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<article-title xml:lang="es"><![CDATA[Normalización de un sistema de reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real para la cuantificación del herpesvirus humano 8]]></article-title>
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<institution><![CDATA[,Laboratorio de Infecciones de Transmisión Sexual Departamento de Virología Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí.]]></institution>
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<self-uri xlink:href="http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&amp;pid=S0375-07602009000200003&amp;lng=en&amp;nrm=iso"></self-uri><self-uri xlink:href="http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_abstract&amp;pid=S0375-07602009000200003&amp;lng=en&amp;nrm=iso"></self-uri><self-uri xlink:href="http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_pdf&amp;pid=S0375-07602009000200003&amp;lng=en&amp;nrm=iso"></self-uri><abstract abstract-type="short" xml:lang="es"><p><![CDATA[OBJETIVO: normalizar un sistema de reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real para determinar la carga viral del herpesvirus humano 8, en diferentes muestras clínicas de pacientes en los que se sospeche la infección por este agente. MÉTODOS: se evaluaron 3 de los métodos reportados internacionalmente para obtener ADN estándar en la construcción de curvas externas estándar, que permiten determinar el número de copias de ADN diana en la muestra problema. RESULTADOS: se obtuvieron 3 ADN estándar a partir del clonaje de un fragmento del gen ORF26 del herpesvirus humano 8 en un vector (ADN plasmídico), con la utilización de productos purificados de reacción en cadena de la polimerasa y el empleo de ADN genómico de la línea celular BCBL. Se pudieron construir las curvas patrón a partir de cada uno de los ADN estándar obtenidos, los que mostraron una fuerte correlación lineal (r= -1) y valores muy bajos de error a lo largo de 6 magnitudes de concentración de ADN diana. El límite inferior de detección a partir del ADN plasmídico y de los productos de reacción en cadena de la polimerasa fue de hasta 100 copias, mientras que con el ADN genómico fue de hasta 10 copias; este último sistema resultó el más sensible. CONCLUSIONES: la reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real normalizada a partir de los 3 ADN estándar probó ser un sistema rápido, específico y altamente sensible que permitirá un mejor diagnóstico y además desarrollar estudios sobre la patogenia de la infección por el herpesvirus humano 8 en Cuba.]]></p></abstract>
<abstract abstract-type="short" xml:lang="en"><p><![CDATA[OBJECTIVE: to standardize a real-time polymerase chain reaction system to determine the human herpes virus 8 viral load in several samples from patients suspected of this type of infection. METHODS: three internationally known methods were evaluated to obtain standard DNA in standard external curve constructions, which allow determining the number of target DNA copies in the suspected samples. RESULTS: three standards DNA were obtained from cloning ORF26 gene fragment of human herpesvirus 8 in a vector (plasmid DNA), with the use of purified polymerase chain reaction products and of genomic DNA of BCBL cell lines. The pattern curves were constructed on the basis of each of the resulting standard DNA, which showed strong linear correlation (r= -1) and very low error values throughout 6 target DNA concentrations. The lower detection limit based on plasmid DNA and the polymerase chain reaction products was 100 copies, whereas that obtained with genomic DNA reached up to 10 copies; this last system turned to be the most susceptible. CONCLUSIONS: real-time polymerase chain reaction system, standardized for the three standard DNA proved to be a rapid, specific and highly sensitive system for better diagnosis, and for the development of studies on the pathogenesis of human herpesvirus 8 infection in Cuba.]]></p></abstract>
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<kwd lng="es"><![CDATA[herpesvirus humano 8]]></kwd>
<kwd lng="es"><![CDATA[sarcoma de Kaposi]]></kwd>
<kwd lng="es"><![CDATA[reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real]]></kwd>
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</front><body><![CDATA[ <p align="right"><font size="2" face="Geneva, Arial, Helvetica, san-serif"><b><font face="Verdana">ART&Iacute;CULO    ORIGINAL</font></b></font></p>     <p>&nbsp;</p>     <p><font size="2" face="Verdana"><b><font size="4">Normalizaci&oacute;n de un    sistema de reacci&oacute;n en cadena de la polimerasa en tiempo real para la    cuantificaci&oacute;n del herpesvirus humano 8 </font></b></font></p>     <p>&nbsp; </p>     <P>      <P><font size="2" face="Verdana"><b><font size="3">Standardization of a real-time    polymerase chain reaction system for quantification of human herpesvirus 8 </font></b></font>     <P>&nbsp;     <P>&nbsp;      <P>      <P><b><font size="2" face="Verdana">Pedro Ariel Mart&iacute;nez Rodr&iacute;guez<SUP>I</SUP>;    Mayra Mun&eacute; Jim&eacute;nez<SUP>II</SUP>; Yudira Soto Brito<SUP>III</SUP>;    Rosa Ram&iacute;rez Bartutis<SUP>IV</SUP>; Consuelo Correa Sierra<SUP>V</SUP>;    Melkis Alfonso Castellanos<SUP>VI</SUP>; Vivian Kour&iacute; Cardell&aacute;<SUP>VII</SUP></font></b><font size="2" face="Verdana">    </font>      ]]></body>
