neo de virus. Hasta el presente han sido identificados 77 genotipos diferentes de Papillomavirus en humanos. En la actualidad se ha podido determinar de forma parcial la secuencia de aproximadamente 30 tipos adicionales de Papillomavirus humanos (PVH), lo cual sugiere la existencia de un n&uacute;mero total de 100 genotipos de PVH. De los 77 tipos cuyas secuencias han sido estudiadas por completo, m&aacute;s de 40 infectan la mucosa cervical y representan un grupo importante de pat&oacute;genos que producen enfermedades de origen epitelial.<SUP>1</SUP> La infecci&oacute;n por PVH tiene una alta incidencia y demostrada asociaci&oacute;n con el c&aacute;ncer cervical.<SUP>2</SUP> Una de las m&aacute;s fuertes evidencias de la funci&oacute;n que desempe&ntilde;a este virus en la carcinog&eacute;nesis lo constituye la presencia del ADN viral en m&aacute;s del 90 % de los carcinomas celulares escamosos del tracto genital.<SUP>3,4</SUP> Se reconoce la v&iacute;a sexual como la m&aacute;s com&uacute;n de diseminaci&oacute;n del virus.<SUP>5</SUP> </P>     <P>La infecci&oacute;n del cuello uterino por PVH puede ser asintom&aacute;tica o provocar una serie de manifestaciones que var&iacute;an desde la presencia de condilomas benignos hasta la ocurrencia de alteraciones displ&aacute;sicas de diferentes grados y c&aacute;ncer. La distinci&oacute;n de los diferentes estadios patol&oacute;gicos tiene un alto valor pron&oacute;stico ya que mientras los condilomas casi siempre permanecen como lesiones benignas, las neoplasias intraepiteliales cervicales (NIC) tienen una alta potencialidad de progresar al c&aacute;ncer invasivo.<SUP>6</SUP> </P>     <P>Debido a la falta de un sistema celular susceptible para el aislamiento e identificaci&oacute;n del virus y a la ausencia de pruebas serol&oacute;gicas adecuadas, el diagn&oacute;stico de la infecci&oacute;n por PVH ha estado basado fundamentalmente en la detecci&oacute;n del &aacute;cido nucleico viral.<SUP>7</SUP> </P>     <P>Desde la introducci&oacute;n de la reacci&oacute;n en cadena de la polimerasa (RCP) como nueva t&eacute;cnica para el diagn&oacute;stico, el estudio y an&aacute;lisis del ADN sufri&oacute; un vuelco tanto al nivel cl&iacute;nico como al investigativo. El m&eacute;todo involucra la amplificaci&oacute;n selectiva de secuencias espec&iacute;ficas de &aacute;cidos nucleicos mediante s&iacute;ntesis enzim&aacute;tica, y constituye hasta el momento la t&eacute;cnica m&aacute;s sensible empleada en la detecci&oacute;n del ADN de PVH. La RCP permite identificar un solo tipo viral, con la utilizaci&oacute;n de cebadores que se unan a secuencias espec&iacute;ficas de &eacute;ste o puede detectar un amplio espectro de tipos mediante cebadores generales o consenso.<SUP>8</SUP> </P>     <P>El presente trabajo tiene como objetivo aplicar la tecnolog&iacute;a de la RCP para la detecci&oacute;n de ADN de PVH empleando un juego de oligonucle&oacute;tidos consenso correspondiente a una regi&oacute;n altamente conservada dentro del genoma viral (regi&oacute;n E1). Con estos cebadores nos propusimos determinar la sensibilidad y factibilidad de la t&eacute;cnica para amplificar secuencias de los tipos de PVH que se presentan con mayor frecuencia en el tracto genital. <I>Contorni y Leoncini</I><SUP>9</SUP> publicaron las secuencias de estos cebadores para su empleo en la amplificaci&oacute;n de muestras parafinadas. Sin embargo, en nuestras condiciones, nos trazamos introducir la modificaci&oacute;n de aplicar esta metodolog&iacute;a a la detecci&oacute;n de secuencias de PVH en muestras frescas de tejidos endocervicales obtenidos por biopsia con un diagn&oacute;stico cl&iacute;nico sugestivo de infecci&oacute;n por PVH. </P> <H4>M&eacute;todos</H4>     <P><I>Cultivos celulares y clones de PVH.</i> Se emplearon las l&iacute;neas de c&aacute;ncer cervical humano Siha, Hela y CaSki obtenidas de la <I>American Type Culture Collection.</I> La l&iacute;nea Siha contiene una copia de PVH 16 por cada genoma celular, la Hela contiene entre 10 y 50 copias de PVH 18 y la CaSki entre 400 y 500 copias de PVH 16. Los cultivos se realizaron en medio Eagle suplementado con suero de ternera fetal al 10 % y se incubaron a 37 <sup>o</sup>C hasta que el crecimiento celular se hizo confluente. Estas l&iacute;neas celulares fueron sometidas a extracci&oacute;n de ADN y fueron utilizadas como controles positivos para ser empleados en la reacci&oacute;n de amplificaci&oacute;n. </P>     ]]></body>
