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Revista de Protección Vegetal

On-line version ISSN 2224-4697

Abstract

ARANA LABRADA, Franklyn et al. Desarrollo de un método para el diagnóstico específico del PepMoV basado en la RT-PCR. Rev. Protección Veg. [online]. 2016, vol.31, n.1, pp. 20-28. ISSN 2224-4697.

El objetivo de este trabajo fue desarrollar un método para el diagnóstico específico del PepMoV basado en laRT-PCR. Se diseñaron cebadores utilizando como referencia la secuencia genómica del aislado de la Florida, para amplificar un fragmento del extremo 5' no traducible y amino terminal de la proteína P1 del genoma. Se utilizó el programa Oligo (versión 7.4) para realizar el análisis in silico y establecer los parámetros iniciales de la reacción. Se evaluaron la temperatura óptima de hibridación de cebadores, la concentración de cebadores, el límite de detección, la repetitividad intraensayo e interensayo y la especificidad analítica. La temperatura óptima de hibridación de los cebadores fue de 59°C; se seleccionó como concentración óptima de los cebadores 0,32 µM. Los aspectos evaluados del ensayo permitieron establecer las condiciones óptimas de la técnica. La RT-PCR se comportó con alta especificidad para el diagnóstico de PepMoV; este mostró un límite de detección de 94 pg.µl-1. La herramienta molecular obtenida permitirá apoyar los programas de mejoramiento genético y de manejo integrado del cultivo en el país.

Keywords : RT-PCR; potyvirus; PepMoV; pimiento.

        · abstract in English     · text in Spanish     · Spanish ( pdf )

 

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