<body><![CDATA[<P>      <P><font size="2" face="Verdana"><SUP>I</SUP> M&aacute;ster en Ciencias. Especialista    de I Grado en Microbiolog&iacute;a (Virolog&iacute;a). Laboratorio de Infecciones    de Transmisi&oacute;n Sexual, Departamento de Virolog&iacute;a, Instituto de    Medicina Tropical &quot;Pedro Kour&iacute;&quot; (IPK). Ciudad de La Habana,    Cuba.    <br>   </font><font size="2" face="Verdana"><SUP>II</SUP> Doctora en Ciencias. Licenciada    en Microbiolog&iacute;a. Instructora. Investigadora Titular. Laboratorio de    Biolog&iacute;a Molecular, Departamento de Virolog&iacute;a, IPK. Ciudad de    La Habana, Cuba.    <br>   </font><font size="2" face="Verdana"><SUP>III</SUP> M&aacute;ster en Ciencias.    Licenciada en Microbiolog&iacute;a. Investigadora Agregada. Laboratorio de Biolog&iacute;a    Molecular, Departamento de Virolog&iacute;a, IPK. Ciudad de La Habana, Cuba.    <br>   </font><font size="2" face="Verdana"><SUP>IV</SUP> M&aacute;ster en Ciencias.    Licenciada en Bioqu&iacute;mica. Investigadora Agregada. Profesora Agregada.    Laboratorio de Biolog&iacute;a Molecular, Departamento de Virolog&iacute;a,    IPK. Ciudad de La Habana, Cuba.    <br>   </font><font size="2" face="Verdana"><SUP>V</SUP> Especialista en Medicina General    Integral. Residente de la Especialidad Microbiolog&iacute;a (Virolog&iacute;a).    IPK. Ciudad de La Habana, Cuba.    <br>   </font><font size="2" face="Verdana"><SUP>VI</SUP> T&eacute;cnico en Farmacia    Industrial. Laboratorio de Biolog&iacute;a Molecular, Departamento de Virolog&iacute;a,    IPK. Ciudad de La Habana, Cuba.    <br>   </font><font size="2" face="Verdana"><SUP>VII</SUP> Doctora en Ciencias. Especialista    de II Grado en Microbiolog&iacute;a (Virolog&iacute;a). Investigadora Auxiliar.    Laboratorio de Infecciones de Transmisi&oacute;n Sexual, Departamento de Virolog&iacute;a,    IPK. Ciudad de La Habana, Cuba. </font>      <P>&nbsp;     <P>&nbsp;  <hr size="1" noshade>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><font size="2" face="Verdana"><B>RESUMEN </B></font></p>     <p><B> </B><font size="2" face="Verdana"><B>OBJETIVO</b>: normalizar un sistema    de reacci&oacute;n en cadena de la polimerasa en tiempo real para determinar    la carga viral del herpesvirus humano 8, en diferentes muestras cl&iacute;nicas    de pacientes en los que se sospeche la infecci&oacute;n por este agente. <B>    <br>   M&Eacute;TODOS</B>: se evaluaron 3 de los m&eacute;todos reportados internacionalmente    para obtener ADN est&aacute;ndar en la construcci&oacute;n de curvas externas    est&aacute;ndar, que permiten determinar el n&uacute;mero de copias de ADN diana    en la muestra problema. <B>    <br>   RESULTADOS</B>: se obtuvieron 3 ADN est&aacute;ndar a partir del clonaje de    un fragmento del gen ORF26 del herpesvirus humano 8 en un vector (ADN plasm&iacute;dico),    con la utilizaci&oacute;n de productos purificados de reacci&oacute;n en cadena    de la polimerasa y el empleo de ADN gen&oacute;mico de la l&iacute;nea celular    BCBL. Se pudieron construir las curvas patr&oacute;n a partir de cada uno de    los ADN est&aacute;ndar obtenidos, los que mostraron una fuerte correlaci&oacute;n    lineal (<I>r</I>= -1) y valores muy bajos de error a lo largo de 6 magnitudes    de concentraci&oacute;n de ADN diana. El l&iacute;mite inferior de detecci&oacute;n    a partir del ADN plasm&iacute;dico y de los productos de reacci&oacute;n en    cadena de la polimerasa fue de hasta 100 copias, mientras que con el ADN gen&oacute;mico    fue de hasta 10 copias; este &uacute;ltimo sistema result&oacute; el m&aacute;s    sensible. <B>    <br>   CONCLUSIONES</B>: la reacci&oacute;n en cadena de la polimerasa en tiempo real    normalizada a partir de los 3 ADN est&aacute;ndar prob&oacute; ser un sistema    r&aacute;pido, espec&iacute;fico y altamente sensible que permitir&aacute; un    mejor diagn&oacute;stico y adem&aacute;s desarrollar estudios sobre la patogenia    de la infecci&oacute;n por el herpesvirus humano 8 en Cuba. </font> </p> <B></B>      <P>      <P><font size="2" face="Verdana"><B>Palabras clave: </B>herpesvirus humano 8,    sarcoma de Kaposi, reacci&oacute;n en cadena de la polimerasa en tiempo real,    Cuba. </font> <hr size="1" noshade> <font size="2" face="Verdana"><B>ABSTRACT </B></font><B>      <P>  </B>      <P>&nbsp;     <P><font size="2" face="Verdana"><B>OBJECTIVE:</b> to standardize a real-time    polymerase chain reaction system to determine the human herpes virus 8 viral    load in several samples from patients suspected of this type of infection. <B>    ]]></body>