<body><![CDATA[<P>Los genomas completos de PVH 6, 11, 16 y 18 clonados en el pl&aacute;smido pBR 322 fueron donados gentilmente por el Departamento de Gen&eacute;tica del Hospital Clinicoquir&uacute;rgico "Hermanos Ameijeiras". La extracci&oacute;n de las bandas de PVH empleadas en la reacci&oacute;n de amplificaci&oacute;n se realiz&oacute; por digesti&oacute;n con Bam HI <I>(</I>Amersham) para los tipos 6, 11 y 16, y con Eco RI (Amersham) para el tipo 18. Las bandas fueron purificadas mediante la t&eacute;cnica de agarosa de bajo punto de fusi&oacute;n.<SUP>10</SUP> </P>     <P><I>Tejidos endocervicales obtenidos por biopsia.</i> Se estudiaron para la reacci&oacute;n de amplificaci&oacute;n 10 muestras de tejidos endocervicales obtenidos por biopsia a partir de pacientes que asistieron a la consulta de patolog&iacute;a de cuello del Hospital Ginecoobst&eacute;trico "Eusebio Hern&aacute;ndez". El empleo de biopsias frescas constituye una modificaci&oacute;n del protocolo original de <I>Contorni y Leoncini</I>,<SUP>9</SUP> quienes describieron esta metodolog&iacute;a para ser empleada en muestras parafinadas. El criterio de selecci&oacute;n de este tipo de muestra fue la presencia de alteraciones citol&oacute;gicas que revelaran la presencia de infecci&oacute;n por PVH y que comprendieron coilocitosis abundante y NIC de diferentes grados,<SUP>11</SUP> incluidas dentro de las categor&iacute;as 3, 4, 5 y 6 del sistema de clasificaci&oacute;n establecido por la OMS en 1984. Adem&aacute;s, estas muestras presentaban un diagn&oacute;stico cl&iacute;nico por colposcopia t&iacute;pico de infecci&oacute;n por PVH. Las biopsias fueron transportadas a 4 <sup>o</sup>C en tubos de congelaci&oacute;n con una soluci&oacute;n salina fosfatada al 0,01 % de duodecil sulfato de sodio (PBS-SDS) y se almacenaron a -70 <sup>o</sup>C hasta su procesamiento. </P>     <P><I>Extracci&oacute;n de ADN de los cultivos celulares.</i> Cuando el crecimiento se hizo confluente, las c&eacute;lulas fueron desprendidas por tripsinizaci&oacute;n y lavadas con PBS 1X. Despu&eacute;s se centrifugaron a 3 500 rpm (centr&iacute;fuga GR. 4.11, Jouan) y el sedimento se resuspendi&oacute; en 500 <FONT FACE=Symbol>m</FONT>L de <I>buffer</I> lisis (Tris 10 mM pH 8, EDTA 10 mM, NaCl 10 mM, SDS 0,5 %). </P>     <P>Los detritos celulares se eliminaron centrifugando a 12 000 rpm (centr&iacute;fuga D7200, Hettich) y el sobrenadante fue tratado durante 1 h a 56 <sup>o</sup>C con 30 U de proteinasa K (25 mg/mL); seguidamente se realizaron 2 extracciones de prote&iacute;nas con fenol y fenol-cloroformo-alcohol isoam&iacute;lico (25:24:1) con sus respectivas centrifugaciones a 12 000 rpm. El ADN se precipit&oacute; con 2,5 vol&uacute;menes de etanol absoluto y 1/10 de volumen de acetato de sodio 3 M pH 5,3 toda la noche a -20 <sup>o</sup>C. </P>     <P>Al d&iacute;a siguiente se centrifug&oacute; durante 30 min a 12 000 rpm, el precipitado se lav&oacute; con etanol al 70 %, se sec&oacute; al vac&iacute;o (Speed vac CHIST 1131, Blanc Labo) y fue resuspendido en 20 <FONT FACE=Symbol>m</FONT>L de agua bidestilada est&eacute;ril. La calidad del proceso de extracci&oacute;n se determin&oacute; mediante una electroforesis en gel de agarosa al 0,8 % en tamp&oacute;n Tris-Borato-EDTA (TBE) y la visualizaci&oacute;n se realiz&oacute; por tinci&oacute;n con bromuro de etidio en un transiluminador (Macrovue 2011, LKB). La concentraci&oacute;n de ADN en todos los casos se determin&oacute; en un espectrofot&oacute;metro (1135, Unican).<SUP>10</SUP> </P>     <P><I>Extracci&oacute;n de ADN de los tejidos endocervicales.