Abstract

REZENDE, F.M et al. Identificación de las regiones genómicas relacionadas con el contenido de lípidos y colesterol en bovinos. Cuban J. Agric. Sci. [online]. 2015, vol.49, n.4, pp.471-475. ISSN 0864-0408.

El objetivo de este estudio fue identificar las regiones genómicas que tienen asociación potencial con el contenido de lípidos y colesterol de la carne de ganado vacuno Nellore. Se obtuvieron fenotipos de 615 toros Nellore, de acuerdo con los métodos descritos por Bligh y Dyer (1959) y Saldanhaet al. (2004). Los datos de 658 toros Nellore genotipados se utilizaron para estudios de asociación a través del método ssGWAS. Estos animales se genotiparon con Illumina Bovine beadchip HD® (777 962 SNP) o GeneSeek GGPi (74 153 SNP).Sobre la base de otra población de Nellore genotipada por Illumina beadchip BovineHD®, los genotipos se determinaron con el software FImpute. Después del control de calidad (MAF <2% y call rate <90%), se utilizaron 535 824 SNP en cromosomas autosomales para el análisis de asociación. Los análisis de paso simple se realizaron utilizando un pedigrí compuesto por 4065 animales con el programa BLUPf90, considerando ventanas de 10 indicadores para estimar sus efectos. Este procedimiento posibilita la identificación de regiones asociadas al contenido de colesterol y lípidos por cromosoma. Los resultados de esta investigación demostraron regiones en los cromosomas 5, 10, 12, 23 y 29 relacionadas con el contenido de lípidos, y regiones en los cromosomas 3, 10, 11, 12 13, 17 y 18 relacionadas a la deposición de colesterol

Keywords : GWAS; Nellore; calidad de la carne; SNP.

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