<body><![CDATA[<br>   METHODS:</B> three internationally known methods were evaluated to obtain standard    DNA in standard external curve constructions, which allow determining the number    of target DNA copies in the suspected samples. <B>    <br>   RESULTS:</B> three standards DNA were obtained from cloning ORF26 gene fragment    of human herpesvirus 8 in a vector (plasmid DNA), with the use of purified polymerase    chain reaction products and of genomic DNA of BCBL cell lines. The pattern curves    were constructed on the basis of each of the resulting standard DNA, which showed    strong linear correlation (<I>r</I>= -1) and very low error values throughout    6 target DNA concentrations. The lower detection limit based on plasmid DNA    and the polymerase chain reaction products was 100 copies, whereas that obtained    with genomic DNA reached up to 10 copies; this last system turned to be the    most susceptible. <B>    <br>   CONCLUSIONS:</B> real-time polymerase chain reaction system, standardized for    the three standard DNA proved to be a rapid, specific and highly sensitive system    for better diagnosis, and for the development of studies on the pathogenesis    of human herpesvirus 8 infection in Cuba. </font>      <P>      <P><font size="2" face="Verdana"><B>Key words</B>: human herpes virus 8, Karposi&#180;s    sarcoma, real-time polymerase chain reaction, Cuba. </font> <hr size="1" noshade>     <P>&nbsp;     <P>&nbsp;      <P>      <P>      <P>      ]]></body>
<body><![CDATA[<P>      <P>      <P>      <P>      <P>      <P><font size="3" face="Verdana"><B>INTRODUCCI&Oacute;N</B> </font>      <P>      <P><font size="2" face="Verdana">La determinaci&oacute;n de la carga viral ha    constituido un paso crucial, tanto para la interpretaci&oacute;n de los mecanismos    patog&eacute;nicos de m&uacute;ltiples infecciones virales como en el monitoreo    de la respuesta terap&eacute;utica. Representa uno de los mejores sistemas para    el diagn&oacute;stico de la infecci&oacute;n activa, especialmente cuando se    realiza en fluidos org&aacute;nicos.<SUP>1</SUP> Asimismo, constituye un marcador    esencial en el estudio de la infecci&oacute;n causada por los herpesvirus, en    contraste con el escaso significado cl&iacute;nico que tiene la determinaci&oacute;n    del t&iacute;tulo de anticuerpos (Acs) en la infecci&oacute;n por pat&oacute;genos    latentes.<SUP>2</SUP> </font>     <P><font size="2" face="Verdana">En la actualidad se reconoce el papel patog&eacute;nico    del herpesvirus humano 8 (Hvh-8) en todas las variantes cl&iacute;nico-epidemiol&oacute;gicas    del sarcoma de Kaposi (cl&aacute;sico, end&eacute;mico, iatrog&eacute;nico y    epid&eacute;mico), as&iacute; como su participaci&oacute;n en la g&eacute;nesis    del linfoma de efusi&oacute;n primario (LEP) y en la enfermedad multic&eacute;ntrica    de Castleman (EMC).<SUP>3</SUP> Por causa de las discrepancias en los resultados    obtenidos en diferentes estudios, uno de los desaf&iacute;os m&aacute;s importantes    que enfrentan los investigadores que se dedican al estudio de este agente, es    la obtenci&oacute;n de un m&eacute;todo diagn&oacute;stico validado, que favorezca    la comprensi&oacute;n de la infecci&oacute;n causada por este virus en diversas    zonas geogr&aacute;ficas. Se ha planteado que este m&eacute;todo representar&aacute;    un paso cr&iacute;tico, tanto para el control de su transmisi&oacute;n como    para lograr una mejor interpretaci&oacute;n de los resultados alcanzados. En    este sentido, <I>Parisi</I> y otros en 2007 propusieron la determinaci&oacute;n    de la carga viral como el mejor medio para el pesquisaje de la infecci&oacute;n    por el Hvh-8 en la sangre de donantes.<SUP>4</SUP> </font>      <P><font size="2" face="Verdana">En la reacci&oacute;n en cadena de la polimerasa    en tiempo real (RCP-TR), los procesos de amplificaci&oacute;n y detecci&oacute;n    se producen de manera simult&aacute;nea en el mismo tubo de reacci&oacute;n    sin necesidad de manipulaci&oacute;n posterior; se elimina el riesgo de liberaci&oacute;n    al ambiente de &aacute;cidos nucleicos amplificados que son responsables de    contaminaciones en la RCP convencional<I>.</I> El principio de esta herramienta    se basa en la transferencia de energ&iacute;a fluorescente mediante resonancia    (FRET: siglas del ingl&eacute;s <I>fluorescence resonance energy transfer</I>)    entre 2 fluorocromos adyacentes. Uno de los fluorocromos opera como donador    (del ingl&eacute;s <I>reporter</I>) emitiendo fluorescencia y el segundo fluorocromo    puede actuar como aceptor (del ingl&eacute;s <I>quencher</I>) absorbiendo la    energ&iacute;a del primero, o tambi&eacute;n funcionar como segundo donador    emitiendo la energ&iacute;a absorbida del primer donador a una longitud de onda    diferente.<SUP>5</SUP> </font>      ]]></body>
<body><![CDATA[<P><font size="2" face="Verdana">Se han implementado 2 estrategias para la cuantificaci&oacute;n    mediante RCP-TR, una permite la cuantificaci&oacute;n relativa y con la otra    se logra una cuantificaci&oacute;n absoluta. En la cuantificaci&oacute;n relativa    se emplean varios modelos matem&aacute;ticos que permiten conocer el grado de    expresi&oacute;n de un gen espec&iacute;fico, al comparar su nivel de expresi&oacute;n    con el de un gen de referencia. Por el contrario, mediante la cuantificaci&oacute;n    absoluta se logra conocer el n&uacute;mero de copias de &aacute;cidos nucleicos    (ADN o ARN) en la muestra problema, al compararse con est&aacute;ndares establecidos.    