</i> Los fragmentos de tejidos de aproximadamente 3 mm<SUP>3 </SUP>se resuspendieron en 500 <FONT FACE=Symbol>m</FONT>L de <I>buffer</I> lisis (Tris 10 mM pH 8, EDTA 10 mM, NaCl 10 mM, SDS 0,5 %). Para lograr la ruptura del tejido se utilizaron 20 <FONT FACE=Symbol>m</FONT>L de SDS (10 %) y 40 <FONT FACE=Symbol>m</FONT>L de proteinasa K (25 mg/<FONT FACE=Symbol>m</FONT>L), y se incubaron entre 2 y 3 h a 56 <sup>o</sup>C. Las prote&iacute;nas celulares se eliminaron por extracci&oacute;n volumen/volumen con fenol-cloroformo-alcohol isoam&iacute;lico (25:24:1) y la precipitaci&oacute;n del ADN se efectu&oacute; con etanol absoluto y acetato de sodio. El ADN fue resuspendido en 20 <FONT FACE=Symbol>m</FONT>L de agua bidestilada est&eacute;ril y la calidad del proceso de extracci&oacute;n se determin&oacute; de igual forma que en los cultivos celulares. </P>     <P><I>Reacci&oacute;n en cadena de la polimerasa.</i> Los cebadores utilizados son complementarios a una secuencia nucleot&iacute;dica del ORF E1 que aparece con un alto nivel de conservaci&oacute;n entre los PVH asociados con las lesiones de la mucosa cervical. Sus secuencias son consideradas "secuencias consenso" ya que son capaces de amplificar regiones del genoma de 6 tipos virales muy frecuentes en el tracto genital (PVH 6, 11, 16, 18, 31 y 33) y generan un fragmento cuya talla oscila entre 577 y 594 pb en dependencia del tipo de PVH que se somete a la reacci&oacute;n de amplificaci&oacute;n.<SUP>9</SUP> </P>     <P>La reacci&oacute;n de amplificaci&oacute;n se realiz&oacute; utilizando 1 ng del genoma de los tipos de PVH 6, 11, 16 y 18; 10 ng de ADN de los cultivos celulares Hela y CaSki; 100 ng de ADN extra&iacute;do de la l&iacute;nea celular Siha y 100 ng de ADN proveniente de las biopsias endocervicales en un volumen final de 100 <FONT FACE=Symbol>m</FONT>L. Se incluyeron como controles negativos 10 ng de ADN de fibroblastos humanos, agua bidestilada est&eacute;ril, as&iacute; como 100 ng de ADN proveniente de una muestra de tejido endocervical negativa a PVH por la t&eacute;cnica de Southern blot. </P>     <P>La mezcla de reacci&oacute;n estuvo constituida por 10 <FONT FACE=Symbol>m</FONT>L del <I>buffer</I> de amplificaci&oacute;n 10X (KCl 500 mM, Tris-HCl 100 mM pH 8,3; MgCl<SUB>2</SUB> 15 mM, gelatina 0,01 %), 200 mM de cada dNTP, 2,5 unidades de Taq<I>.</I> polimerasa (IPK), 50 pM de cada cebador y agua bidestilada est&eacute;ril; posteriormente se procedi&oacute; a efectuar la reacci&oacute;n de amplificaci&oacute;n.<SUP>9</SUP> </P>     <P>Para la detecci&oacute;n del producto amplificado se analizaron 10 <FONT FACE=Symbol>m</FONT>L de cada producto de reacci&oacute;n en una electroforesis en gel de agarosa al 1,2 % en tamp&oacute;n TBE. La visualizaci&oacute;n se realiz&oacute; por coloraci&oacute;n con bromuro de etidio. </P>     ]]></body>
<body><![CDATA[<P><I>Sensibilidad de la reacci&oacute;n de amplificaci&oacute;n.</i> La sensibilidad del ensayo para este juego de oligos es un aspecto que incluimos a la metodolog&iacute;a original descrita por <I>Contorni y Leoncini</I>. Para ello se realizaron diluciones del genoma de PVH 18 en 100 ng de ADN de placenta humana. Las diluciones abarcaron un amplio rango de concentraciones del genoma del virus (1 ng, 100 pg, 10 pg, 1 pg, 100 fg, 10 fg , 1 fg y 0,1 fg/<FONT FACE=Symbol>m</FONT>L) y se amplificaron y visualizaron bajo las mismas condiciones y par&aacute;metros descritos anteriormente. </P>     <P>Los fragmentos originados a partir de la banda de PVH 18 fueron sometidos a una hibridaci&oacute;n Southern blot. La sonda utilizada fue el genoma completo de PVH 18 marcado mediante el m&eacute;todo de <I>random primer</I> o marcaje al azar.<SUP>10</SUP> Se emplearon 20 unidades de la enzima Klenow (Promega) para marcar 100 ng de ADN de PVH 18 en presencia de 50 <FONT FACE=Symbol>m</FONT>Ci de <FONT FACE=Symbol>a</FONT> P32dATP (Amersham).<SUP>12</SUP> </P>     <P><I>An&aacute;lisis de restricci&oacute;n.