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Revista Cubana de Ciencias Informáticas

On-line version ISSN 2227-1899

Abstract

QUINTANA, Silverio Andrés; MARIA GROSSI, Cecilia Eugenia; ESPINOZA, Rodrigo  and  ULLOA, Rita. Plantico, un paquete en R para análisis estadístico de variables biométricas de plantas. Rev cuba cienc informat [online]. 2021, vol.15, n.4, pp. 45-60.  Epub Dec 01, 2021. ISSN 2227-1899.

Los estreses abióticos y bióticos impactan negativamente en el desarrollo de las plantas afectando diferentes parámetros biométricos (por ejemplo, la longitud del vástago o de la raíz) que pueden medirse a distintos tiempos de aplicado el estrés. Sin embargo, es fundamental realizar un adecuado análisis estadístico de los datos numéricos obtenidos para evaluar el efecto del estrés sobre la planta. Por este motivo, a través del uso del lenguaje R, se creó el paquete denominado “Plantico” que realiza el análisis de la varianza (ANOVA) y somete los datos a la prueba de Tukey. Además, permite obtener las gráficas de barra, de puntos, y diagrama de caja para los “t” días del ensayo. Para validar la utilidad del paquete se determinó la longitud de la raíz de plántulas de Arabidopsis crecidas en condiciones control (MS 0,5x) o expuestas a estrés salino (MS 0,5x +75 mM NaCl) u osmótico (MS 0,5x +100 mM manitol) durante 7 días. El análisis estadístico de los datos obtenidos y los gráficos correspondientes se procesaron con Plantico. Esta herramienta puede ser descargada y utilizada de manera gratuita y puede configurarse para incluir otras variables biométricas o diferentes tiempos de estudio. Plantico facilita el análisis estadístico y la visualización de los datos experimentales.

Keywords : lenguaje R; Plantico; análisis estadístico; parámetros biométricos.

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