Para la puesta en marcha de este &uacute;ltimo m&eacute;todo, se utilizan diluciones    seriadas de ADN est&aacute;ndar con concentraci&oacute;n conocida, que se emplean    para la construcci&oacute;n de una curva est&aacute;ndar o patr&oacute;n contra    la que se comparar&aacute; la fluorescencia detectada en la muestra que se analiza.    Numerosas estrategias se han utilizado para obtener estos est&aacute;ndares,    entre los que se han informado est&aacute;n el clonaje del gen de inter&eacute;s    en un vector, el ADN gen&oacute;mico, los productos purificados de RCP, cepas    de virus cultivables con t&iacute;tulos conocidos o el empleo de oligonucle&oacute;tidos    sint&eacute;ticos.<SUP>6</SUP> </font>     <P><font size="2" face="Verdana">Hasta el momento, Cuba no contaba con t&eacute;cnicas    cuantitativas para el diagn&oacute;stico y monitoreo de la infecci&oacute;n    por el Hvh-8 en pacientes infectados con este virus. Por tanto, el colectivo    de autores se propuso normalizar una RCP-TR para determinar la carga viral de    este herpesvirus a trav&eacute;s de la plataforma <I>LightCycler</I> y, de esa    forma, introducir esta herramienta diagn&oacute;stica en el laboratorio de Infecciones    de Transmisi&oacute;n Sexual (ITS) del Departamento de Virolog&iacute;a del    Instituto de Medicina Tropical &quot;Pedro Kour&iacute;&quot; (IPK). Con la    finalidad de identificar el m&eacute;todo id&oacute;neo para la cuantificaci&oacute;n    del Hvh-8, se evaluaron 3 de los reportados internacionalmente para la construcci&oacute;n    de la curva est&aacute;ndar. </font>      <P>&nbsp;      <P>      <P><font size="3" face="Verdana"><B>M&Eacute;TODOS</B> </font>      <P>      <P><font size="2" face="Verdana"><I>Preparaci&oacute;n de los est&aacute;ndares    para RCP-TR</I> </font>     <P>      <P><font size="2" face="Verdana">Se procedi&oacute; a obtener ADN est&aacute;ndar    por 3 v&iacute;as: clonaje de un fragmento del gen ORF26 del Hvh-8 en un vector,<SUP>7</SUP>    productos purificados de RCP de este mismo fragmento<sup>8</sup> y ADN gen&oacute;mico    de la l&iacute;nea celular BCBL (BCBL: siglas del ingl&eacute;s <I>Body Cavity-Based    Lymphoma</I>) que se encuentra infectada de forma latente con el Hvh-8.<SUP>9</SUP>    </font>      <P><font size="2" face="Verdana"><I>Obtenci&oacute;n del ADN plasm&iacute;dico    (ADNp): </I>el fragmento de 111 pb del gen ORF26 que se amplific&oacute; mediante    RCP cualitativa se insert&oacute; en el vector <I>pTARGET<SUP>TM</SUP></I><SUP>    </SUP>(PROMEGA, EUA) y, posteriormente, fue clonado en c&eacute;lulas electrocompetentes    <I>XL blue.</I> De las posibles colonias transformantes que aparecieron, se    seleccionaron al azar 20 colonias blancas para ser sembradas en placas de LB    s&oacute;lido con ampicill&iacute;n. Al d&iacute;a siguiente, se les realiz&oacute;    extracci&oacute;n del ADN a los clones recombinantes, para eso se utiliz&oacute;    la metodolog&iacute;a descrita en el estuche de purificaci&oacute;n de ADNp    <I>Miniprep (Promega, EUA)</I>. La calidad del ADNp extra&iacute;do fue determinada    mediante corrida electrofor&eacute;tica en gel de agarosa 0,8 % en TBE 1x. Para    determinar las posibles colonias recombinantes, se realiz&oacute; RCP cualitativa    del gen ORF26 a 10 de las 20 colonias transformantes seleccionadas, con el mismo    protocolo que se emple&oacute; para la obtenci&oacute;n del fragmento de 111    pb del ORF26 del Hvh-8. Posteriormente, se determin&oacute; la concentraci&oacute;n    del ADNp extra&iacute;do de una de las colonias recombinantes en espectrofot&oacute;metro    (<I>GeneQuant II</I>, <I>Pharmacia Biotech, EUA</I>) a una densidad &oacute;ptica    (DO) de 260 nm. </font>      ]]></body>
<body><![CDATA[<P><font size="2" face="Verdana"><I>Obtenci&oacute;n de los productos de RCP del    gen ORF26: </I>5 &micro;L de ADN previamente extra&iacute;do de la l&iacute;nea    celular BCBL se sometieron a RCP cualitativa, para amplificar un fragmento de    111 pb del gen ORF26 del Hvh-8 con el empleo de los cebadores reportados por    <I>Watzinger</I> y otros.<SUP>7</SUP> La mezcla de la reacci&oacute;n conten&iacute;a:    10 mM de tamp&oacute;n de RCP; 25 mM de MgCl<SUB>2</SUB>; 25 mM de cada deoxinucle&oacute;tido    trifosfatado; 10 pmol de cada cebador (sentido positivo y sentido negativo)    y 2,5 U de enzima Taq polimerasa (Amplitaq, <I>Roche</I>). Los ciclos de amplificaci&oacute;n    se programaron de la forma siguiente: un ciclo de desnaturalizaci&oacute;n inicial    a 94 &#176;C por 4 min; seguido de 40 ciclos de repeticiones de 94 &#176;C por    1 min, 52 &#176;C para la hibridaci&oacute;n por 1 min y extensi&oacute;n a    72 &#176;C por 1 min. Mediante el protocolo de Purificaci&oacute;n <I>MiniElute<SUP>TM</SUP>    Purification Kit (Qiagen, EUA)</I> se purificaron los productos de RCP siguiendo    las instrucciones del fabricante. Posteriormente se determin&oacute; su concentraci&oacute;n    en espectrofot&oacute;metro (<I>GeneQuant II</I>, <I>Pharmacia Biotech, EUA</I>)    a una DO de 260 nm. </font>      <P><font size="2" face="Verdana"><I>Obtenci&oacute;n de ADN gen&oacute;mico (ADNg):    </I>200 &micro;L de la l&iacute;nea celular BCBL fueron sometidos a extracci&oacute;n    de ADNg por el estuche comercial <I>QIAamp<SUP>&#174;</SUP> DNA Mini Kit (QIAGEN,    