</i> Los productos amplificados a partir del ADN de las l&iacute;neas celulares y de las bandas de los PVH 6, 11, 16 y 18 fueron tratados con fenol-cloroformo-alcohol isoam&iacute;lico (25:24:1), precipitados con etanol absoluto y resuspendidos en un volumen final de 50 <FONT FACE=Symbol>m</FONT>L. Para la digesti&oacute;n enzim&aacute;tica se adicionaron 2 unidades de la enzima Alu I (Promega) y 5 <FONT FACE=Symbol>m</FONT>L del <I>buffer</I> de digesti&oacute;n H 10X (Promega), se incub&oacute; a 37 <sup>o</sup>C durante 2 h. Los patrones de digesti&oacute;n se analizaron en electroforesis en gel de agarosa al 1,2 % en tamp&oacute;n TBE, a 80 V durante 1 h.<SUP>9</SUP> </P> <H4>Resultados</H4>     <P>La extracci&oacute;n de ADN a partir de tejidos endocervicales obtenidos por biopsias result&oacute; exitosa empleando la metodolog&iacute;a descrita, al obtener un &aacute;cido nucleico con calidad y concentraci&oacute;n adecuadas para su empleo &oacute;ptimo en la RCP. En todos los casos la con-centraci&oacute;n del ADN extra&iacute;do fue de aproximadamente 200 ng/<FONT FACE=Symbol>m</FONT>L (fig. 1). </P>     <P ALIGN="CENTER"><A HREF="/img/revistas/mtr/v50n3/f0104398.gif"><IMG SRC="/img/revistas/mtr/v50n3/f0104398.gif" BORDER=0 WIDTH=166 HEIGHT=143 ALT="Figura 1"></A></P>     
<P>Fig. 1. Extracci&oacute;n de ADN a partir de tejidos endocervicales obtenidos por biopsia y de tejidos de l&iacute;neas celulares de c&aacute;ncer cervical. En todos los casos la concentraci&oacute;n del ADN extra&iacute;do de estas muestras empleadas como controles positivos fue de aproximadamente 200 ng/<FONT FACE=Symbol>m</FONT>L. Los carriles 1, 2, 3 y 4 corresponden a ADN de tejidos endocervicales de pacientes; y los carriles 5, 6 y 7 corresponden a ADN de tejidos de l&iacute;neas celulares, Siha, Hela y CaSki, de forma respectiva M ( <FONT FACE=Symbol>l </FONT>ADN Hind III). </P>     <P>La RCP de los genomas completos de PVH 6, 11, 16 y 18 revel&oacute; la presencia de una banda con igual intensidad y peque&ntilde;as diferencias en la talla para cada genotipo viral (PVH 6 y 11-577 pb; PVH 16-583 pb; PVH 18-595 pb) al ser analizados 10 <FONT FACE=Symbol>m</FONT>L del producto amplificado en una electroforesis en gel de agarosa al 2 % (fig. 2). </P>     <P ALIGN="CENTER"><A HREF="/img/revistas/mtr/v50n3/f0204398.gif"><IMG SRC="/img/revistas/mtr/v50n3/f0204398.gif" BORDER=0 WIDTH=154 HEIGHT=159 ALT="Figura 2"></A></P>     
<P>Fig. 2. Productos amplificados a partir de los genomas completos de PVH 6, 11, 16 y 18. Las bandas amplificadas oscilan en un rango entre 577 y 595 pb. M(pBR 322 Hae III). </P>     <P>Los productos amplificados a partir de 10 ng de ADN proveniente de las l&iacute;neas celulares Hela y CaSki y de 100 ng de ADN de Siha rindieron bandas cuyas tallas se corresponden con las de los genotipos virales integrados a sus respectivos cromosomas (fig. 3). La cantidad final de producto amplificado fue dependiente del sustrato disponible, ya que al utilizar 1 ng del genoma de los diferentes tipos de PVH se obtuvieron cantidades comparables de productos de la RCP (bandas de igual intensidad) y por otra parte, al emplear 10 ng de ADN de las l&iacute;neas celulares, se obtuvieron productos de amplificaci&oacute;n proporcionales al n&uacute;mero de copias virales integradas a los cromosomas celulares (bandas con diferente intensidad; en orden creciente: Hela y CaSki). </P>     ]]></body>
<body><![CDATA[<P ALIGN="CENTER"><A HREF="/img/revistas/mtr/v50n3/f0304398.gif"><IMG SRC="/img/revistas/mtr/v50n3/f0304398.gif" BORDER=0 WIDTH=166 HEIGHT=145 ALT="Figura 3"></A></P>     
<P>Fig. 3. Productos amplificados a partir de los genomas de PVH 6, 11, 16 y 18 y del ADN extra&iacute;do de las l&iacute;neas celulares Siha (S), Hela (H) y CasKi (C). M1 (<FONT FACE=Symbol>l </FONT>Hind III/EcoR 1), M2 (pBR 322/Hae III), FH (fibroblastos humanos). </P>     <P>En la figura 4 se muestran los resultados del ensayo de sensibilidad. Como puede apreciarse se obtuvo una amplificaci&oacute;n evidente hasta la cuarta diluci&oacute;n del genoma de PVH 18, correspondiente a 1 pg de ADN viral diluido en 100 ng de ADN de placenta humana, lo que significa que la t&eacute;cnica utilizada es capaz de detectar 3,5 genomas virales por cada genoma diploide celular. </P>     <P ALIGN="CENTER"><A HREF="/img/revistas/mtr/v50n3/f0404398.gif"><IMG SRC="/img/revistas/mtr/v50n3/f0404398.gif" BORDER=0 WIDTH=199 HEIGHT=198 ALT="Figura 4"></A></P>     
<P>Fig. 4. Resultados del ensayo de sensibilidad en el que se emplearon diluciones del genoma de PVH 18. Las diluciones seriadas de base 10 se realizaron desde 1ng hasta 0,1 fg. Se obtuvo amplificaci&oacute;n hasta la cuarta diluci&oacute;n (1 pg). </P>     <P>La hibridaci&oacute;n a que fueron sometidos los productos de la reacci&oacute;n de amplificaci&oacute;n permiti&oacute; detectar la presencia del ADN viral hasta 1 pg (fig. 5). </P>     <P ALIGN="CENTER"><A HREF="/img/revistas/mtr/v50n3/f0504398.gif"><IMG SRC="/img/revistas/mtr/v50n3/f0504398.gif" BORDER=0 WIDTH=186 HEIGHT=177 ALT="Figura 5"></A></P>     
<P>Fig. 5. Resultados del Southern blot a que fueron sometidos los productos amplificados en el ensayo de sensibilidad. Se detecta una se&ntilde;al de amplificaci&oacute;n hasta 1 pg (cuarta diluci&oacute;n). </P>     <P>La aplicaci&oacute;n de la RCP a la detecci&oacute;n del genoma de PVH en tejidos de biopsias endocervicales y el posterior an&aacute;lisis de los productos amplificados mediante una electroforesis en gel de agarosa al 1,2 %, revel&oacute; la presencia de una simple banda con la talla esperada en los 10 casos empleados como controles positivos. Las diferencias que existen en la intensidad y talla de las bandas obtenidas se deben a que las concentraciones de ADN de cada muestra difieren en cada uno de los casos (fig. 6). </P>     <P ALIGN="CENTER"><A HREF="/img/revistas/mtr/v50n3/f0604398.gif"><IMG SRC="/img/revistas/mtr/v50n3/f0604398.gif" BORDER=0 WIDTH=262 HEIGHT=149 ALT="Figura 6"></A></P>     
]]></body>
<body><![CDATA[<P>Fig. 6. Aplicaci&oacute;n de la RCP a la detecci&oacute;n de genomas de PVH a partir de ADN de tejidos endocervicales obtenidos por biopsia. Los carriles 3, 5, 8, 10, 12, 13, 14, 15, 16 y 17 se corresponden con los 10 casos empleados como controles positivos, los carriles 1, 2, 4, 6, 7, 9 11 y 18 se corresponden con los controles negativos. </P>     <P>El an&aacute;lisis de restricci&oacute;n con Alu I de los productos amplificados a partir del genoma de los PVH del grupo de bajo riesgo (tipos 6 y 11) muestra el mismo patr&oacute;n de restricci&oacute;n (un fragmento &uacute;nico de 555 pb), mientras que la digesti&oacute;n de los productos de la RCP de los PVH del grupo de alto riesgo mostr&oacute; un patr&oacute;n caracter&iacute;stico para cada tipo: PVH 16 (343, 240 pb); PVH 18 (267, 238, 90 pb). Las l&iacute;neas celulares Siha y CaSki contienen integrado en sus cromosomas el genoma de PVH 16, y la l&iacute;nea Hela contiene copias de PVH 18. La digesti&oacute;n con Alu I de los productos de la RCP a que fueron sometidos los ADN de estas l&iacute;neas, mostr&oacute; patrones de restricci&oacute;n coincidentes con los obtenidos para cada tipo viral integrado a sus cromosomas (fig. 7). </P>     <P ALIGN="CENTER"><A HREF="/img/revistas/mtr/v50n3/f0704398.gif"><IMG SRC="/img/revistas/mtr/v50n3/f0704398.gif" BORDER=0 WIDTH=223 HEIGHT=227 ALT="Figura 7"></A></P>     
<P>Fig. 7. Digesti&oacute;n con Alu I de los productos amplificados a partir de los genomas completos de PVH 6, PVH 11, PVH 16 y PVH 18, y de las l&iacute;neas celulares Siha (S), Hela (H) y CaSki (K). M1 (<FONT FACE=Symbol>l </FONT>ADN/Hind III/ EcoRI), M2 (pBr 322/Hae III). </P> <H4>Discusi&oacute;n</H4>     <P>Muchas evidencias apoyan que los PVH pueden desempe&ntilde;ar una funci&oacute;n importante en el desarrollo del c&aacute;ncer cervical, y que la detecci&oacute;n del ADN viral en las lesiones constituya actualmente la m&aacute;s importante herramienta diagn&oacute;stica en la identificaci&oacute;n del agente. Desde hace varios a&ntilde;os la RCP ha brindado resultados alentadores en la detecci&oacute;n de los PVH, y ofrece la posibilidad de identificar y tipificar el virus de una forma r&aacute;pida y f&aacute;cil.