EUA)</I>, seg&uacute;n las indicaciones del fabricante. El ADN obtenido se resuspendi&oacute;    en 100 &micro;L de tamp&oacute;n de elusi&oacute;n y se determin&oacute; su    concentraci&oacute;n en espectrofot&oacute;metro (<I>GeneQuant II</I>, <I>Pharmacia    Biotech, EUA</I>) a una DO de 260 nm. </font>     <P><font size="2" face="Verdana"><I>Cuantificaci&oacute;n de los ADN est&aacute;ndares    por RCP-TR: </I>se determin&oacute; el n&uacute;mero de copias de cada uno de    los est&aacute;ndares obtenidos en equipo el <I>LightCycler</I> 1.5 (<I>Roche    Diagnostics, </I>Alemania). Para ello se a&ntilde;adieron por triplicado 2 &micro;L    de cada est&aacute;ndar a capilares que conten&iacute;an una mezcla compuesta    por 3 &micro;L de H<SUB>2</SUB>O, 4 &micro;L de mezcla universal de RCP (<I>Roche</I>    <I>Diagnostics, </I>Alemania), 300 nM y 200 nM de oligonucle&oacute;tidos y    sonda, respectivamente. La secuencia de los cebadores y de la sonda fue reportada    previamente por <I>Watzinger</I> y otros,<SUP>7</SUP> pero a diferencia del    marcaje con TAMRA (carboxitetrametilrodamina) en el extremo 3' utilizado por    estos autores, la sonda empleada en el presente estudio posee un ligando del    surco menor en el extremo 3' (MGB: siglas del ingl&eacute;s <I>minor groove    binder</I>). Los par&aacute;metros del ciclaje fueron los siguientes: 95 &#176;C    por 10 min y 50 ciclos compuestos por: 95 &#176;C por 15 s, 60 &#176;C por 1    min y 72 &#176;C durante 1 s. </font>      <P><font size="2" face="Verdana">Conocido el punto de corte (Cp) de cada uno de    los ADN est&aacute;ndares, se procedi&oacute; a importar la curva externa patr&oacute;n    previamente construida con el estuche comercial <I>artus<SUP>&#174;</SUP>CMV    LC PCR</I> <I>kit</I> (<I>Roche</I> <I>Diagnostics, </I>Alemania; rango de detecci&oacute;n:    10<SUP>4</SUP> - 10 copias/&micro;L). Para la construcci&oacute;n de esta curva    se siguieron las instrucciones del fabricante y se emple&oacute; el m&eacute;todo    de la derivaci&oacute;n secundaria m&aacute;xima (SDMM: siglas del ingl&eacute;s    <I>second derivative maximum method</I>) de la versi&oacute;n 3.3 del programa    del <I>LightCycler</I>. </font>      <P>      <P><font size="2" face="Verdana"><I>Confecci&oacute;n de las curvas est&aacute;ndares</I>    </font>     <P>      <P><font size="2" face="Verdana">Una vez conocido el n&uacute;mero de copias de    los diferentes est&aacute;ndares obtenidos (ADNp, productos purificados de RCP    y ADNg) se procedi&oacute; a la confecci&oacute;n de 3 curvas est&aacute;ndares    a partir de cada uno de ellos. Para esto se realizaron diluciones seriadas en    base 10 en H<SUB>2</SUB>0 libre de ARNasa-ADNasas de los 3 productos (desde    10<SUP>6</SUP> copias de virus/&micro;L hasta 10 copias de virus/&micro;L).    Se a&ntilde;adieron 3 r&eacute;plicas de cada una de las diluciones de los productos    est&aacute;ndares a capilares que conten&iacute;an 15 &#181;L de una mezcla    formada por: 3 &micro;L de H<SUB>2</SUB>O, 4 &micro;L de mezcla universal    de RCP (<I>Roche</I>), 300 nM y 200 nM de oligonucle&oacute;tidos y sonda, respectivamente.    Los par&aacute;metros del ciclaje fueron los siguientes: 95 &#176;C por 10 min    y 50 ciclos compuestos por 95 &#176;C durante 15 s, 60 &#176;C por 1 min y 72    &#176;C durante 1 s. Al finalizar el &uacute;ltimo ciclo, por medio de an&aacute;lisis    de regresi&oacute;n lineal, el programa del <I>LightCycler</I> produce un gr&aacute;fico    de la curva est&aacute;ndar en el que relaciona la concentraci&oacute;n logar&iacute;tmica    (eje x) con el Cp de cada uno de los est&aacute;ndares (eje y), con 95 % de    intervalo de confianza. Cada uno de los ADN est&aacute;ndares obtenidos fueron    trabajados por separado en d&iacute;as diferentes. En el presente estudio se    utilizaron los valores medios de los Cp de cada una de las r&eacute;plicas para    la construcci&oacute;n de las curvas externas est&aacute;ndares, con empleo    del modo aritm&eacute;tico del m&eacute;todo SDMM del programa del <I>LightCycler</I>    (versi&oacute;n 3.3). Posteriormente, se exportaron y archivaron las curvas    en el equipo. </font>     <P>      <P><font size="2" face="Verdana"><I>An&aacute;lisis estad&iacute;stico</I> </font>     ]]></body>
<body><![CDATA[<P>      <P><font size="2" face="Verdana">Para la selecci&oacute;n del mejor m&eacute;todo    para determinar la carga viral del Hvh-8 se tuvieron en cuenta varios par&aacute;metros,    algunos de ellos se calculan de manera autom&aacute;tica por el programa del    <I>LightCycler</I> (versi&oacute;n 3.3), dentro ellos est&aacute;n: </font>     <P><font size="2" face="Verdana"><I>Pendiente de la curva (Slope): </I>se utiliza    para evaluar la eficiencia de la reacci&oacute;n. Seg&uacute;n las recomendaciones    del fabricante para lograr una eficiencia de la curva est&aacute;ndar entre    1,5 y 2,2, su valor debe estar entre 5,7 y 2,9. </font>     <P><font size="2" face="Verdana"><I>Error</I>: se&ntilde;ala las variaciones entre    capilar y capilar (ejemplo, por errores al pipetear). Un valor de 0,6 corresponde    a una desviaci&oacute;n del valor x (concentraci&oacute;n) de hasta 50 %. </font>     <P><font size="2" face="Verdana"><I>Intercepto (Intercept):</I> se utiliza para    evaluar la sensibilidad de la reacci&oacute;n de la RCP-TR, mientras menor sea    el valor del Cp en la ecuaci&oacute;n de regresi&oacute;n mayor ser&aacute;    la sensibilidad del sistema. </font>     <P><font size="2" face="Verdana"><I>r: c</I>oeficiente de regresi&oacute;n. Ofrece    un control de la adecuada distribuci&oacute;n lineal de la curva. Se&ntilde;ala    posibles errores sistem&aacute;ticos (<I>ejemplo,</I> error acumulado en las    diluciones seriadas). </font>     <P><font size="2" face="Verdana">Tambi&eacute;n se estableci&oacute; el l&iacute;mite    de detecci&oacute;n de la RCP-TR normalizada, se identific&oacute; la &uacute;ltima    diluci&oacute;n en la que el sistema fue capaz de detectar el ADN diana en el    mismo Cp para 100 % de todas las r&eacute;plicas. Adem&aacute;s, para evaluar    la especificidad del ensayo y descartar posibles falsos positivos se someti&oacute;    a amplificaci&oacute;n el ADN previamente extra&iacute;do de 3 cepas: citomegalovirus    humano (CMVh; AD169, ATCC), virus de la varicela zoster (VVZ; aislamiento cl&iacute;nico,    Laboratorio de ITS, Virolog&iacute;a, IPK) y virus del herpes simple 2 (VHS-2,    aislamiento cl&iacute;nico, Laboratorio de ITS, Virolog&iacute;a, IPK). </font>      <P>&nbsp;      <P>      <P><font size="3" face="Verdana"><B>RESULTADOS</B> </font>      ]]></body>
<body><![CDATA[<P>      <P><font size="2" face="Verdana">A trav&eacute;s del presente estudio se obtuvieron    3 tipos de ADN est&aacute;ndares. En primer lugar, se logr&oacute; satisfactoriamente    el clonaje del gen ORF26 en el vector <I>pTARGET<SUP>TM</SUP></I><SUP> </SUP>en    c&eacute;lulas electrocompetentes <I>XL blue</I>. Por medio de la RCP cualitativa    del gen ORF26 realizado al ADNp de 10 colonias transformantes seleccionadas    se comprob&oacute; que en 9 de ellas se amplific&oacute; el fragmento clonado    del genoma del Hvh-8 (<a href="/img/revistas/mtr/v61n2/f0103209.jpg" target="_blank">Fig. 1A</a>), por    lo que el porcentaje de positividad de las colonias recombinantes fue de 45    %. El ADNp purificado de una de las colonias tuvo una DO de 0,044 (22 ng de    ADN/&#181;L) y por medio de RCP-TR se determin&oacute; que su n&uacute;mero    de copias fue de 3,7 x 10<SUP>7</SUP> copias/&micro;L.</font>      
<P><font size="2" face="Verdana">Se obtuvieron adem&aacute;s los productos purificados    de RCP del gen ORF26 (<a href="/img/revistas/mtr/v61n2/f0103209.jpg" target="_blank">Fig. 1B</a>) con    una DO de 0,016 (40 ng ADN/&#181;L) y mediante RCP-TR se identific&oacute; que    ten&iacute;a 5,5 x 10<SUP>9</SUP> copias/&micro;L. Por &uacute;ltimo, se lograron    obtener 4,7 x 10<SUP>6</SUP> copias/&micro;L de ADNg de la l&iacute;nea celular    BCBL para utilizar como ADN est&aacute;ndar (DO= 0,040 [20 ng de ADN/&#181;L]).    </font>      
<P><font size="2" face="Verdana">Los resultados de la corrida de los ADN est&aacute;ndares    en la RCP-TR mostraron una fuerte correlaci&oacute;n lineal (r= -1), con valores    muy bajos de error a lo largo de 6 magnitudes de concentraci&oacute;n de ADN    diana en cada una de las curvas est&aacute;ndares construidas (<a href="/img/revistas/mtr/v61n2/f0203209.gif" target="_blank">Fig.    2</a>). Con esto se denota la confiabilidad de los 3 est&aacute;ndares obtenidos    y su utilidad para ser empleados en la cuantificaci&oacute;n del Hvh-8 en diferentes    muestras cl&iacute;nicas. </font>      
<P><font size="2" face="Verdana">Cuando se evalu&oacute; el l&iacute;mite inferior    de detecci&oacute;n del sistema de RCP-TR normalizado, se encontr&oacute; que    con las curvas est&aacute;ndares construidas a partir del ADNp y de los productos    purificados de RCP el sistema, fue capaz de detectar hasta 100 copias en 100    % de las r&eacute;plicas en la diluci&oacute;n que conten&iacute;a 10<SUP>2</SUP>    copias/&micro;L. Por el contrario, con la curva est&aacute;ndar construida a    partir del ADNg se estableci&oacute; un l&iacute;mite de detecci&oacute;n de    hasta 10 copias, pues se detect&oacute; el mismo valor de Cp en las 3 r&eacute;plicas    de esta concentraci&oacute;n (<a href="/img/revistas/mtr/v61n2/f0303209.gif" target="_blank">Fig. 3</a>).    </font>      
<P><font size="2" face="Verdana">La RCP-TR normalizada prob&oacute; ser muy espec&iacute;fica    para la cuantificaci&oacute;n del Hvh-8, porque no se detect&oacute; un incremento    por encima del umbral de fluorescencia en los capilares que conten&iacute;an    ADN extra&iacute;do de las cepas de CMVh, VHS-2 y VVZ. </font>     <P>&nbsp;      <P>      <P><font size="3" face="Verdana"><B>DISCUSI&Oacute;N</B> </font>      <P>      ]]></body>
<body><![CDATA[<P><font size="2" face="Verdana">Uno de los pasos fundamentales para lograr la    puesta en marcha de la RCP-TR es la obtenci&oacute;n de los productos est&aacute;ndares.    Hasta el momento no se cuenta con ADN est&aacute;ndares universales que permitan    estandarizar este sistema al nivel mundial. Es por ello que la inmensa mayor&iacute;a    de los ensayos que se han dise&ntilde;ado se normalizan en los laboratorios    encargados del diagn&oacute;stico, a los que se les reconoce en la literatura    como RCP-TR caseros.<SUP>10 </SUP>Seg&uacute;n han planteado <I>Watzinger</I>    y otros, estos m&eacute;todos son la &uacute;nica alternativa con la que se    podr&aacute; contar en un futuro pr&oacute;ximo para la cuantificaci&oacute;n    de muchos agentes de relevancia cl&iacute;nica.<SUP>11</SUP> </font>     <P><font size="2" face="Verdana">De esta forma, los 3 productos obtenidos en el    presente estudio representan una importante fuente reproducible de ADN est&aacute;ndar    para la puesta en marcha de la RCP-TR en el laboratorio de ITS del IPK, en Cuba.    Algunos autores han se&ntilde;alado que la producci&oacute;n de productos estables    para la cuantificaci&oacute;n por RCP-TR es un proceso muy dif&iacute;cil, tanto    por el tiempo que consume su producci&oacute;n como por la dificultad en su    cuantificaci&oacute;n.<SUP>12</SUP> No obstante, los m&eacute;todos de obtenci&oacute;n    de ADN est&aacute;ndar empleados en el presente estudio han sido utilizados    por otros autores.<SUP>7-9</SUP> </font>     <P><font size="2" face="Verdana">Hist&oacute;ricamente, las curvas est&aacute;ndar    han sido el m&eacute;todo de elecci&oacute;n para determinar la concentraci&oacute;n    absoluta de ADN. <I>Larionov</I> y otros han afirmado que cuando se utilizan    buenas pr&aacute;cticas de laboratorio es f&aacute;cil obtener curvas est&aacute;ndares    de suficiente calidad, siempre que se incluya un adecuado n&uacute;mero y rango    de diluciones de productos est&aacute;ndares.<SUP>13</SUP> No obstante, algunos    autores han cuestionado la posibilidad de utilizar curvas est&aacute;ndares    externas en la cuantificaci&oacute;n por RCP-TR porque, seg&uacute;n ellos,    este m&eacute;todo sufre de variaciones intercapilares que son incontrolables    y no monitoreables.<SUP>14</SUP> Sin embargo, <I>Niesters</I> en 2001 demostr&oacute;    la existencia de pocas variaciones en los par&aacute;metros de las curvas est&aacute;ndares,    construidas durante 55 corridas sucesivas para la determinaci&oacute;n de la    carga viral del CMVh.<SUP>15</SUP> En concordancia con ello, <I>Kuhne</I> y    <I>Oschmann </I>demostraron la factibilidad de importar las curvas est&aacute;ndares    en diferentes corridas realizadas con equipos <I>LightCycler</I>.<SUP>16</SUP>    </font>      <P><font size="2" face="Verdana">No existe hasta el momento un m&eacute;todo consenso    para la evaluaci&oacute;n de las curvas est&aacute;ndar. El m&eacute;todo que    con mayor frecuencia se utiliza para evaluar la eficiencia de la RCP-TR se basa    en el valor de la pendiente de la curva est&aacute;ndar.<SUP>17 </SUP>Se ha    se&ntilde;alado por varios autores que el valor ideal de eficiencia se logra    cuando este par&aacute;metro es igual a 3,33.<SUP>18</SUP> Por otra parte, algunos    autores han descrito que la sensibilidad de la RCP-TR puede evaluarse por medio    del valor del intercepto de la curva est&aacute;ndar, para esto recomiendan    que en la medida en que el valor de este par&aacute;metro sea menor, se logra    una mayor sensibilidad.<SUP>19-21</SUP> </font>     <P><font size="2" face="Verdana">Teniendo en cuenta estas consideraciones, se    decidi&oacute; evaluar las curvas est&aacute;ndares construidas sobre la base    del valor de la pendiente de la curva y del intercepto. De esta forma, se puede    plantear que la curva patr&oacute;n obtenida a partir del ADNg mostr&oacute;    una mayor sensibilidad, pues con ella se obtuvo el menor valor de intercepci&oacute;n    (Fig. 2). Sin embargo, con la curva construida a partir de los productos de    RCP y la del ADNg se obtuvieron los valores m&aacute;s cercanos al valor de    la pendiente de la curva, que se ha reportado por otros autores como de m&aacute;xima    eficiencia de amplificaci&oacute;n (<I>pendiente de la curva</I> -3,33).<SUP>18</SUP>    </font>      <P><font size="2" face="Verdana">Se ha descrito por varios autores que concentraciones    muy bajas o muy altas de productos est&aacute;ndares pueden afectar la relaci&oacute;n    lineal del Cp en la curva est&aacute;ndar. Es por ello que <I>Ellison</I> y    otros han recomendado que en la construcci&oacute;n de una curva est&aacute;ndar    se incluyan solo aquellos est&aacute;ndares en los que todas las r&eacute;plicas    posean un valor detectable por el sistema, as&iacute; se evita el problema inherente    al trabajo con soluciones de baja concentraci&oacute;n de &aacute;cidos nucleicos.<SUP>22</SUP>    Adem&aacute;s, <I>Niesters</I> en 2001 plante&oacute; que con una concentraci&oacute;n    inferior a 1 000 copias, es cuestionable c&oacute;mo una diferencia de 10 veces    este valor tenga cierta importancia cl&iacute;nica.