<SUP>8</SUP> </P>     <P>En los primeros estudios realizados utilizando la RCP se emplearon diferentes juegos de cebadores espec&iacute;ficos para cada tipo viral, pero el posterior desarrollo de los protocolos de trabajo trajo como resultado el empleo de un solo juego de oligonucle&oacute;tidos para detectar un amplio espectro de tipos virales.<SUP>13,14</SUP> </P>     <P>De los 30 tipos de PVH que son capaces de infectar la mucosa cervical, los tipos 6 y 11 son los m&aacute;s comunes en los condilomas acuminados y en las NIC de bajo grado, el tipo 16 es el m&aacute;s frecuente en las lesiones malignas y el PVH 18 es el que m&aacute;s se detecta en los carcinomas cervicales con un curso cl&iacute;nico agresivo.<SUP>15</SUP> </P>     <P>En nuestro estudio, el empleo de un juego de oligos consenso dise&ntilde;ados a partir de una regi&oacute;n altamente conservada del ORF E1, nos permiti&oacute; la amplificaci&oacute;n de un fragmento de 577 a 595 pb del genoma de los 6 tipos de PVH mucosotr&oacute;picos m&aacute;s frecuentes en la poblaci&oacute;n mundial, que constituye un sustrato adecuado para la tipificaci&oacute;n de &eacute;stos mediante enzimas de restricci&oacute;n.<SUP>9</SUP> La comparaci&oacute;n de los fragmentos amplificados con el patr&oacute;n de peso molecular permite comprobar que cada producto de la RCP presenta la talla adecuada. El empleo de un solo juego de cebadores en la detecci&oacute;n de 4 tipos de PVH simplifica el trabajo en el muestreo masivo, minimiza la manipulaci&oacute;n excesiva y el alto costo del diagn&oacute;stico que implicar&iacute;a el uso de cebadores espec&iacute;ficos para la identificaci&oacute;n de cada tipo viral por separado. </P>     <P>En nuestro trabajo los cebadores fueron capaces de amplificar de forma eficiente tanto los genomas correspondientes a cada clon de PVH, los genomas virales integrados a los cromosomas de las l&iacute;neas celulares empleadas como controles positivos; as&iacute; como los fragmentos de ADN viral presentes en las 10 muestras de tejido endocervical. El empleo de biopsias frescas constituye una modificaci&oacute;n del protocolo original descrito por <I>Contorni y Leoncini</I>,<SUP>9</SUP> quienes describieron el empleo de estos oligos consenso para ser empleados en la amplificaci&oacute;n de ADN de PVH en muestras parafinadas. </P>     <P>En este estudio hemos seguido una estrategia similar a la utilizada en otros trabajos publicados. El empleo de un juego de oligos consenso dise&ntilde;ados a partir del an&aacute;lisis de secuencias del ORF L1, permiti&oacute; detectar 11 genotipos de PVH asociados con lesiones de la mucosa cervical.<SUP>16</SUP> </P>     ]]></body>
<body><![CDATA[<P>En 1991, se reporta un trabajo que se apoy&oacute; en las secuencias conservadas del ORF E6 para utilizar un juego de cebadores en la amplificaci&oacute;n de 5 genotipos virales que fueron tipificados por Southern Blot.<SUP>17</SUP> Dos a&ntilde;os m&aacute;s tarde un grupo de investigadores desarroll&oacute; un protocolo que permiti&oacute; la detecci&oacute;n de 33 tipos de PVH cut&aacute;neos y genitales a partir de la amplificaci&oacute;n de una secuencia conservada del ORF E1.<SUP>14</SUP> En otro trabajo se analiz&oacute; el ORF L1 para la s&iacute;ntesis de un juego de cebadores consenso que permiti&oacute; la diferenciaci&oacute;n en grupos con diferentes comportamientos biol&oacute;gicos de 18 tipos de PVH.<SUP>8</SUP> </P>     <P>El an&aacute;lisis computadorizado de las secuencias de ADN de los diferentes tipos de PVH revela que las regiones m&aacute;s conservadas se localizan en los ORF L1 y E1. Durante la integraci&oacute;n del genoma viral al cromosoma celular se producen deleciones en la regi&oacute;n E1/E2 que inducen a muchos investigadores a la utilizaci&oacute;n de secuencias de los ORF L1 y E6 que no son clivadas durante la integraci&oacute;n.<SUP>18</SUP> En nuestro trabajo se utilizan oligonucle&oacute;tidos correspondientes a la regi&oacute;n 5’del ORF E1, que se mantiene intacta despu&eacute;s del proceso de integraci&oacute;n y posibilita la detecci&oacute;n de PVH mediante la RCP sin que se produzcan resultados falsos positivos. </P>     <P>Se plantea que el contenido de ADN de una c&eacute;lula humana es de aproximadamente 5 pg, pudi&eacute;ndose inferir que en 100 ng de ADN de placenta existen cerca de 20 000 c&eacute;lulas. Tambi&eacute;n se conoce que en 1 pg de ADN de PVH hay involucrados unos 70 000 genomas virales.<SUP>14,16</SUP> La relaci&oacute;n que se establece entre los planteamientos anteriores y los resultados del ensayo de sensibilidad (70 000/20 000) permiten concluir que nuestro sistema es capaz de detectar 3,5 part&iacute;culas virales por cada genoma diploide celular. </P>     <P>Los resultados obtenidos en el ensayo de sensibilidad, aspecto &eacute;ste que tambi&eacute;n ha sido agregado a la metodolog&iacute;a original como una modificaci&oacute;n, son comparables a los reportados por otros investigadores. En un estudio en el que se aplic&oacute; la RCP para la identificaci&oacute;n de tipos cut&aacute;neos y genitales de PVH se demostr&oacute; que el m&eacute;todo pod&iacute;a detectar entre 0,3 y 3 part&iacute;culas virales por cada genoma diploide celular. Otro trabajo realizado en el que se utilizaron cebadores consenso para la detecci&oacute;n de un amplio espectro de tipos de PVH, report&oacute; un nivel de detecci&oacute;n de 0,1 a 1 pg de ADN de PVH.<SUP>14,16</SUP> </P>     <P>La detecci&oacute;n del ADN de PVH en 10 biopsias endocervicales demuestra que la RCP descrita en este estudio, no s&oacute;lo detecta el genoma viral purificado o integrado al cromosoma de las l&iacute;neas celulares empleadas como controles; sino que es capaz de amplificar secuencias de PVH de forma eficiente en muestras cl&iacute;nicas de pacientes con alteraciones citol&oacute;gicas donde el ADN viral puede encontrarse integrado por completo, parcialmente o en forma episomal. </P>     <P>La experiencia adquirida hasta el momento por la gran cantidad de investigaciones realizadas en torno a la funci&oacute;n de los PVH en la g&eacute;nesis del c&aacute;ncer cervicouterino, destaca la diferencia notable del porcentaje de positividad a PVH que existe entre mujeres con alteraciones citol&oacute;gicas y las que no presentan ning&uacute;n tipo de afectaci&oacute;n celular. </P>     <P>De manera general, la prevalencia de PVH asociado con alteraciones cervicales alcanza valores entre 50 y 90 % en mujeres con alteraciones citol&oacute;gicas, mientras que s&oacute;lo se reportan valores del 15 al 20 % cuando se analizan mujeres con el c&eacute;rvix normal.17 Al comprobar la utilidad de esta t&eacute;cnica en los controles utilizados queda demostrada la factibilidad de su uso para estudiar la prevalencia de PVH en un gran n&uacute;mero de muestras cl&iacute;nicas a partir de tejidos endocervicales obtenidos por biopsia. </P>     <P>A pesar de que el Southern Blot es considerada la t&eacute;cnica de referencia en el diagn&oacute;stico de PVH, la RCP constituye un m&eacute;todo ideal para la identificaci&oacute;n del genoma viral de un modo r&aacute;pido y relativamente f&aacute;cil en aquellas muestras que rinden peque&ntilde;as cantidades de &aacute;cido nucleico. El empleo de biopsias endocervicales como controles en nuestro trabajo imposibilit&oacute; la utilizaci&oacute;n del Southern Blot en la detecci&oacute;n del virus, ya que se requieren entre 5 y 10 <FONT FACE=Symbol>m</FONT>g de ADN para obtener resultados satisfactorios.