<SUP>15</SUP> </font>      <P><font size="2" face="Verdana">Al comparar los diferentes par&aacute;metros    de las curvas est&aacute;ndares construidas en el presente trabajo con los obtenidos    por los autores del protocolo original,<SUP>7</SUP> se encontr&oacute; que los    valores m&aacute;s cercanos en la eficiencia de la reacci&oacute;n y el coeficiente    de regresi&oacute;n alcanzados por estos investigadores (<I>pendiente de la    curva</I>= - 3,547, <I>r</I>= 0,999) se lograron con la curva construida a partir    del ADNg (<I>slope</I>= - 3,528; <I>r</I>= -1) (Fig. 1). Sin embargo, con nuestra    curva se logr&oacute; una mayor sensibilidad (<I>intercepto </I>= 35,15) en    comparaci&oacute;n con el valor de intercepci&oacute;n obtenido en la curva    est&aacute;ndar de estos autores (<I>intercepto </I>= 39,34). Esta diferencia    se pens&oacute; que se deba al efecto del marcaje con el MGB en el dise&ntilde;o    de la sonda, que seg&uacute;n se ha reconocido por varios autores garantiza    una uni&oacute;n mucho m&aacute;s espec&iacute;fica y estable a la secuencia    del ADN diana.<SUP>23</SUP> Teniendo en cuenta los buenos resultados obtenidos    con esta curva est&aacute;ndar y por permitir detectar un menor n&uacute;mero    de copias de secuencias dianas (10 copias de ADN), se decidi&oacute; seleccionar    el ADNg como ADN est&aacute;ndar para cuantificar el Hvh-8 en diferentes muestras    cl&iacute;nicas de pacientes con sospecha de infecci&oacute;n por este herpesvirus.    </font>     <P><font size="2" face="Verdana">El hecho de que no se detectara fluorescencia    en los capilares que conten&iacute;an ADN extra&iacute;do de las cepas de CMVh,    VHS-2 y VVZ justifica lo planteado por los autores que dise&ntilde;aron la sonda    y los cebadores utilizados para normalizar este sistema de RCP-TR, quienes demostraron    que estos no pose&iacute;an reactividad cruzada con el genoma de ning&uacute;n    otro pat&oacute;geno ni con alguna secuencia de ADN humano.<SUP>7</SUP> </font>     <P><font size="2" face="Verdana">Por todos los resultados obtenidos y en concordancia    con lo reportado por diferentes autores que han utilizado la plataforma <I>LightCycler</I>,<SUP>18,24</SUP>    se pudo normalizar un sistema de RCP-TR r&aacute;pido, espec&iacute;fico y altamente    sensible para la cuantificaci&oacute;n del Hvh-8. La incorporaci&oacute;n de    este sistema al flujograma diagn&oacute;stico del Laboratorio de ITS del Departamento    de Virolog&iacute;a del IPK significar&aacute; en un salto cualitativo, no solo    para el diagn&oacute;stico de la infecci&oacute;n por este herpesvirus, sino    tambi&eacute;n en el monitoreo de la respuesta terap&eacute;utica. Adem&aacute;s    se podr&aacute; emplear en estudios sobre la patogenia de la infecci&oacute;n    por este virus oncog&eacute;nico. </font>      <P>&nbsp;      ]]></body>
<body><![CDATA[<P>      <P><font size="3" face="Verdana"><B>AGRADECIMIENTOS</B> </font>      <P>      <P><font size="2" face="Verdana">Al doctor Ulrich Hengge de la Universidad de    D&uuml;serdolf, Alemania, por la donaci&oacute;n del equipo <I>Lightcycler 1.5    </I>al<I> </I>Departamento de Virolog&iacute;a del IPK. </font>     <P>&nbsp;      <P>      <P><font size="2" face="Verdana"><B><font size="3">REFERENCIAS BIBLIOGR&Aacute;FICAS</font></B>    </font>      <P>      <!-- ref --><P><font size="2" face="Verdana">1. Bakker NA, Verschuuren EA, Veeger NJ, van    der Bij W, van Imhoff GW, Kallenberg CG, et al. Quantification of Epstein-Barr    virus-DNA load in lung transplant recipients: a comparison of plasma versus    whole blood. J Heart Lung Transplant. 2008;27(1):7-10. </font>    <!-- ref --><P><font size="2" face="Verdana">2. Wada K, Kubota N, Ito Y, Yagasaki H, Kato    K, Yoshikawa T, et al. Simultaneous quantification of Epstein-Barr virus, cytomegalovirus,    and human herpesvirus 6 DNA in samples from transplant recipients by multiplex    real-time PCR assay. J Clin Microbiol. 2007;45(5):1426-32. </font>    <!-- ref --><P><font size="2" face="Verdana">3. Hengge UR, Ruzicka T, Tyring SK, Stuschke    M, Roggendorf M, Schwartz RA, et al. Update on Kaposi's sarcoma and other HHV8    associated diseases. Part 1: epidemiology, environmental predispositions, clinical    manifestations, and therapy. Lancet Infect Dis. 2002;2(5):281-92. </font>    <!-- ref --><P><font size="2" face="Verdana">4. Parisi SG, Cruciani M, Palu G. Transmission    of human herpesvirus 8 by blood transfusion. N Engl J Med. 2007;356(1):87-9.    </font>    <!-- ref --><P><font size="2" face="Verdana">5. Espy MJ, Uhl JR, Sloan LM, Buckwalter SP,    Jones MF, Vetter EA, et al. Real-time PCR in clinical microbiology: applications    for routine laboratory testing. Clin Microbiol Rev. 2006;19(1):165-256. </font>    <!-- ref --><P><font size="2" face="Verdana">6. Valasek MA, Repa JJ. The power of real-time    PCR. Adv Physiol Educ. 2005;29(3):151-9. </font>    <!-- ref --><P><font size="2" face="Verdana">7. Watzinger F, Suda M, Preuner S, Baumgartinger    R, Ebner K, Baskova L, et al. Real-time quantitative PCR assays for detection    and monitoring of pathogenic human viruses in immunosuppressed pediatric patients.    J Clin Microbiol. 2004;42(11):5189-98. </font>    <!-- ref --><P><font size="2" face="Verdana">8. Rose'Meyer RB, Mellick AS, Garnham BG, Harrison    GJ, Massa HM, Griffiths LR. The measurement of adenosine and estrogen receptor    expression in rat brains following ovariectomy using quantitative PCR analysis.    Brain Res Brain Res Protoc. 2003;11(1):9-18. </font>    <!-- ref --><P><font size="2" face="Verdana">9. Yun JJ, Heisler LE, Hwang, II, Wilkins O,    Lau SK, Hyrcza M, et al. 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