<SUP>19</SUP> </P>     <P>Por la alta sensibilidad de la t&eacute;cnica, las contaminaciones pueden constituir un serio problema y dar lugar a resultados falsos positivos. La incorporaci&oacute;n de controles negativos en las reacciones de amplificaci&oacute;n permite un mejor an&aacute;lisis frente a la presencia de resultados falsos positivos causados por contaminaciones o a amplificaciones originadas por una hibridaci&oacute;n inespec&iacute;fica de los cebadores en la RCP (control que contiene agua en lugar de ADN, control que contiene ADN de fibroblastos humanos y control que contiene ADN extra&iacute;do de una muestra de tejido endocervical con citolog&iacute;a normal y negativa a PVH por Southern blot). </P>     <P>El tratamiento de los productos de la RCP con Alu I permite clasificar los PVH que aparecen con mayor frecuencia en las lesiones genitales en 2 grupos con diferentes comportamientos biol&oacute;gicos (alto y bajo riesgos). Para los tipos 6 y 11 que son los m&aacute;s comunes en los condilomas acuminados y las NIC de bajo grado se obtuvo una banda de 555 pb que permite incluirlos dentro del grupo de bajo riesgo. Para los PVH 16 y 18 que son los tipos m&aacute;s frecuentes en las lesiones precancerosas y cancerosas se obtuvieron patrones de restricci&oacute;n caracter&iacute;sticos, que no s&oacute;lo posibilitan su clasificaci&oacute;n dentro del grupo de alto riesgo, sino tambi&eacute;n su tipificaci&oacute;n individual.20 Los resultados que se obtuvieron en este trabajo al digerir los productos amplificados tanto de los genomas de PVH como del ADN de las l&iacute;neas celulares pueden ser utilizados en la tipificaci&oacute;n de PVH presentes en muestras cl&iacute;nicas de tejidos endocervicales. Los patrones de digesti&oacute;n que se obtuvieron para cada tipo viral coinciden con los reportados en un ensayo similar realizado para la detecci&oacute;n de PVH en tejidos endocervicales embebidos en parafina.<SUP>9</SUP> </P>     ]]></body>
<body><![CDATA[<P>Existen estudios donde la tipificaci&oacute;n se realiza empleando varias enzimas de restricci&oacute;n. En estos casos la complejidad del an&aacute;lisis de los patrones de digesti&oacute;n, as&iacute; como el alto costo de las enzimas, permite corroborar las ventajas de la tipificaci&oacute;n utilizando una sola enzima de restricci&oacute;n con la que se obtienen resultados f&aacute;ciles de interpretar porque los patrones de restricci&oacute;n para los PVH de alto y bajo riesgos difieren notablemente.<SUP>4</SUP> </P> <H4>Summary</H4>     <P>The polymerase chain reaction technique was applied to detect sequences of human Papillomavirus (HPV) by controls of cellular lines of cervical cancer and of tissues obtained through biopsy with a HPV-positive clinical diagnosis. A set of consensus oligonucleotides, which are complementary to a highly conserved region within the open reading frame El of the viral genome of HPV affecting the cervical mucosa, was used. With these primers it was possible to amplify DNA sequences corresponding to HPV 6 and 11, considered in the low risk group, and to HPV 16, 18, 31 and 33, included in the high risk group. The study of the sensitivity of the amplification technique showed a level of detection of 3,5 viral particles per each cellular diploid genome. </P>     <P>Subject headings: PAPILLOMAVIRUS, HUMAN/genetics; POLYMERASE CHAIN REACTION/methods; SEQUENCE ANALYSIS DNA/methods; GENOME, VIRAL; DNA, VIRAL/genetics. </P> <H4>Referencias Bibliogr&aacute;ficas</H4> <OL>      <!-- ref --><LI>Hausen H. Zur: Papillomavirus infections - a major cause of human cancers. Biochim Biophis Acta 1996;1288:55-78.</LI>    <!-- ref --><LI>Franco EL. Viral etiology of cervical cancer: a critique of the evidence. Rev Infec Dis 1991;13:1195-206.</LI>    <!-- ref --><LI>Roman A, Fife KA. Human papillomaviruses: are we ready to type? J Clin Microbiol 1993;2:166:190.</LI>    <!-- ref --><LI>Yoshikawa H, Kawama T, Kitagawa K. 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IPK.</LI>     <LI>Especialista de I Grado en Ginecolog&iacute;a y Obstetricia. Hospital Ginecoobst&eacute;trico "Eusebio Hern&aacute;ndez".</LI>     <LI>Licenciado en Microbiolog&iacute;a. IPK.</LI>     ]]></body>
<body><![CDATA[<LI>Licenciada en Bioqu&iacute;mica. Aspirante a Investigadora. IPK.</LI>     <LI>T&eacute;cnica en Procesos biol&oacute;gicos. IPK.</LI>    </OL>      ]]></body><back>
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